Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,252,535 | G→A | 5.5% | intergenic (+22/+221) | ureG → / ← PP_2851 | urease accessory protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,252,535 | 0 | G | A | 5.5% | 386.3 / 8.6 | 128 | intergenic (+22/+221) | ureG/PP_2851 | urease accessory protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (67/54); new base A (3/4); total (70/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.74e-01 |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GCGACACCCAGCGCATGCGGCCGCAGCGGCCCTGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC > NC_002947/3252392‑3252679 | gcgACACCCAGCGCATGCGGCCGCAGCGGCCCTGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTc > 1:1029569/1‑150 (MQ=255) cccAGCGCATGCGGCCGCAGCGGCCCTGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGTCTCTGTGCGGACATGCCCGcaca < 2:2802541/150‑1 (MQ=255) cAGCGCATGCGGCCGCAGCGGCCCTGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGACATGCCCGCACaga < 1:366121/150‑1 (MQ=255) cATGCGGCCGCAGCGGCCCTGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCa > 1:2979872/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAGCGGCCCTGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACaga < 2:2588922/140‑1 (MQ=255) tGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGTCTCTGTGCTGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTTGCACCgg < 2:456442/150‑1 (MQ=255) ggACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGACCACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGc < 1:1755482/150‑1 (MQ=255) gACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGCCTCTCTGCCGGCATCTTCGCACGGAGATCAACGCGGGGGCTGGGAACGGct > 2:504586/1‑150 (MQ=255) gACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGct < 2:1669595/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGctc < 2:2992677/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTg > 1:1423732/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATCTGACAGACGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGGGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTg > 1:2859407/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTcc < 2:677331/113‑1 (MQ=255) ttCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGc > 1:1374905/1‑150 (MQ=255) ttCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGc > 2:1045026/1‑150 (MQ=255) cAGCAACCTGAACGCGCTCGAGGGTTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCg < 2:2859407/150‑1 (MQ=255) aGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGt < 1:109955/129‑1 (MQ=255) aGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCgg > 2:438522/1‑150 (MQ=255) cAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTCTCGTCGGGCGCGGTGTGCTGGGGGGTCGAGGCTGACAGATCTAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGGCCAAGGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGgtg > 1:469335/1‑150 (MQ=255) cAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGgtg > 1:2069152/1‑150 (MQ=255) aaCCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGgtgt > 1:975999/1‑150 (MQ=255) cTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGTGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTcg > 1:93739/1‑150 (MQ=255) cTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCg < 2:3070047/143‑1 (MQ=255) cTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCg > 1:3070047/1‑143 (MQ=255) aagaagGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGCCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCgg > 1:2491088/1‑150 (MQ=255) gaagGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGt > 2:1432857/1‑150 (MQ=255) aagGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGtt < 1:732556/150‑1 (MQ=255) ggCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTAc < 1:1432857/150‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCgg > 1:504218/1‑136 (MQ=255) gTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCgg < 2:504218/136‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCT‑GGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATa > 2:2827689/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACgg < 2:67608/150‑1 (MQ=255) cGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCTCGAATACGGTAGc < 2:3050725/149‑1 (MQ=255) cGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAACACGGTAGc > 1:3050725/1‑149 (MQ=255) tGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGtggct < 2:366674/99‑1 (MQ=255) tGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGtggct > 1:366674/1‑99 (MQ=255) tGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGc < 1:2898132/150‑1 (MQ=255) aTCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGc > 1:3041413/1‑111 (MQ=255) cGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGtggctg < 1:870687/96‑1 (MQ=255) cGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGtggctg > 2:870687/1‑96 (MQ=255) gATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCgg > 2:321990/1‑120 (MQ=255) gATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATAc > 2:943841/1‑136 (MQ=255) gATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATAc < 1:943841/136‑1 (MQ=255) gATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGcaa > 2:2277584/1‑150 (MQ=255) aTTTTATCGTCGAGCGCGGGATGATGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCgg > 2:1888897/1‑119 (MQ=255) ttATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAAt < 2:2069152/150‑1 (MQ=255) ttATCGTCGAGCGCGGGATGCT‑GGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATg < 1:2827689/150‑1 (MQ=255) tATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATg > 1:1332567/1‑150 (MQ=255) tcgtcgAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGaa > 1:454015/1‑150 (MQ=255) tcgAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAAcgg > 1:1313275/1‑150 (MQ=255) gAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGACATGCCCGCACaga < 1:2539596/66‑1 (MQ=38) gAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGACATGCCCGCACaga > 2:2539596/1‑66 (MQ=38) aGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAAcggcgg < 2:1029569/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGc < 1:166422/134‑1 (MQ=255) gcgcGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGc > 2:166422/1‑134 (MQ=255) gcgcGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCggg > 1:2764047/1‑150 (MQ=255) gcgGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTg < 2:1536304/150‑1 (MQ=255) gggATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAg < 1:2611961/123‑1 (MQ=255) gggATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAg > 2:2611961/1‑123 (MQ=255) gggATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTggg > 2:3026540/1‑149 (MQ=255) gggATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGa > 2:2621582/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGaaa > 2:1604934/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTg < 2:1162828/150‑1 (MQ=255) tGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAGCAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCcagcag < 2:1374905/150‑1 (MQ=255) tGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCcagcag > 1:862033/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCcagcag > 1:571011/1‑150 (MQ=255) gAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATa < 1:629394/101‑1 (MQ=255) gAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATa > 2:629394/1‑101 (MQ=255) gAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggc > 2:763539/1‑150 (MQ=255) aGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTa > 2:814586/1‑105 (MQ=255) aGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTa < 1:814586/105‑1 (MQ=255) gCTGAGAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccgg > 1:2748299/1‑150 (MQ=255) gCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAAcggc > 2:387056/1‑124 (MQ=255) gCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAAcggc < 1:387056/124‑1 (MQ=255) tGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGggccggcc > 2:1490051/1‑150 (MQ=255) aCAGATCGAGGATTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTAGCGGCCGCAACAATGACCGGCGGATGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCctc < 1:546832/150‑1 (MQ=255) aCAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGcaacaa > 1:1015709/1‑112 (MQ=255) aCAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGcaacaa < 2:1015709/112‑1 (MQ=255) aTCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCctct < 2:773137/147‑1 (MQ=255) aTCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCctct > 1:773137/1‑147 (MQ=255) ggACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGt > 2:2356078/1‑150 (MQ=255) gtctctGTGCGGACATGCCCGCACAGAGTCCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGgtgt > 2:390711/3‑63 (MQ=18) gtctctGTGCGGACATGCCCGCACAGAGTCCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGgtgt < 1:390711/61‑1 (MQ=18) gACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTa > 1:1137965/1‑150 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGcaacaa < 2:1350159/99‑1 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGcaacaa > 1:1350159/1‑99 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGcaacaa > 1:936982/1‑99 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGcaacaa < 2:936982/99‑1 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:763539/150‑1 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:1843090/150‑1 (MQ=255) tctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:2174613/150‑1 (MQ=255) tctGTGCGGACATGCCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 2:2802201/1‑150 (MQ=255) gctGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:752528/149‑1 (MQ=255) tgtgCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACCATGAAAGGCGGATGGAAATTGGCCAACAGGGCCGGCCGCATCGCGGGTAAAccc > 2:160281/1‑150 (MQ=37) tgCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTg < 2:2433480/115‑1 (MQ=255) tgCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTg > 1:2433480/1‑115 (MQ=255) tgCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:571011/150‑1 (MQ=255) tgCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:1680596/1‑150 (MQ=255) gggCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGc > 2:1947384/1‑47 (MQ=255) gggCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGc < 1:1947384/47‑1 (MQ=255) | GCGACACCCAGCGCATGCGGCCGCAGCGGCCCTGGACCTTCAGCAACCTGAAGAAGGGCGAGGGGTTGCAGGCCGTGATCGATTTTATCGTCGAGCGCGGGATGCTGGGGGTGCGAGGCTGACAGATCGAGGACTCTGTGCGGGCATGTCCGCACAGAGACCAACGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTAGCGGCCGCAACAATGAACGGCGGGTGGAAATTGGCCAGCAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC > NC_002947/3252392‑3252679 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |