| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,761,360 | T→A | 6.0% | L119Q (CTG→CAG) | gpmI → | 2,3‑bisphosphoglycerate‑independent phosphoglycerate mutase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,761,360 | 0 | T | A | 6.0% | 415.2 / 14.2 | 133 | L119Q (CTG→CAG) | gpmI | 2,3‑bisphosphoglycerate‑independent phosphoglycerate mutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/55); new base A (4/4); total (74/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.20e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CTCGGCGCAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACTGC > NC_002947/5761215‑5761509 | gcgcAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAtg < 1:1946723/150‑1 (MQ=255) cAGCTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAtggtg < 1:1229675/150‑1 (MQ=255) gTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACAAACGCCATACGGAGAGATGAGAGCAACTAAAACCCAGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGgtggtg > 1:58053/1‑150 (MQ=255) tCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGCCTGCTGTCCGATGGTGgtgt > 1:433964/1‑150 (MQ=255) gcgTCGTGTATGAAGAATTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTTGAAAACCAAGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTac > 2:910219/1‑150 (MQ=255) gcgTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTac > 1:2440612/1‑150 (MQ=255) gcgTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCATCGGACAGCAGTCCGaggat > 2:1732879/1‑139 (MQ=255) tcgtGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTAcaca > 1:1532501/1‑150 (MQ=255) gtgtATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTTGCAAGGCCGTGCACATCCTCCAACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGc < 1:2859891/150‑1 (MQ=255) cgtggcggggtgtcgcggccatcgaggaaggcgtgcaggtagatcttttcagcgccacgctgggcggccagttcggccatggccaccaagtggtcctggtGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGccacc > 1:2556397‑M1/101‑150 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGActgct > 1:845499/1‑123 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGccacca > 2:2850567/1‑150 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCATCGGACAGCAGTCCGagga > 2:1279157/1‑129 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCATCGGACAGCAGTCCGagga < 1:1279157/132‑4 (MQ=255) cAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAg < 1:2850567/150‑1 (MQ=255) ggACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGa > 2:1829123/1‑150 (MQ=255) cTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCa > 1:1032084/1‑150 (MQ=255) ttCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCAc < 2:1829919/150‑1 (MQ=255) ttCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCAc > 2:1478582/1‑150 (MQ=255) aCGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTATTCGACAACCCGGTACTGACCGGCGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTtg < 2:342458/150‑1 (MQ=255) tGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTCGAACCACTCGGACTGCTGTCCGATGGAGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCa > 1:30799/1‑150 (MQ=255) aCCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGGGCTGTGGACAAGGCAGTCGGGGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGCACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATg > 2:447016/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATgg < 1:201760/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCTGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCa < 2:1491587/146‑1 (MQ=255) cAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGc > 2:3013651/1‑150 (MQ=255) aGGCCATCCGCGAGGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCg < 1:2156838/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGActgct > 1:579160/1‑100 (MQ=255) aGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGActgct < 2:579160/100‑1 (MQ=255) aGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTACTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGATGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCg > 2:984940/1‑150 (MQ=255) gCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGaa > 1:2262626/1‑150 (MQ=255) cATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCAt > 1:2513345/1‑141 (MQ=255) cATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCAt < 2:2513345/141‑1 (MQ=255) tCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTgg < 2:2773947/150‑1 (MQ=255) tCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTgg < 2:2753032/150‑1 (MQ=255) cgcgACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGgcc < 1:96897/150‑1 (MQ=255) gcgACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGgccg > 2:263225/1‑150 (MQ=255) gACGGCGAGGTGTTCGAAAACCCGGTAATGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCATGCACATCCTAGGACTGCTGTCAGATGGTGGTGTACACTCCTTCCGGGACCAGTTGGTGGCCATGGCCGAACTGgccccc > 2:1023010/1‑150 (MQ=255) cGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCa < 1:1829123/150‑1 (MQ=255) cGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCg < 2:1079459/150‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGActgct < 1:1713731/81‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAtggtg < 2:2824913/92‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTgg > 2:2448042/1‑150 (MQ=255) ttcttcGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAAGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGgc > 1:2647312/1‑150 (MQ=255) ttcGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCt > 2:3062354/1‑150 (MQ=255) ttcGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCt > 1:986818/1‑150 (MQ=255) ttcGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCt > 1:1498166/1‑150 (MQ=255) ttcGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCATCGGACAGCAGTCCGagga > 2:274513/1‑83 (MQ=255) ttcGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCATCGGACAGCAGTCCGagga < 1:274513/86‑4 (MQ=255) gAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGaa > 2:1068292/1‑150 (MQ=255) gAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGaa > 1:528228/1‑150 (MQ=255) gAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACAGCAGTCCGaggat > 2:1039134/1‑80 (MQ=255) gAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACAGCAGTCCGaggat < 1:1039134/84‑5 (MQ=255) aaaCCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGaaaa < 1:1297266/150‑1 (MQ=255) cccGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGAt > 1:831090/1‑150 (MQ=255) cccGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGAt < 1:3017879/150‑1 (MQ=255) cacgctgggcggccagttcggccatggccaccaagcggtcctggtGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAg < 2:2009613‑M1/52‑1 (MQ=255) ccGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACt < 2:2341058/103‑1 (MQ=255) ccGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACt > 1:2341058/1‑103 (MQ=255) gACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGActgct > 1:1414303/1‑60 (MQ=255) gACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGActgct < 2:1414303/60‑1 (MQ=255) aCCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGa < 1:303244/139‑1 (MQ=255) aCCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCAATGGCTGAACTGGCCGCCGGGCGTGGAGCTGAGAAGATCTACCTGCAc > 1:780890/1‑150 (MQ=255) cgttGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGc > 2:2265526/4‑150 (MQ=255) cGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGgcgc > 1:1836784/1‑129 (MQ=255) gTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACt < 1:563536/90‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCt < 2:831090/150‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGACGCCCAGCGTg < 1:1035015/123‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGAAAAGGCAGGCTGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTGCGATGGTGGTGTCCACAGCCCCCAGGGCCACCTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCt < 2:1340714/150‑1 (MQ=255) tgtgGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCt > 2:1726750/1‑150 (MQ=255) tgtgGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCt < 2:2299199/150‑1 (MQ=255) tgtgGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCt > 1:3010812/1‑150 (MQ=255) gtgGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTc < 2:1898301/150‑1 (MQ=255) tgGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCg > 2:2445181/1‑150 (MQ=255) gACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGaaaa < 1:2745387/125‑1 (MQ=255) gACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCt < 2:2176177/142‑1 (MQ=255) aaGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGc > 2:864612/1‑150 (MQ=255) aaGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGc > 1:895151/1‑150 (MQ=255) aGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGcc < 2:1909093/150‑1 (MQ=255) aGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGcc < 2:1032084/150‑1 (MQ=255) gCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTg < 1:2784339/109‑1 (MQ=255) gCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCcgc > 2:689307/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGa > 1:2964093/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGa < 2:3010812/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGAt > 1:459974/1‑118 (MQ=255) tCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGAt < 2:459974/118‑1 (MQ=255) tGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACAcccc < 1:147530/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTAc > 2:1096964/1‑115 (MQ=255) tGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTAc < 1:1096964/115‑1 (MQ=255) agtCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCa < 1:3066240‑M1/147‑1 (MQ=255) GCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAAATGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCTGCCACGCAgc > 1:1698768‑M1/1‑150 (MQ=255) cGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCt > 1:739406/1‑120 (MQ=255) cGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCt < 2:739406/120‑1 (MQ=255) cacaTCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAg < 1:2791007/150‑1 (MQ=255) tCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAgtcgt < 2:2262626/150‑1 (MQ=255) cTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTcc > 1:1995165/1‑150 (MQ=255) tCGGACTGCTATCCCGTGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTTGCGCTGAAAAGATCTCCCTGCACGCCTTCCTCGACGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCATTCGTccc > 2:1293182/1‑149 (MQ=255) gACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCcgc > 2:986457/1‑116 (MQ=255) tgctgTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAAc > 2:48313/1‑150 (MQ=255) gctgTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACt < 2:3066240/150‑1 (MQ=255) ctgTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCAATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACTg > 1:2192073/1‑150 (MQ=255) | CTCGGCGCAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACTGC > NC_002947/5761215‑5761509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |