| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 798,665 | C→A | 5.0% | intergenic (+17/+10) | fklB‑I → / ← PP_0685 | FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 798,665 | 0 | C | A | 5.0% | 326.8 / 2.5 | 99 | intergenic (+17/+10) | fklB‑I/PP_0685 | FKBP‑type peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/44); new base A (2/3); total (52/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTTCGT > NC_002947/798519‑798814 | gCTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTg > 2:300803/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGGCAGAAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTTTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCt > 2:1629328/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTc < 1:89688/150‑1 (MQ=255) gCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCaa < 1:450642/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCACGCGACCTCACTTACGGCGCCCAGGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAAt < 2:1492390/150‑1 (MQ=255) gcagcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTcc > 1:2754734/1‑150 (MQ=255) cagcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCa < 1:2189131/150‑1 (MQ=255) agcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAg > 2:739058/1‑150 (MQ=255) agcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAg > 1:313550/1‑150 (MQ=255) gcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGt < 2:512431/150‑1 (MQ=255) gcaAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGt < 1:2943000/150‑1 (MQ=255) caAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTc < 1:739058/150‑1 (MQ=255) aaaTGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTcca > 1:488344/1‑139 (MQ=255) aaaTGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCAGGGCCGGCCTcca < 2:488344/141‑3 (MQ=255) gTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAAt < 1:1421480/131‑1 (MQ=255) gTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAAt > 2:1421480/1‑131 (MQ=255) tACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAggg > 1:928120/1‑150 (MQ=255) cAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACg > 2:3002293/1‑150 (MQ=255) aaGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGc > 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cTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAgg > 1:463894/1‑150 (MQ=255) tGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAg < 1:1424678/54‑1 (MQ=255) tGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAg > 2:1424678/1‑54 (MQ=255) gTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTc < 1:1470770/124‑1 (MQ=255) gTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTc > 2:1470770/1‑124 (MQ=255) tAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTAc < 2:1019039/95‑1 (MQ=255) tAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTAc > 1:1019039/1‑95 (MQ=255) 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> 2:356176/1‑150 (MQ=255) ccTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTgg > 1:2938815/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTc > 1:2275430/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCAc < 2:2898534/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCAc > 1:2820905/1‑150 (MQ=255) ggccggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGc < 2:2938815/150‑1 (MQ=255) cggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAg < 1:696053/131‑1 (MQ=255) cggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAg > 2:696053/1‑131 (MQ=255) cggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGt < 1:356176/150‑1 (MQ=255) cggccCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGt > 2:816162/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGGCCTTAATTCCAGTCT‑CCCCCCCCGGGGCTCAACGCCCGCGC‑ATAACAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCAGGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTgcgg < 2:2754734/150‑2 (MQ=255) | GCTGATGAACGCTGGCAGCAAATGGCGCCTGTACGTGCCAAGCGAGCTGGCTTACGGCGCCCAAGGCGTTGGCAGCATCCCGCCGCACAGCGTTCTGGTGTTCGACGTCGAGCTGCTCGACGTTCTGTAATGCCCTGGAGGCCGGCCCTGCCGGCCTCAATTCCAGTCT‑GTCCCCCCAGGGCGCAACGCCCGCGC‑ATAGCAGAACAGAAACAGATTCCGTACCAGTTCCTTGAGCACCCCCGGTTCACTCGAATTCAGCCCGCTCATGTCCAGGTCACCCTGGTCACGCAGTTCGT > NC_002947/798519‑798814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |