| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,241,611 | G→C | 5.1% | noncoding (35/76 nt) | PP_t25 → | tRNA‑Ala |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,241,611 | 0 | G | C | 5.1% | 249.9 / 4.7 | 78 | noncoding (35/76 nt) | PP_t25 | tRNA‑Ala |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/36); new base C (2/2); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.38e-01 | |||||||||||
AAAATTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTT > NC_002947/2241464‑2241759 | aaaaTTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTgcatggca < 2:2355325/150‑1 (MQ=255)aaaaTTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTgcatggca > 1:426475/1‑150 (MQ=255) tAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCag < 2:616729/150‑1 (MQ=255) tAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTAAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCag < 2:2972284/150‑1 (MQ=255) gTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCagga < 2:1844380/150‑1 (MQ=255) tttGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGCACAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCaggag > 1:2382752/1‑150 (MQ=255) tGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGt < 1:2586631/150‑1 (MQ=255) tGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGt < 1:2955118/150‑1 (MQ=255) aCAGCCCTGCAATCCGACCTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCa > 2:228190/1‑150 (MQ=255) aCAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCa > 1:998359/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCg < 1:483809/150‑1 (MQ=255) cTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGtt < 2:2863523/150‑1 (MQ=255) tGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTc > 2:1896468/1‑150 (MQ=255) gCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCg > 2:1064536/1‑150 (MQ=255) cAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGa < 2:1841242/150‑1 (MQ=255) aaTCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGAt < 2:546452/150‑1 (MQ=255) ccGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGCTGCGGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATccc < 1:1570269/150‑1 (MQ=37) gAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGc > 2:1177248/1‑150 (MQ=255) ttAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAg > 1:736907/1‑150 (MQ=255) tatGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTcc > 1:114765/1‑150 (MQ=255) atGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTcca > 2:2330460/1‑150 (MQ=255) ccccGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGGTTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCaaa > 1:2784526/1‑150 (MQ=255) gTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTcc < 2:736907/150‑1 (MQ=255) tCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCg > 1:311593/1‑150 (MQ=255) cacaGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCt < 2:311593/150‑1 (MQ=255) cacaGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACAAAATTCCGCt < 1:228190/150‑1 (MQ=255) acaGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCtt > 1:2105712/1‑150 (MQ=255) gCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCCTGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTagc < 2:1652236/150‑1 (MQ=255) aTGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATccc > 2:1853814/1‑120 (MQ=255) aTGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATccc < 1:1853814/120‑1 (MQ=255) cgaaaacgaaaCGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAgg < 1:2986160/150‑1 (MQ=255) gaaaacgaaaCGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGc < 2:998359/150‑1 (MQ=255) aaaacgaaaCGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTAAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCTGTTAGCAGCTAAGGca > 2:640548/1‑149 (MQ=255) acgaaacgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGCATGTATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGAt > 1:2487783/1‑150 (MQ=255) gaaacgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCagga < 2:91809/90‑1 (MQ=255) gaaacgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCagga > 1:91809/1‑90 (MQ=255) ccAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGATTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGa > 1:1572340/1‑150 (MQ=255) cccAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTc < 2:2608004/150‑1 (MQ=255) ccagccagCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGCGTcc > 1:721317/1‑150 (MQ=255) gccagcGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCTGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGc < 2:426475/150‑1 (MQ=255) ccagcGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCa > 1:1002983/1‑150 (MQ=255) ccagcGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCa > 1:1968603/1‑150 (MQ=255) ccagcGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCa > 2:1393514/1‑150 (MQ=255) gATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCgg > 1:1367730/1‑150 (MQ=255) ttCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGc > 1:39505/1‑90 (MQ=255) ttCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGc < 2:39505/90‑1 (MQ=255) ttCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGt > 2:1863070/1‑150 (MQ=255) tCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTc < 2:1968603/150‑1 (MQ=255) tCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTGGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTc < 2:1002983/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGa < 1:1177248/150‑1 (MQ=255) ttCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGa > 2:2992370/1‑150 (MQ=255) tCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGGCCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGaa < 2:448465/150‑1 (MQ=255) aGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTa < 1:1393514/150‑1 (MQ=255) aGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTa > 1:1527274/1‑150 (MQ=255) aGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTa < 1:2330460/150‑1 (MQ=255) aCATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTc > 2:2848123/1‑88 (MQ=255) aCATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTc < 1:2848123/88‑1 (MQ=255) ttGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGt > 2:1924110/1‑150 (MQ=255) cTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCTGGCAGGAGTGCTGGGGGTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCCCCCGCACCTATGGATGCCTTTTGCCAGCAACCGGGTCTTGCAGGTAAGAAGGTTCGTcccc > 2:2968630/1‑150 (MQ=12) taGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTc < 2:2105712/150‑1 (MQ=255) cTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAg < 2:1748403/126‑1 (MQ=255) cTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAg > 1:1748403/1‑126 (MQ=255) tCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCt > 2:2410904/1‑150 (MQ=255) gCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCttga < 1:2410904/150‑4 (MQ=255) gCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGt > 1:177689/1‑150 (MQ=255) cTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTg < 1:1064536/150‑1 (MQ=255) tGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTa < 1:592978/146‑1 (MQ=255) tGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTa > 2:592978/1‑146 (MQ=255) gggAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGc > 1:2759396/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTcccc > 2:3030105/1‑131 (MQ=255) gcgcCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTcccc < 1:3030105/131‑1 (MQ=255) ctccTGCATGCCATGCAGGCGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCgg < 1:23369/101‑1 (MQ=255) ctccTGCATGCCATGCAGGCGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCgg > 2:23369/3‑103 (MQ=255) ctccTGCATGCCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTa < 1:707565/144‑1 (MQ=255) ctccTGCATGCCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTa > 2:707565/3‑146 (MQ=255) gcCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTaa > 2:2031367/1‑70 (MQ=255) gcCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTaa < 1:2031367/70‑1 (MQ=255) cTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATaa < 1:173708/77‑1 (MQ=255) cTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATaa > 2:173708/1‑77 (MQ=255) cTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACAcc > 1:356933/1‑150 (MQ=255) catggcatgCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTc < 1:313433/121‑1 (MQ=255) catggcatgCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTc > 2:313433/1‑121 (MQ=255) ggcatgCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCtt > 2:1135910/1‑150 (MQ=255) | AAAATTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTT > NC_002947/2241464‑2241759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |