| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,318,704 | A→G | 8.6% | A301A (GCA→GCG) | PP_2039 → | acyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,318,704 | 0 | A | G | 8.6% | 349.4 / 15.4 | 125 | A301A (GCA→GCG) | PP_2039 | acyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (60/54); new base G (6/5); total (66/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ATTGCCCCACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCTGCT > NC_002947/2318556‑2318850 | aTTGCCCCACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCAc > 2:197209/1‑150 (MQ=255) ccACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACgcagca > 1:1845320/1‑150 (MQ=255) cACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCAt > 1:2402397/1‑150 (MQ=255) cTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCACCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGt > 2:2641123/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTc < 2:602906/150‑1 (MQ=255) tGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCGTGCAGCATgca < 1:50223/145‑3 (MQ=255) gccggccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCa > 2:849795/1‑145 (MQ=255) gccggccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCa < 1:849795/145‑1 (MQ=255) gccggccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCa > 2:2696518/1‑150 (MQ=255) cggccTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGc > 2:369922/1‑150 (MQ=255) ggCACTGAACCTCTCGCTCGACTATGCCTGCTCGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGaa < 1:2008155/150‑1 (MQ=255) gCACTGAACCGCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt < 2:476171/150‑1 (MQ=255) cTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGAc > 1:1893885/1‑150 (MQ=255) gAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGc > 1:1952919/1‑150 (MQ=255) aCCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGcct < 1:13353/150‑2 (MQ=255) ctctCGATCGACTATGACTGCACGGGGAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGACGATAAACCATATGATCGACGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCGACGGCAGCGGTCAATGACGCcggc > 2:1052833/1‑150 (MQ=255) ctcGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCcg < 2:221903/146‑1 (MQ=255) ctcGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGACTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAAACATATGATCGCCGACATGTCCACCGAGCTGCACGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCcggctg > 2:109507/1‑148 (MQ=255) gatcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCcggcg > 2:1945776/1‑146 (MQ=255) gatcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCcggcg < 1:1945776/146‑1 (MQ=255) atcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATg > 1:2546949/1‑111 (MQ=255) atcgaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATg < 2:2546949/111‑1 (MQ=255) gaCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATc > 2:2569960/1‑150 (MQ=255) aCTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGa < 1:143486/129‑1 (MQ=255) ccGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCa > 2:628021/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCAGGCGGCAATATCCGCACCAAGGcccc > 1:1256309/1‑150 (MQ=255) aaGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGt > 1:1918951/1‑110 (MQ=255) aaGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGt < 2:1918951/110‑1 (MQ=255) aGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGAtgt < 2:2118873/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa < 2:1845320/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAg < 2:242973/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGtt < 2:2506197/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGAATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATcc > 1:1259780/1‑122 (MQ=255) ccAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGAATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATcc < 2:1259780/122‑1 (MQ=255) cAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAata > 2:2651352/1‑118 (MQ=255) cAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAata < 1:2651352/118‑1 (MQ=255) cAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTc < 2:1725866/150‑1 (MQ=255) aGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCg > 1:865816/1‑150 (MQ=255) gCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGt > 2:2658116/1‑150 (MQ=255) cTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa > 2:1744227/1‑139 (MQ=255) cTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa < 1:1744227/139‑1 (MQ=255) cTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGttt > 1:419145/1‑150 (MQ=255) tCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCGTGCAGCATgcag < 1:189468/74‑4 (MQ=38) tCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCgg > 1:1672913/1‑150 (MQ=255) gCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCCATCTCCGCACCCAGGCCCCGATTTGCAAGCTGTTCGTTTCGgag < 1:1159597/150‑1 (MQ=255) ccATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGc > 2:902463/1‑85 (MQ=255) ccATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGc < 1:902463/85‑1 (MQ=255) ccATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGtt < 2:2791736/143‑1 (MQ=255) ccATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGtt > 1:2791736/1‑143 (MQ=255) ccATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGgaga > 2:358179/1‑150 (MQ=255) cATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGGTTCGGAGAc > 1:350574/1‑150 (MQ=255) tGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACgg < 1:2641123/150‑1 (MQ=255) ttCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGt < 2:44847/83‑1 (MQ=255) aGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTcc < 1:358179/150‑1 (MQ=255) gTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTc > 2:1863658/1‑148 (MQ=255) gTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCg > 1:1242222/1‑150 (MQ=255) gATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa > 2:2595096/1‑120 (MQ=255) gATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCaa < 1:2595096/120‑1 (MQ=255) tCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCa > 1:2214789/1‑103 (MQ=255) tCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCa < 2:2214789/103‑1 (MQ=255) cAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGc < 1:197209/150‑1 (MQ=255) aCCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGa > 2:1832285/1‑108 (MQ=255) aCCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGa < 1:1832285/108‑1 (MQ=255) ccATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt < 2:619550/73‑1 (MQ=255) ccATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAAt > 1:619550/1‑73 (MQ=255) ccATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGa < 2:2669468/150‑1 (MQ=255) atatGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATc < 2:1936945/150‑1 (MQ=255) gATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCgcgc > 1:1846422/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCg > 2:756300/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCg > 1:1043903/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGACGGCAATATCCGCACCCAAGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCg > 1:1258223/1‑150 (MQ=255) ccGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGc < 2:1867831/124‑1 (MQ=255) ccGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGc > 1:1867831/1‑124 (MQ=255) ccGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGc < 2:1242222/150‑1 (MQ=255) cGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGAc > 1:2772480/1‑64 (MQ=255) cGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGAc < 2:2772480/64‑1 (MQ=255) aCATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCCGCGGCCATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGa < 1:369922/150‑1 (MQ=255) tGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTc > 1:934939/1‑109 (MQ=255) tGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTcc < 2:2079152/123‑1 (MQ=255) tGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTcc > 1:2079152/1‑123 (MQ=255) gCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCa > 1:632055/1‑143 (MQ=255) cACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGc > 1:305013/1‑95 (MQ=255) cACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTc > 1:5787/1‑105 (MQ=255) cACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTc < 2:5787/105‑1 (MQ=255) cACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGgaga > 1:2666153/1‑110 (MQ=255) cACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACAcgg > 1:2290004/1‑150 (MQ=255) aCCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACAcggc < 2:1893885/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACAcggc < 1:1166087/142‑1 (MQ=255) gCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACAcggc > 2:1166087/1‑142 (MQ=255) gCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATACCCCCAACTTCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCgg > 1:2090743/1‑150 (MQ=255) ccATGCTGCGTGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGt > 2:120180/2‑145 (MQ=255) ccATGCTGCGTGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGt > 2:1542048/2‑145 (MQ=255) ccATGCTGCGTGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGt < 1:120180/144‑1 (MQ=255) ccATGCTGCGTGCAGCATGGTATACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGt < 1:1542048/144‑1 (MQ=255) cATGCTGCGTGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTcc > 1:778315/1‑109 (MQ=255) cATGCTGCGTGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTca < 2:778315/109‑2 (MQ=255) cATGCTGCGTGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATAACCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGGGCCggg > 1:456856/1‑150 (MQ=255) tgctgcACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGgct > 1:2877012/1‑150 (MQ=255) tgcACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGgctgct > 1:2098319/1‑150 (MQ=255) tgcACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGAAGACGGCGGCCATAGCTGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGgctgct > 1:2364997/1‑150 (MQ=255) | ATTGCCCCACCTTGCTGGGGCTGGCCGGCCTGGCACTGAACCTCTCGATCGACTATGCCCGCACGCGCAAGCAGTTCGGCCAGCCTATCGCCATGTTCCAGTCGATCAACCATATGATCGCCGACATGGCCACCGAGCTGCATGCTGCACGCAGCATGGTCTACGCCACGGCAGCGGTGAATGACGCCGGCGGCAATATCCGCACCCAGGCCCCGATGTGCAAGCTGTTCGTTTCGGAGACGGCCTTCCGCATCGCCGATCGCGCCGTGCAGATACACGGCGGTGCCGGGCTGCT > NC_002947/2318556‑2318850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |