| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,850,958 | T→A | 85.0% | M1K (ATG→AAG) † | relA → | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,850,958 | 0 | T | A | 85.0% | 294.5 / 40.9 | 107 | M1K (ATG→AAG) † | relA | ATP:GTP 3'‑pyrophosphotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/8); new base A (44/47); total (52/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTAGAGA > NC_002947/1850809‑1851101 | gTTTCCTCGGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATGTCAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAt < 1:939701/150‑1 (MQ=255) cTCAGACGGCGTTTGCCTAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTAc < 2:1615380/150‑1 (MQ=255) gACGGCGCATGTCGAGGCCTTGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGt < 2:2023502/150‑1 (MQ=255) gcgcATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTgaga < 1:1026157/150‑1 (MQ=255) gcATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGt > 2:2058106/1‑150 (MQ=255) cATGTCGAGGCCATCGCGTTACCCGAAGCGGGGTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGTCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTg < 1:2205329/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTga > 2:2516766/1‑142 (MQ=255) gTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTga < 1:2516766/142‑1 (MQ=255) tCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTga > 2:234502/1‑141 (MQ=255) ccATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCgg > 1:2342330/1‑150 (MQ=255) tGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCa > 1:2881269/1‑150 (MQ=255) ggCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCaa < 1:2903794/150‑1 (MQ=255) cGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAaca < 1:1042296/150‑1 (MQ=255) gTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAacac < 2:1921720/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGc > 2:2696625/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGAGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGc > 1:1163277/1‑150 (MQ=255) aaGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACGAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCa > 2:2993346/1‑150 (MQ=255) aaGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCa > 2:1875431/1‑150 (MQ=255) gCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAgg < 1:2440607/111‑1 (MQ=255) gCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAgg > 2:2440607/1‑111 (MQ=255) cTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAAtctc > 1:2245613/1‑150 (MQ=255) tGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCAc < 1:89725/116‑1 (MQ=255) tGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCAc > 2:89725/1‑116 (MQ=255) aCTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGc > 2:1144347/1‑112 (MQ=255) aCTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGaa < 2:2769693/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCAGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGc < 1:1144347/112‑1 (MQ=255) ggCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACg > 1:2026539/1‑130 (MQ=255) ggCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACg < 2:2026539/130‑1 (MQ=255) gCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCAcc > 1:942744/1‑111 (MQ=255) gCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCAt < 1:2058106/150‑1 (MQ=255) gCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCAt < 2:2245613/150‑1 (MQ=255) cccTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGc > 1:2310850/1‑129 (MQ=255) cTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAg > 1:2771127/1‑94 (MQ=255) cTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGtt > 2:1555275/1‑150 (MQ=255) cTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTAGTATG‑GTATGATGCATTCAAATGGAAAACCAGGAAGGTACAGGTGAGAGCGACCCAGCCGTTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGtt < 1:2993346/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGa < 1:1555275/150‑1 (MQ=255) gTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAgg > 1:1683345/1‑86 (MQ=255) gTTGCCAACGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACTCTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgt < 2:1164936/150‑1 (MQ=255) ttGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgtg < 2:2710564/150‑1 (MQ=255) cACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTaa > 1:1003638/1‑150 (MQ=255) cACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGa < 1:1423969/109‑1 (MQ=255) cACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGa > 2:1423969/1‑109 (MQ=255) cACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgt < 1:1371026/145‑1 (MQ=255) cACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgt > 2:1371026/1‑145 (MQ=255) cGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGc < 1:2746768/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGc < 2:2881269/150‑1 (MQ=255) cGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGc < 1:1010418/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCg > 2:2919562/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGt > 2:905344/1‑78 (MQ=255) gAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGt > 1:1176781/1‑150 (MQ=255) ccGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTATTTGTCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGc > 1:2255001/1‑150 (MQ=255) gCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGa > 1:257757/1‑124 (MQ=255) gCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGa < 2:257757/124‑1 (MQ=255) ctttccatgCAGCACAC‑CATACGAGTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGa < 1:739125‑M1/141‑1 (MQ=255) gTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGAt < 1:1875431/150‑1 (MQ=255) ttccatgcagcacaccatacgagtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCa < 1:267128‑M2/40‑1 (MQ=255) ttccatgcagcacaccatacgagtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCa > 2:267128‑M2/31‑70 (MQ=255) ttccatgcagcacaccatacgagtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCg > 2:3003591‑M2/31‑77 (MQ=255) ttccatgcagcacaccatacgagtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCg < 1:3003591‑M2/47‑1 (MQ=255) aTCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATcgc > 2:2064732/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTCAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATcgcg > 2:1771008/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAg > 1:243345/1‑70 (MQ=255) cGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAg < 2:243345/70‑1 (MQ=255) tgcagcacaccatacgagtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTc < 2:1787438‑M2/50‑1 (MQ=255) tgcagcacaccatacgagtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTc > 1:1787438‑M2/26‑75 (MQ=255) ccAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCg < 2:2394241/71‑1 (MQ=255) ccAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCg > 1:2394241/1‑71 (MQ=255) AGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAgcg > 1:2696625‑M1/1‑150 (MQ=255) ACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGaa < 1:912855‑M1/150‑1 (MQ=255) tCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAaag > 2:2303924/1‑150 (MQ=255) gTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAaagaa < 1:2919562/150‑1 (MQ=255) aTG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGc > 2:2548501/1‑150 (MQ=255) aTG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGc < 2:744672/150‑1 (MQ=255) aTG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGc < 2:2342330/150‑1 (MQ=255) tG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGtt < 2:2793474/95‑1 (MQ=255) g‑gTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCt > 1:1045067/1‑150 (MQ=255) gtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCa < 2:292642‑M2/113‑1 (MQ=255) gtgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACAAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCa > 1:292642‑M2/9‑121 (MQ=255) tgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGc > 1:2439944‑M2/8‑150 (MQ=255) tgtgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGc > 2:1323063‑M2/8‑150 (MQ=255) tgctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGa < 1:796423‑M2/145‑1 (MQ=255) ctgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGt > 1:2276340‑M2/4‑150 (MQ=255) tgCATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCCCTGAAAGAAGCCTGCGAGtt > 2:68718‑M2/3‑150 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTg > 2:1889374/1‑150 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGAACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTg < 1:2498630/150‑1 (MQ=255) tGGAAAGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGct < 2:1176781/150‑1 (MQ=255) aaaGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGt < 1:1076783/98‑1 (MQ=255) aaaGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGt > 2:1076783/1‑98 (MQ=255) aGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGa < 1:1889374/150‑1 (MQ=255) aGGTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGa < 1:2548501/150‑1 (MQ=255) ggTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAg < 2:1003638/150‑1 (MQ=255) gTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACGAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAgg > 1:647928/1‑150 (MQ=255) gTAAAACAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAgg > 2:2306679/1‑150 (MQ=255) aaCAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGttt > 2:2815938/1‑136 (MQ=255) aaCAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGttt < 1:2815938/136‑1 (MQ=255) aaCAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTaga < 1:1323063/150‑1 (MQ=255) aaCAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTaga > 1:641581/1‑150 (MQ=255) cAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgtg > 1:2471327/1‑80 (MQ=255) cAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCAtgtg < 2:2471327/80‑1 (MQ=255) cAAAGAAGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTAgaga > 2:649673/1‑150 (MQ=255) | GTTTCCTCAGACGGCGCATGTCGAGGCCATGGCGTTATTCGAAGCGGGCTAGCTGACTGGCCCCTTGGTGCGGTTGCCACGGAAGGGCGGCCGCACGGTGATCGCCAGCACACTCGTATG‑GTGTGCTGCATGGAAAGGTAAAACAAAGATGGTACAGGTGAGAGTGCACCAGCCGGTCAACACTGACGGCAGTATCAATCTCGAAGCATGGTTGGACCATGTGGTAAGCGTCGATTCGGCACTGGATCGCGCAGCGCTGAAAGAAGCCTGCGAGTTTGCTCTTGAGGTAGAGA > NC_002947/1850809‑1851101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |