| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 1,470,634 | T→G | 5.1% | P224P (CCA→CCC) | alg44 ← | alginate biosynthesis protein Alg44 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,470,634 | 0 | T | G | 5.1% | 285.4 / 5.7 | 100 | P224P (CCA→CCC) | alg44 | alginate biosynthesis protein Alg44 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/47); new base G (2/3); total (49/51) | |||||||||||
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GCGCGCGACCACGCAATCGCAGGGGCTGGTGAGGGTGCCGGACAGCTGCTTGCCAAACAGTTCCTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTGGCGACG > NC_002947/1470490‑1470781 | gcgcgcGACCACGCAATCGCAGGGGCTGGTGAGGGTGCCGGACAGCTGCTTGCCAAACAGTTCCTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGgcgc > 1:1074469/1‑150 (MQ=255) cgcgcgACCACGCAATCGCAGGGGCTGGTGAGGGTGCCGGACAGCTGCTTGCCAAACAGTTCCTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGgcgcg < 1:2292912/150‑1 (MQ=255) gcgcgACCACGCAATCGCAGGGGCTGGTGAGGGTGCCGGACAGCTGCTTGCCAAACAGTTCCTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGgcgcgc > 1:512050/1‑150 (MQ=255) 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cTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACg > 1:552844/1‑130 (MQ=255) cTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACg < 2:552844/130‑1 (MQ=255) cTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGt > 2:551800/1‑150 (MQ=255) cTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGt < 2:1800873/150‑1 (MQ=255) tCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCtt > 1:915433/1‑111 (MQ=255) tCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCtt < 2:915433/111‑1 (MQ=255) 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1:5216/1‑86 (MQ=255) tggtggTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATg < 2:5216/86‑1 (MQ=255) gtggtgAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATAc < 2:699375/150‑1 (MQ=255) gtgAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTg > 2:1776062/1‑125 (MQ=255) gtgAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTg < 1:1776062/125‑1 (MQ=255) gAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGa > 2:1801154/1‑150 (MQ=255) tGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTgg > 2:2737007/1‑150 (MQ=255) gCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTg < 2:456266/147‑1 (MQ=255) gCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTg > 1:456266/1‑147 (MQ=255) ccAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTGGcga > 1:3027292/1‑150 (MQ=255) ccAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTGGcga < 1:1801154/150‑1 (MQ=255) ccAAGGGCGCGCCATTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGt < 1:594859/114‑1 (MQ=255) ccAAGGGCGCGCCATTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGt > 2:594859/1‑114 (MQ=255) ccAAGGGCGCGCCATTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGc > 2:3026126/1‑132 (MQ=255) ccAAGGGCGCGCCATTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGc < 1:3026126/132‑1 (MQ=255) cAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTGGcgac > 2:2884529/1‑150 (MQ=255) aaTGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTGGcgacg > 1:1196282/1‑150 (MQ=255) aaTGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTGGcgacg > 2:1948174/1‑150 (MQ=255) | GCGCGCGACCACGCAATCGCAGGGGCTGGTGAGGGTGCCGGACAGCTGCTTGCCAAACAGTTCCTCGATCTTCGCCGGCTCCAGCTGTGCGTCTTCAAGGTTGCCCTTGAGCATGTCCAGCATGCTGGTGGTGAAGCTGGCCAATGGCGCGCCCTTGGCGATCTGCCCACCGCTTTCGACCAGGCTGCTTACGGTACCGTCGCGCGGCATGGTGACGTTGGTGGTCGGCACTGCGACCACACCGGCTTCGGCGTGGCTGACGAAATACATGCCATACAACGATTTGGCGACG > NC_002947/1470490‑1470781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |