| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,520,124 | T→A | 6.3% | intergenic (+700/‑180) | PP_5580 → / → PP_5582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,520,124 | 0 | T | A | 6.3% | 293.9 / 9.6 | 96 | intergenic (+700/‑180) | PP_5580/PP_5582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/44); new base A (2/4); total (48/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCTTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGT > NC_002947/3519976‑3520270 | gCTTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATgctttctt < 1:2966453/150‑1 (MQ=255) tttGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTAt < 2:1315979/150‑1 (MQ=255) tttGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTAt > 1:1102083/1‑150 (MQ=255) tttGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTAt < 2:1102083/150‑1 (MQ=255) tgttaCGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTACCAATGCTTGCATaa < 2:780741/146‑2 (MQ=255) tGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgc < 1:1461477/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaag < 1:1830091/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaag < 1:2412995/150‑1 (MQ=255) gATGACGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTGATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGAGGGGGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATGAATGCTTGCGTATgcaaga > 2:1241851/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCATAagcaagca > 1:1311404/1‑150 (MQ=255) aaGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATa < 1:1018314/150‑1 (MQ=255) aGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCATAagcaagcattga < 2:1039885/150‑5 (MQ=255) aGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCACGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCACCACGGATAGTATCATTGCTTGCATAagcaagcattga < 1:2481883/150‑5 (MQ=255) gCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCt > 1:924730/1‑150 (MQ=255) gCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCt > 1:1132021/1‑150 (MQ=255) gCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCt > 2:2481669/1‑150 (MQ=255) gCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCt > 1:2372395/1‑150 (MQ=255) cTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTg < 1:350122/150‑1 (MQ=255) tATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGCATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTgg < 1:180365/150‑1 (MQ=255) aTTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaag > 1:1083694/1‑134 (MQ=255) aTTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaag < 2:1083694/134‑1 (MQ=255) tAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTAc < 1:813974/150‑1 (MQ=255) cTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGTTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGaa > 2:2651981/1‑146 (MQ=255) cTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGaa < 1:2651981/146‑1 (MQ=255) tGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaagc > 2:1267553/1‑124 (MQ=255) tGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaagc < 1:1267553/124‑1 (MQ=255) tGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATAtt < 2:924730/150‑1 (MQ=255) gggTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCa < 1:2042890/150‑1 (MQ=255) gTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCAtt > 1:2033750/1‑150 (MQ=255) tCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTg > 1:2849802/1‑150 (MQ=255) tatTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGc > 2:2048382/1‑150 (MQ=255) tCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCg > 2:2328761/1‑150 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGTTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTg < 1:2481669/150‑1 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGaaa > 2:729506/1‑145 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGaaa < 1:729506/145‑1 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTg < 2:2033750/150‑1 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTg < 1:2902604/150‑1 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTg < 2:2372395/150‑1 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACAATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCt > 2:275412/1‑111 (MQ=255) ccAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACAATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCt < 1:275412/111‑1 (MQ=255) cAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTgg > 2:1497444/1‑150 (MQ=255) tatCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCt > 1:261264/1‑150 (MQ=255) atCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCtt > 1:2146278/1‑150 (MQ=255) aTGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTa < 1:2048382/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGATCCTTGTTCACAGGTATTCATTGAGTGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAt < 1:1241851/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTTATCGATATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAtt > 2:1163562/1‑150 (MQ=255) cgccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATAtt < 1:2829508/110‑1 (MQ=255) cgccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATAtt > 2:2829508/1‑110 (MQ=255) gccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAttttt < 1:1163562/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTa < 1:2529507/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTa < 2:2750266/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGACGAGGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCGCGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc < 2:1460589/150‑1 (MQ=255) gaggaCGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTg < 1:1947613/91‑1 (MQ=255) gaggaCGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTg > 2:1947613/1‑91 (MQ=255) gATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGa < 2:2942585/143‑1 (MQ=255) gATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGa > 1:2942585/1‑143 (MQ=255) gATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAAt > 2:277162/1‑150 (MQ=255) gATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAAt > 1:1543422/1‑150 (MQ=255) aTGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGAGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAAtt > 2:1094292/1‑150 (MQ=255) gTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAAtgcttgct < 2:203953/59‑1 (MQ=255) gTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAAtgcttgct > 1:203953/1‑59 (MQ=255) gTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaa > 1:2980521/1‑150 (MQ=255) gTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCATAagcaagcattg < 1:1685970/72‑4 (MQ=38) gAATATTGGTGCTATGGATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaaaa < 1:1094195/150‑1 (MQ=255) tatTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTg > 1:2479229/1‑150 (MQ=255) atTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGc < 1:2328761/150‑1 (MQ=255) ttGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCa > 2:321887/1‑150 (MQ=255) gTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCt > 1:1063665/1‑150 (MQ=255) tGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAGGTGCACCtt > 2:6756/1‑150 (MQ=255) tGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTg > 2:1460165/1‑144 (MQ=255) cTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTa > 1:1448489/1‑150 (MQ=255) tATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTCTGGATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATACAGGGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTAc > 1:2548514/1‑150 (MQ=255) aTGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTTCACCTTTACa > 2:165157/1‑150 (MQ=255) aaaTATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACaaa < 2:2994779/149‑1 (MQ=255) gtaGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCt > 2:2051435/2‑150 (MQ=255) ataGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCt > 2:2041138/1‑150 (MQ=255) ggTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGc < 2:1348753/150‑1 (MQ=255) gtgtGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGAGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCt < 1:1094292/150‑1 (MQ=255) tgtgAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTg > 1:11134/1‑150 (MQ=255) gAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCg > 1:1011906/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGTTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGa > 1:2097613/1‑150 (MQ=255) cGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGc < 2:1063665/150‑1 (MQ=255) tATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTg > 2:1402280/1‑110 (MQ=255) tATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTg < 1:1402280/110‑1 (MQ=255) tATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTc > 1:2158537/1‑125 (MQ=255) tATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTc < 2:2158537/125‑1 (MQ=255) tATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTa > 2:2583751/1‑127 (MQ=255) tATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTa < 1:2583751/127‑1 (MQ=255) tCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgtt < 1:1497444/150‑1 (MQ=255) tattgcttgcaTAAGCAAGCATTAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgttt > 2:1349474/4‑150 (MQ=255) tattgcttgcaTAAGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgttt > 2:2917388/4‑150 (MQ=255) cAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgttt > 1:2669242/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGa > 1:2477093/1‑143 (MQ=255) aaTGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGa < 2:2477093/143‑1 (MQ=255) tgcttgctTATGAAAGCAATAGTGATACAGGTAAAGAAATAATCATTAAGCGAGATAGCGAAAGAGTGGTTGGCTTGTAAAAAAAAAAAAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATtgtttgtt < 2:1132021/150‑1 (MQ=255) cttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTtgttgt > 1:2615186/1‑150 (MQ=255) ttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTATAGAATGATACAGTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTtgtg < 2:2548514/150‑1 (MQ=255) tgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTgtgt < 2:2980521/150‑1 (MQ=255) gcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCGAAAGTGCACCTTTACaaa > 1:832774/1‑111 (MQ=255) gcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCGAAAGTGCACCTTTACaaa < 2:832774/111‑1 (MQ=255) | GCTTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGT > NC_002947/3519976‑3520270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |