| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,147,930 | A→C | 5.0% | V878G (GTC→GGC) | rne ← | ribonuclease E |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,147,930 | 0 | A | C | 5.0% | 279.5 / 6.0 | 100 | V878G (GTC→GGC) | rne | ribonuclease E |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/48); new base C (2/3); total (49/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
TGAGCTTTGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCG > NC_002947/2147783‑2148078 | tGAGCTTTGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGAca < 2:1800290/150‑1 (MQ=255) gAGCTTTGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGAcag < 1:750993/150‑1 (MQ=255) gAGCTTTGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTGGCTGCTGTCGCcag < 1:785363/150‑1 (MQ=255) cTTTGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGAcagcag > 1:1217566/1‑150 (MQ=255) tttGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACagcagc < 2:1904881/150‑1 (MQ=255) ttGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGcc < 2:696025/150‑1 (MQ=255) gtggCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTc > 1:488573/1‑150 (MQ=255) gCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGAc < 2:1918386/137‑1 (MQ=255) gCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGAc > 1:1918386/1‑137 (MQ=255) gCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACg > 1:1253571/1‑150 (MQ=255) accGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCAACAGCAGCCGTCACg > 2:2135927/2‑150 (MQ=255) ccGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGAcagca < 2:2481769/140‑1 (MQ=255) ccGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGAcagca > 1:2481769/1‑140 (MQ=255) ccGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACgg > 1:769968/1‑150 (MQ=255) cTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCaa < 2:1217566/150‑1 (MQ=255) ttCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTCGCACGTTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAg < 2:248177/150‑1 (MQ=255) ttCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGTTGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAg < 2:2774811/150‑1 (MQ=255) cGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGc < 2:2555698/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCca > 2:1550322/1‑150 (MQ=255) aCCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCca > 2:46888/1‑150 (MQ=255) cTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCcagc > 1:485152/1‑150 (MQ=255) tGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCcagca < 2:769968/150‑1 (MQ=255) cTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCagcagc < 1:2370073/150‑1 (MQ=255) aCCGGTTGGGGGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGt > 2:287063/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGATTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGtt < 1:222458/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGAAGAGCACTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGtt > 1:1593772/1‑150 (MQ=255) ggTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCg > 2:1234846/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCa < 2:485152/150‑1 (MQ=255) ggcggcTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTAGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCAcc > 1:1108051/1‑150 (MQ=255) gcggcTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGTCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCAccc < 1:2537952/150‑1 (MQ=255) ggcTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAg < 1:1457683/150‑1 (MQ=255) ggcTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAg > 2:1499067/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGcc > 1:1564398/1‑126 (MQ=255) ttCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGcc < 2:1564398/126‑1 (MQ=255) cGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCgg < 1:1499067/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTg < 1:1013378/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTg < 1:1550322/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCAcc > 2:2749404/1‑134 (MQ=255) tCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCAcc < 1:2749404/134‑1 (MQ=255) tCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTgg > 1:102375/1‑150 (MQ=255) cGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGt < 1:2318764/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTg > 1:2367906/1‑150 (MQ=255) gTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGTCGCCagcagca < 2:1909589/99‑2 (MQ=255) gTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGGTGCTGCTGTCGCCagcagca > 1:1909589/1‑98 (MQ=255) cTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCtgtt < 1:46888/150‑1 (MQ=255) tGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCtgttg > 1:349370/1‑150 (MQ=255) gCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCtgttgt < 2:1029543/150‑1 (MQ=255) gCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCtgttgt < 2:349370/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGgc < 1:410587/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGc > 1:317583/1‑150 (MQ=255) 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ttCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGt > 2:201269/1‑89 (MQ=255) tCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTgcgc > 2:2802837/1‑150 (MQ=255) tCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTgcgc < 2:1593772/150‑1 (MQ=255) ggAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTg < 1:570555/73‑1 (MQ=255) ggAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTg > 2:570555/1‑73 (MQ=255) ggAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTg > 1:2285588/1‑150 (MQ=255) gAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTgcgc > 1:1539186/1‑147 (MQ=255) gAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTgcgc < 2:1539186/147‑1 (MQ=255) gAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGa < 1:765413/150‑1 (MQ=255) gCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACg > 2:2436940/1‑150 (MQ=255) gCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCCGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACg > 2:2046258/1‑150 (MQ=255) gATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTc > 2:686443/1‑150 (MQ=255) tGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCTCTGACGCTCac < 2:2285588/150‑1 (MQ=255) tgctgcTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCacgac > 1:519081/1‑150 (MQ=255) gctgctGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCt > 1:505711/1‑137 (MQ=255) gctgctGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCATTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCt < 2:505711/137‑1 (MQ=255) tgctgGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGt > 2:253652/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGt > 1:2884710/1‑150 (MQ=255) gctgGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGtt < 2:2884710/150‑1 (MQ=255) ctgGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGt < 2:2736278/56‑1 (MQ=255) ctgGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGt > 1:2736278/1‑56 (MQ=255) tgGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTAGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTtgc > 2:1995771/1‑150 (MQ=255) gCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTtgctg > 1:626693/1‑150 (MQ=255) gACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGcg > 1:732169/1‑150 (MQ=255) gACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGcg > 2:2467055/1‑150 (MQ=255) gACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGCCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCGCACGACGGTTGCTGcg > 2:421677/1‑150 (MQ=255) | TGAGCTTTGGTGGCCGCTTCGACCTGCTCGACCGGTTGGGCGGCTTCGCTGTTGTCGGTTTCTGCAACGGCAGCGACTTCGGCGGTAGCACGCTCGGCCTGCTGGTTGGCCTGGGCTTCTGCGTCGGAGCTGATGTTGCTGCTGGCGACAGCAGCCGTCACGGCAAGGCCAGCAGCCAGTTCGGCACCCAGCTCGGTGGCCTGGTGCTGTTGTGGCTGCTCTTCGCTGCCTTCTTCTTCACTGCCGTCGATCAGCTCGCCGTTGGCATTGCGCTGACGCTCACGACGGTTGCTGCG > NC_002947/2147783‑2148078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |