Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 591,085 | 0 | T | C | 5.4% | 444.6 / 9.0 | 147 | V110A (GTG→GCG) | PP_0501 | NAD‑dependent epimerase/dehydratase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/74); new base C (4/4); total (69/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.97e-01 |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
AGGGCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTGG > NC_002947/590939‑591228 | ggCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATg > 1:2790355/1‑150 (MQ=255) cTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGc < 2:1820286/150‑1 (MQ=255) gTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCTCGTGCATGGCGTg < 1:1560224/150‑1 (MQ=255) 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aTCGGTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTg < 2:1996973/150‑1 (MQ=255) gTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACa > 2:2616786/1‑150 (MQ=255) cTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACg < 2:1458964/73‑1 (MQ=255) cTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGATACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTg < 2:2676336/150‑1 (MQ=255) cTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGc < 1:2375345/148‑1 (MQ=255) cTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTg < 2:240837/150‑1 (MQ=255) cTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTg > 1:1205964/1‑150 (MQ=255) tCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGcc < 1:1875378/121‑1 (MQ=255) tCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGcc > 2:1875378/1‑121 (MQ=255) aCGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCa < 1:2652391/150‑1 (MQ=255) gTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGt > 1:1267647/1‑150 (MQ=255) ttGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGa < 2:1509268/150‑1 (MQ=255) ttGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGa < 1:2740661/150‑1 (MQ=255) tGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAg < 1:182623/150‑1 (MQ=255) gcacgCCATGCACGCGCATGGCTTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTcc < 2:1171209/87‑1 (MQ=38) acgCCATGCACGCGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTg < 1:993894/135‑1 (MQ=255) ccATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTAcc > 1:2663103/1‑150 (MQ=255) ccATGCACGCGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGtt > 2:2764334/1‑109 (MQ=255) cATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAg > 2:562491/1‑71 (MQ=255) cATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAg < 1:562491/71‑1 (MQ=255) cATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATTGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCt < 1:1100153/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGa > 2:1079980/1‑74 (MQ=255) tGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTgg < 2:1683597/150‑1 (MQ=255) | AGGGCTGGTCACTCAGGCTGCGGCTGGCTGCCGTGCTGTGGTGCATCTGGCGGCGGTAGCGTCGGTTCAGGCATCGGTCGAAGACCCGGTGCGTACCCACCAGAGTAACTTCATCGGTACCCTCAACGTTTGCG‑AAGCCATGCGCGTGCATGGCGTGCGCCGGGTGCTCTTCGCCTCCAGCGCAG‑CGGTGTACGGCAACAATGGTGAAGGGGAATCGATTTCCGAAGACACGCCAAAGGCGCCGTTGACCCCTTATGCCGTGGACAAGCTGGCCAGTGAGCAGTACCTGG > NC_002947/590939‑591228 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |