| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,095,235 | G→C | 12.5% | intergenic (‑243/+74) | htpX ← / ← alaA | protease HtpX/glutamate‑pyruvate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,095,235 | 0 | G | C | 12.5% | 233.2 / 21.7 | 78 | intergenic (‑243/+74) | htpX/alaA | protease HtpX/glutamate‑pyruvate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/31); new base C (5/5); total (42/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
GTACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAG > NC_002947/2095089‑2095381 | gtACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGTTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgggcg < 1:1778691/150‑1 (MQ=255)gtACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgggcg < 1:306359/150‑1 (MQ=255)gtACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgggcg < 2:2757710/150‑1 (MQ=255) tACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgggcgg > 1:180402/1‑150 (MQ=255) gAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGa < 2:1766423/150‑1 (MQ=255) aGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGAt < 2:241046/150‑1 (MQ=255) aGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTCGAt < 2:1041219/150‑1 (MQ=255) gTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATc < 1:499051/150‑1 (MQ=255) gTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATc < 1:278184/150‑1 (MQ=255) agagGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGccc > 1:1293911/1‑150 (MQ=255) agagGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGccc > 1:360012/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCccaccac < 2:960957/150‑1 (MQ=255) gggCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCcg > 1:2496781/1‑150 (MQ=255) gggCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATGCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCGCGGCGCTCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCAcccccc > 2:1781791/1‑149 (MQ=255) ggCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGcccc > 2:347136/1‑136 (MQ=255) ggCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGcccc < 1:347136/136‑1 (MQ=255) tgtgGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑c < 2:2496781/150‑1 (MQ=255) aTAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc > 1:2587300/1‑115 (MQ=255) aTAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc < 2:2587300/115‑1 (MQ=255) tAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACctc > 1:2679937/1‑150 (MQ=255) agagCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgggcgg < 2:1487740/108‑1 (MQ=255) agagCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCgcgggcgg > 1:1487740/1‑108 (MQ=255) agCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCg > 2:1487689/1‑150 (MQ=255) gCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc > 2:1696809/1‑105 (MQ=255) gCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc < 1:1696809/105‑1 (MQ=255) ggATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGG‑CGAACCTCTCGGTGCCCCCg > 2:23791/1‑150 (MQ=255) gATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCCT‑CGAAACCCCCGTAGCCCCCgg > 2:555752/1‑150 (MQ=255) gATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc < 2:925628/101‑1 (MQ=255) gATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc > 1:925628/1‑101 (MQ=255) aTGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGgc > 1:973424/1‑150 (MQ=255) tAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGcc > 1:2769843/1‑150 (MQ=255) aGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAAc < 1:1007154/128‑1 (MQ=255) aGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAAc > 2:1007154/1‑128 (MQ=255) aGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTa > 1:578707/1‑136 (MQ=255) aGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTa < 2:578707/136‑1 (MQ=255) aGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCCCGT‑CGGACCTCCCGTAGCCCCCGGcccccc > 1:1813604/1‑150 (MQ=255) aaaCATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGgc < 2:2508780/143‑1 (MQ=255) aaaCATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGgc > 1:2508780/1‑143 (MQ=255) aCATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGATCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCACCGTGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTc < 1:1781791/150‑1 (MQ=255) cATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGAt > 2:318194/1‑93 (MQ=255) cATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGAt < 1:318194/93‑1 (MQ=255) aTTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAAc < 1:964060/122‑1 (MQ=255) aTTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAAc > 2:964060/1‑122 (MQ=255) ggCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAAccc > 1:1372308/1‑150 (MQ=255) gCTTTGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGGTCTGCGCCCCACCCCCCCCCCCGCCTCCGAACC‑CTCCTAGCCCCCCCCGCCCCCCTCCAAcccc > 2:1538747/1‑149 (MQ=37) gCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCTCCCGTCGAACCCTACTGCGaa < 2:360012/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCCCGT‑CGAACCCCCCGTAGCCCCCCGCGCCCCCCTCCAACCCCACTCCGAATAAccc > 2:3062856/1‑150 (MQ=38) aGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTCCTGCGAATAACCCTTc < 2:1293911/150‑1 (MQ=255) aGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTc > 2:2738969/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCa < 1:896753/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAg < 2:1679890/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAg < 2:2679937/150‑1 (MQ=255) gCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc > 2:2432212/1‑62 (MQ=21) gCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCCCGCGCGGCGCTc < 1:2432212/62‑1 (MQ=21) 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gCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCa > 2:717993/1‑132 (MQ=255) gCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCa < 1:717993/132‑1 (MQ=255) aaGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCa < 1:2417793/130‑1 (MQ=255) aaGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCa > 2:2417793/1‑130 (MQ=255) gtggtgtggtGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAAt < 1:2888331/150‑1 (MQ=255) tggtgtggtgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCCCCACCCCCGCGT‑CCAACCCCTCCTAACCCCCGGCGCCCCCGCCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTTTGGAAATTGGCCATCCGGGCCAtt > 1:2629493/1‑150 (MQ=37) tggtgtggtgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAAtt < 2:973424/150‑1 (MQ=255) gtgtggtgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGc < 1:3062856/150‑1 (MQ=255) gtgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCCCCACCCCCGCGT‑CCAACCTCTCGTAGCCCCCCGCGCCCCCGGCGAACCCTGCTGCGGAGAACCCCTCAGGAAATTGCCGATGCCGCCAATTGCCACtt > 1:931640/1‑150 (MQ=37) gtgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTa < 1:321553/77‑1 (MQ=255) gtgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTa > 2:321553/1‑77 (MQ=255) tgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGaa < 1:164119/109‑1 (MQ=255) tgCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGaa > 2:164119/1‑109 (MQ=255) gtgAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCCGCCCATTGCCCCTTCCAGGt > 2:883526/1‑150 (MQ=255) gagaTCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCa < 2:2524862/150‑1 (MQ=255) gagaTCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAAACCTTCAGGAAATTGCCGATTCGGCCAATTGCCGCTTTCAgggta > 2:2663785/1‑147 (MQ=255) gagaTCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCCCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCCGCGCCCCCCTCGAAACCTACTGCCAAAAACCCCTCAGGAAAATGCCGACCCGGCCAATTTCCCCTTCCCgggcc > 2:1995182/1‑147 (MQ=255) tCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCCCCCAACCCGCCG‑CGGAAATCTCGCCTCCCCCGCCCCCCCCCCCGAAACCTACTGCGCATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCCGCCAAATCCCGCCTCCAGGGCATccc > 2:2816814/1‑149 (MQ=255) tgAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCAc > 2:2113121/2‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCa < 1:978931/106‑1 (MQ=255) gAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCa > 2:978931/1‑106 (MQ=255) gcgcCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCcg > 2:1787617/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCcg > 1:1419930/1‑150 (MQ=255) cgccgcGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCAGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCcgc < 2:2769843/150‑1 (MQ=255) cgcgGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGTaa < 1:555752/150‑1 (MQ=255) gcgggcggCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAg < 2:1813604/150‑1 (MQ=255) gcgggcggCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑AGCACGATTTGCTTCGGCTCGCTGTTGCTTGCAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAg < 1:2663785/150‑1 (MQ=255) | GTACGGCGGAGTATGGCAGAGGATGGCGTGGGGGCTGTGGGATAGAGCGTTGCAGGATGTAAGAAACATTCGGCTTGGGGGCTGCGTCAAGGCCGCTGGGTGTTTGCCGCAAGTGGTGTGGTGCCTGTGAGATCGAGCGCCGCGCGGGCGGCGCTCGATCTGCGCCCCACCACCACCCCCGCGT‑CGAACCTCTCGTAGCCCCCGGCGCCCCCGTCGAACCCTACTGCGAATAACCCTTCAGGAAATTGCCGATCCGGCCAATTGCCGCTTCCAGGTCATCCACCCGCGGCAAG > NC_002947/2095089‑2095381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |