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ttGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGa < 2:1509268/150‑1 (MQ=255) ttGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGa < 1:2740661/150‑1 (MQ=255) tGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAg < 1:182623/150‑1 (MQ=255) gcacgCCATGCACGCGCATGGCTTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTcc < 2:1171209/87‑1 (MQ=38) acgCCATGCACGCGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTg < 1:993894/135‑1 (MQ=255) ccATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTAcc > 1:2663103/1‑150 (MQ=255) ccATGCACGCGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGtt < 1:2764334/109‑1 (MQ=255) cATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAg > 2:562491/1‑71 (MQ=255) cATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAg < 1:562491/71‑1 (MQ=255) cATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATTGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCt < 1:1100153/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGa > 2:1079980/1‑74 (MQ=255) tGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTgg < 2:1683597/150‑1 (MQ=255) | AGGGCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGC‑CTCCAGCGCAGCGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTGG > NC_002947/590939‑591228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |