| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 937,766 | A→T | 5.4% | L2620Q (CTG→CAG) | PP_0806 ← | surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 937,766 | 0 | A | T | 5.4% | 401.0 / 12.5 | 132 | L2620Q (CTG→CAG) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/57); new base T (4/3); total (71/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GAGCAGAACCGCTGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCCGACGACAA > NC_002947/937617‑937913 | gAGCAGAACCGCTGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGgca > 2:2870653/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCgg < 2:1142853/150‑1 (MQ=255) gCTGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCgg > 1:1362739/1‑150 (MQ=255) gCTGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAATGGCACGGCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCgg < 1:995580/150‑1 (MQ=255) cTGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCggg > 1:2955281/1‑150 (MQ=255) gcCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGAt < 2:671352/150‑1 (MQ=255) ccATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATc > 2:2808096/1‑150 (MQ=255) ccATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATc < 1:65803/150‑1 (MQ=255) cATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCa < 2:1452148/150‑1 (MQ=255) cATCGGCAGCGACGACCAGCTAGCTCGGGCTGGTAGGCGCGACAACCAGTGGCACGTAATAGGTCAGCGCTTCAGCGGCGTTGCCGCTGGTGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCa < 2:2941915/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTGGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGACGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAg > 1:2941915/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGcc > 1:1750786/1‑130 (MQ=255) ggCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGcc < 2:1750786/130‑1 (MQ=255) aGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGt > 1:257764/1‑150 (MQ=255) gCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTa > 1:723341/1‑150 (MQ=255) gacgacCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGTGGTCGATCAGGAAAGTAcc < 2:1471011/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTcg > 1:2453878/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCGCTAGGGCTGCTCGGCGTGCCCACCAGTGGCACGTCGTAGGTGAGCGCTTCAGGCGAGTGGCCGATCGGGTCGGTCTGTAGCCGGACACGGCG‑TCGCCTGGGGCCGACCGCCGGGCCGAGGTCGCTGAGGAAAGCACCGTTca < 2:621247/150‑2 (MQ=255) aGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTcgcg < 2:1362739/150‑1 (MQ=255) ttCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggt < 2:2843721/119‑1 (MQ=255) ttCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggt > 1:2843721/1‑119 (MQ=255) gCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTAAGGCGTTCACCCAGGAGCG‑CCGCCGGGTCGAGGTCGATGAGGCAAGTGCCGTTCGCGGTCaa > 2:1436142/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGc < 1:280656/150‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGcc < 1:2870653/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGGTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCg < 1:27241/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCgg < 2:257764/150‑1 (MQ=255) accaccAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGc < 1:3054636/150‑1 (MQ=255) ccccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGGCTGTACGAGTCGCATGCGTTCACTCTGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGt < 2:871502/148‑1 (MQ=255) caccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCgg < 1:2086049/93‑1 (MQ=255) caccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCgg > 2:2086049/1‑93 (MQ=255) caccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATc < 2:258457/106‑1 (MQ=255) caccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGt < 2:842507/126‑1 (MQ=255) caccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGt > 1:842507/1‑126 (MQ=255) caccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTa < 2:667893/139‑1 (MQ=255) accaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTg > 2:2400473/1‑150 (MQ=255) accaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTg > 1:1417806/1‑150 (MQ=255) aGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggtcgagg > 1:1907294/1‑96 (MQ=255) aGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggtcgagg < 2:1907294/96‑1 (MQ=255) tGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCAtt < 2:1417806/150‑1 (MQ=255) gCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggtcgag < 2:2337339/91‑1 (MQ=255) gCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggtcgag > 1:2337339/1‑91 (MQ=255) aCGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCa > 2:269447/1‑150 (MQ=255) aCGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCa > 2:368017/1‑150 (MQ=255) tcgtAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATcg < 1:2400473/150‑1 (MQ=255) gTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCAcc < 2:1827189/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCt > 1:232993/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTg > 1:2863275/1‑135 (MQ=255) gcgcTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGa < 1:2688025/150‑1 (MQ=255) cgcTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGAc > 1:1731362/1‑150 (MQ=255) ggttCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggtcgaggt > 2:1215423/3‑76 (MQ=255) gcTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTa > 2:2040423/1‑90 (MQ=255) gcTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTATGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGggtcgaggt < 1:1215423/76‑1 (MQ=255) agagGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCCGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGGAga > 1:2601588/1‑149 (MQ=255) gagGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGTATCGCGCACCTCGACGGTAGCa > 2:2991732/1‑150 (MQ=255) gagGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCa > 1:2778327/1‑150 (MQ=255) agGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCAc > 1:1549950/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCAcc < 2:2778327/150‑1 (MQ=255) gCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCg > 2:702676/1‑150 (MQ=255) cGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCg > 2:45941/1‑101 (MQ=255) cGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCg < 1:45941/101‑1 (MQ=255) gTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGc > 1:1553987/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTcg > 2:2724477/1‑150 (MQ=255) cGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCCAGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGAACAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTcgc > 1:1330544/1‑150 (MQ=255) cGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTcgc > 2:1461147/1‑150 (MQ=255) gCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATc < 1:1094863/64‑1 (MQ=255) gCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATc > 2:1094863/1‑64 (MQ=255) gtcggtcTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGAcc > 2:2220396/1‑150 (MQ=255) tcTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCAGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCa > 2:1731950/1‑150 (MQ=255) tGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAg < 2:1553987/150‑1 (MQ=255) tGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAg < 1:495684/150‑1 (MQ=255) gTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAAGTCTATCAGGACCGTCCCGCTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAgg > 2:2410470/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTCAGGCGTTCACCAGGCAGCG‑CGGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCa < 1:1971412/150‑1 (MQ=255) ctgtcTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGACGGGTCGACGTCCATCAGGACAGTTTCGTTCGCGGTCACTCTGCCGATACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAg < 2:2218769/146‑1 (MQ=255) cAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAg > 2:7634/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAg < 2:2157287/150‑1 (MQ=255) agccTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAgg < 1:625554/147‑1 (MQ=255) ggCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGc < 2:1553294/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCAcc < 1:1589337/118‑1 (MQ=255) tCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGt > 1:2274966/1‑150 (MQ=255) gCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGgc > 2:2721126/1‑150 (MQ=255) gCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGgc > 1:1706156/1‑150 (MQ=255) acctcgaCCCGGCTGCG‑CTGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTc > 1:101751/7‑120 (MQ=255) gTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACGAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGgcgc > 2:730263/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGgcgc < 1:269447/150‑1 (MQ=255) ctcgaCCCGGCTGCG‑CTGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAg > 1:1988961/5‑108 (MQ=255) ttCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGAc > 1:2099338/1‑125 (MQ=255) ttCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATAAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGAGCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGcc < 1:1056101/150‑1 (MQ=255) tcgaCCCGGCTGCG‑CTGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAgg > 1:139582/4‑139 (MQ=255) tcgaCCCGGCTGCG‑CTGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAgg < 2:139582/136‑1 (MQ=255) tcgaCCCGGCTGCG‑CTGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGcc > 1:2634033/4‑150 (MQ=255) tcgaCCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGCTCGCGTTGACTGTGCCGGTACCGAGCAGCGTGCCATTGGCATAGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGcc > 1:838139/4‑150 (MQ=255) cACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcga < 2:1731362/150‑1 (MQ=255) cACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcga < 1:730263/150‑1 (MQ=255) aCCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgac > 1:3045285/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacga > 1:487582/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacga > 2:191701/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacga > 1:2660092/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacga < 1:368017/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacggc < 1:7634/150‑3 (MQ=255) gcagcg‑cagcCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCCGACGACaa > 2:1025063/1‑150 (MQ=255) | GAGCAGAACCGCTGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCG‑CAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCCGACGACAA > NC_002947/937617‑937913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |