| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,833,469 | T→C | 5.2% | T200A (ACG→GCG) | PP_1637 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,833,469 | 0 | T | C | 5.2% | 290.4 / 3.6 | 97 | T200A (ACG→GCG) | PP_1637 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/45); new base C (2/3); total (49/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
GAAGGCGTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAACTTCCAGGTCGGGGTGATTGCA > NC_002947/1833320‑1833619 | gAAGGCGTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGt < 1:1121402/150‑1 (MQ=255)gAAGGCGTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTGCGGTGTGCTCCAGCTCCATGCGAATATTGAGGTTGGGGCGTTGATGGCGCATGGTCTGGTCGAAGGTTAGGCGCGt < 2:511704/150‑1 (MQ=255) ggCGTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGCGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGcc > 1:140395/1‑150 (MQ=255) gTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGa > 2:1827494/1‑150 (MQ=255) gTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGa > 2:2687404/1‑150 (MQ=255) gTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGa > 1:463285/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGACGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCACGCGCCTGaccttc < 2:14690/150‑6 (MQ=255) gCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCtt > 1:1503759/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTg < 2:2548552/150‑1 (MQ=255) aGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCgcgc > 2:2487327/1‑150 (MQ=255) cGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGACCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAgg < 1:493690/150‑1 (MQ=255) gAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATc > 2:2863794/1‑150 (MQ=255) gAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATc < 1:545176/150‑1 (MQ=255) aaaTGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATcc > 1:2959556/1‑150 (MQ=255) aaCCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGATGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGCTCAGGCGCGTGCCTGAGCCGTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCct > 1:1182982/1‑150 (MQ=255) aaCCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCct > 2:1719461/1‑150 (MQ=255) cGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCtt < 1:2687404/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGaa > 2:1342585/1‑150 (MQ=255) 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tCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGata > 2:304393/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCTGGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCg > 1:1573135/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGa > 2:1317023/1‑145 (MQ=255) aCCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGa < 1:1317023/145‑1 (MQ=255) ccGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCgg > 1:1716739/1‑150 (MQ=255) ccGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCgg > 2:3001087/1‑150 (MQ=255) cgcgcgCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGgc < 1:1012714/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGgc > 1:2743237/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGgc < 2:2743237/149‑1 (MQ=255) cgcgcTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGgcgc < 2:463285/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGTGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGACATGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGcgcg > 1:191302/1‑150 (MQ=255) gATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAg > 2:1208175/1‑150 (MQ=255) tCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGtt > 2:1597705/1‑150 (MQ=255) tCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGtt > 1:397785/1‑150 (MQ=255) gCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTc < 2:1298843/150‑1 (MQ=255) 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aaTATTGAGCTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGaa < 1:694975/150‑1 (MQ=255) atatTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAac < 1:2844507/150‑1 (MQ=255) ttGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCttt > 2:1401988/1‑97 (MQ=255) ttGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCttt < 1:1401988/97‑1 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAAcaccac < 2:235009/150‑1 (MQ=255) gAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCGGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCATTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGCGGGCTGTGGCGAACAAACcaccac > 1:1011477/1‑150 (MQ=255) gcgGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTc < 2:1365882/150‑1 (MQ=255) tGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGAcc > 1:774514/1‑150 (MQ=255) tGGCGCATGGCCTGGTAGAAGGTAAGGCGCGTGACTACGCCTTATTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGAcc > 2:2653312/1‑150 (MQ=255) ggCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGaaa > 2:1501681/1‑72 (MQ=255) ggCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGaaa < 1:1501681/72‑1 (MQ=255) gcATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGa < 1:2217079/78‑1 (MQ=255) gcATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGa > 2:2217079/1‑78 (MQ=255) gcATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACg > 2:2073221/1‑150 (MQ=255) cATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACgg < 1:1319945/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGaa < 1:2991541/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGaa > 2:2991541/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAAc > 2:2320103/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAAc > 1:2591109/1‑150 (MQ=255) tGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCGCGGCtccact > 2:648908/1‑145 (MQ=255) ggctCAGGCACGCGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGaa < 2:2507288/106‑1 (MQ=255) ggctCAGGCACGCGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGaa > 1:2507288/4‑109 (MQ=255) gTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGc > 2:1558376/1‑135 (MQ=255) gTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGc < 1:1558376/135‑1 (MQ=255) gTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAACTTCCAGGTCg > 2:690304/1‑150 (MQ=255) ctCAGGCACGCGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGccc > 1:760772/2‑75 (MQ=255) ctCAGGCACGCGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGccc < 2:760772/74‑1 (MQ=255) aGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCTTCGACCCACGGCTGAACTTCCAGGTCgagg < 1:1827494/150‑1 (MQ=255) cgTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAACTTCCAGGTCGGGGTGAtt < 1:2020567/150‑1 (MQ=255) gTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAACTTCCAGGTCGGGGTGATTg < 2:774514/150‑1 (MQ=255) tGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAACTTCCAGGTC‑GGGTGATTGCa < 1:1208175/150‑1 (MQ=255) | GAAGGCGTCACGCAGGGCCAGACGTGAAATGCAACCGATGCCCAGGCCCGACTCCACCGCGCGCTTGATCGCTTCGGTGTGCTCCAGCTCCAGGCGAATATTGAGGTTGGCGCGGTGATGGCGCATGGCCTGGTCGAAGGTCAGGCGCGTGCCTGAGCCTTGTTCGCGCAGGATCCA‑CGCCTCTTGCGAAAGGCTTTCGATATCGGCGCGGCCCAGTTTCGCCAGTGGGTGCTGTGGCGCACAGAACACCACCAGTTCGTCCTCGACCCACGGCTGAACTTCCAGGTCGGGGTGATTGCA > NC_002947/1833320‑1833619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |