| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,342,146 | T→G | 5.9% | intergenic (+18/‑46) | yraO → / → PP_2058 | transporter YraO/porin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,342,146 | 0 | T | G | 5.9% | 433.8 / 14.3 | 155 | intergenic (+18/‑46) | yraO/PP_2058 | transporter YraO/porin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/74); new base G (5/5); total (76/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGAAGACAGCAAGCTCAAG > NC_002947/2342001‑2342290 | cATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGa < 1:2581538/150‑1 (MQ=255) tCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCAc < 2:1610023/150‑1 (MQ=255) aCCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCa > 1:185563/1‑150 (MQ=255) ccGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCaa < 1:1918116/150‑1 (MQ=255) cgcgATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGAGCGGCGccct > 2:2360313/1‑134 (MQ=255) cgcgATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCGGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGAGCGGCGccct < 1:2360313/135‑2 (MQ=255) tatCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCGGGGCGCCGAGCGGCGccctggg > 1:784859/1‑129 (MQ=255) tatCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCGGGGCGCCGAGCGGCGccctggg < 2:784859/133‑5 (MQ=255) cctggTTATTTCCATAAACCCCCCGTTAATGTGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCCCTGCGCTGGCACTGCTGACGGTCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGaacaac < 2:1314533/147‑1 (MQ=255) atCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGaacaac < 2:25916/150‑1 (MQ=255) cGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGaacaacaa < 1:2073270/150‑1 (MQ=255) cGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGaacaacaa > 2:2992324/1‑150 (MQ=255) ggTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTCCATGGTTTGAAGCACCCAGGGACCCGCCCGGCGCCCCCCTAACTCACCCAAGaccaacaac > 2:338346/1‑150 (MQ=255) gTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAacaacaaca > 2:2798763/1‑150 (MQ=255) gATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACaga < 2:824542/150‑1 (MQ=255) gATTTACAGAAAGTTACCTTGAAATGGTCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGTCTCACCCAAGAACAACAACaga < 2:488503/150‑1 (MQ=255) aTTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACagag < 1:2730409/150‑1 (MQ=255) tttCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGt < 1:2992324/150‑1 (MQ=255) ttCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTAACCCAAGaacaac < 2:3027079/141‑1 (MQ=255) cAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGa < 1:2022350/122‑1 (MQ=255) cAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGa > 2:2022350/1‑122 (MQ=255) aGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACca > 1:308331/1‑150 (MQ=255) aaaGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcatc < 1:2798763/150‑1 (MQ=255) aaaGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcatc > 1:1047908/1‑150 (MQ=255) aGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcatcat > 2:655846/1‑150 (MQ=255) gTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGaa < 2:326542/122‑1 (MQ=255) tGAAATGTGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGAt < 1:131424/150‑1 (MQ=255) tGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGAt < 1:1063531/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTcgc > 2:665166/1‑105 (MQ=255) ggCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTcgc < 1:665166/107‑3 (MQ=255) ccGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTcc > 2:1599476/1‑150 (MQ=255) tGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCGCCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGaac > 1:825519/1‑110 (MQ=255) tGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCGCCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGaac < 2:825519/110‑1 (MQ=255) cTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGAGGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGG > 1:2488915‑M1/1‑150 (MQ=255) tctcctctCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTTTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGG < 2:1245649‑M1/147‑1 (MQ=255) ccTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTc > 1:2407848/1‑127 (MQ=255) ccTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTc < 2:2407848/127‑1 (MQ=255) tctGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGa < 1:742260/87‑1 (MQ=255) tctGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGa > 2:742260/1‑87 (MQ=255) tctGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTATTTTCCGTGGGGCCACTtg > 1:937006/1‑150 (MQ=255) tGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGTGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGc < 2:426744/82‑1 (MQ=255) tGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTtgtg > 2:2828552/1‑150 (MQ=255) aTCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCctg > 1:1553163/1‑150 (MQ=255) aCTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTgtg > 1:757222/1‑130 (MQ=255) aCTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTgtg < 2:757222/132‑3 (MQ=255) aCTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTACTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCctgc‑tg > 1:473837/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑tgtg > 2:1062454/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGc < 1:391876/150‑1 (MQ=255) cgcTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTtg < 2:791416/136‑1 (MQ=255) cgcTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCg > 2:1057235/1‑150 (MQ=255) tGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCggct > 1:960526/1‑150 (MQ=255) gCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGTGCCACCTGTGGCCTGC‑TGTGTggctgg > 2:1263567/1‑150 (MQ=255) gCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCggctgg < 2:960526/150‑1 (MQ=255) cACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGTGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCggct < 2:895163/147‑1 (MQ=255) cACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTTGCCTGC‑TGTGCggct > 1:895163/1‑147 (MQ=255) aCTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGc > 2:8722/1‑133 (MQ=255) aCTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGc < 1:8722/133‑1 (MQ=255) tgctgACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGc < 1:1599476/150‑1 (MQ=255) ctgACGGGCGCTTTGTCCTTCATGGTTTCAAGCACCCATGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTCGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCt < 2:178323/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCaa > 1:798812/1‑68 (MQ=255) cgcCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCgg < 1:338346/150‑1 (MQ=255) ttGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCGTCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTgcc > 1:77513/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTtgt > 2:1546944/1‑112 (MQ=255) ccTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGccgccg < 2:1047908/150‑1 (MQ=255) ccTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGccgccg < 1:1692361/150‑1 (MQ=255) ttCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACtt < 1:454766/106‑1 (MQ=255) ttCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCctgc‑t < 1:2179057/116‑1 (MQ=255) ttCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCctgc‑t > 2:2179057/1‑116 (MQ=255) ttCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCgga > 1:659280/1‑149 (MQ=255) ttCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGt < 1:655846/150‑1 (MQ=255) ttCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGt < 1:1057235/150‑1 (MQ=255) ttCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGt < 2:1937964/150‑1 (MQ=255) tCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACATAGTAACCATCATGTCCCCATTCCTTTTCCGTGGACCCACTTATGGCCTGC‑TGTACGGCTGGCTGCCTATGGCCGGTGCCGCCGGtt > 2:509622/1‑150 (MQ=255) tCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGc < 1:2598637/129‑1 (MQ=255) tCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGc > 2:2598637/1‑129 (MQ=255) tCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGtt > 1:1712632/1‑150 (MQ=255) cATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGttt > 2:437367/1‑150 (MQ=255) ggTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCAt < 1:54019/150‑1 (MQ=255) gTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTCGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATc < 2:185563/150‑1 (MQ=255) tGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGaa < 2:1553163/150‑1 (MQ=255) tGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGaa < 1:211435/150‑1 (MQ=255) aaGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCCTGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCggctg > 1:1429636/1‑114 (MQ=255) aaGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCCTGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCggctg < 2:1429636/114‑1 (MQ=255) aaGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGAAGa > 1:152168/1‑150 (MQ=255) aaGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGAAGa > 2:2132585/1‑150 (MQ=255) tcagcggggCGCCGAGCGGCGCCCTGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGt < 1:646274/121‑1 (MQ=255) tcagcggggCGCCGAGCGGCGCCCTGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGt > 2:646274/7‑127 (MQ=255) cACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTc < 2:1744350/139‑1 (MQ=255) cACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTc > 1:1744350/1‑139 (MQ=255) aCCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCAGCGTGTG‑GGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGAAGACAGc > 1:966946/1‑150 (MQ=255) cccAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAAc < 1:10471/55‑1 (MQ=255) cccAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAAc > 2:10471/1‑55 (MQ=255) cccAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGAAGACAGca < 1:2132585/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGAtt < 1:1326294/69‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGAtt > 2:1326294/1‑69 (MQ=255) ccAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACaggcagccagccgcacagcaggccacaagtg > 1:2312211‑M1/1‑87 (MQ=255) ccAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACaggcagccagccgcacagcaggccacaagtg < 2:2312211‑M1/118‑32 (MQ=255) ggCGCCGAGCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGaa > 1:2725923/1‑138 (MQ=255) ggCGCCGAGCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGaa < 2:2725923/138‑1 (MQ=255) gcgcCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGtt < 2:2099811/129‑1 (MQ=255) | TGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCGTGAAATGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACCCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCGCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGCCACTTGTGGCCTGC‑TGTGCGGCTGGCTGCCTGTGGCCGGTGCCGCCGGTTTCATCGAAGACAGCAAGCTCAAG > NC_002947/2342001‑2342290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |