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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 337,822 | 0 | A | C | 9.5% | 250.9 / 17.1 | 92 | intergenic (‑69/+60) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
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ataGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccaagcccaaccacctccacagcccccac < 2:1936501‑M2/113‑86 (MQ=255) ataGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccaagcccaaccacctccacagcccccac > 1:1936501‑M2/1‑28 (MQ=255) ataGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCa > 1:241963/1‑150 (MQ=255) aGCGCC‑A‑TATTCAAGGTTGGCGCTATacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcctgatc > 2:251206‑M2/1‑26 (MQ=255) aGCGCC‑A‑CACTCAAGGTTGGCGCTACacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcctgatc > 2:1329607‑M2/1‑26 (MQ=255) gcgcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTATacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgc < 2:1402070‑M2/87‑63 (MQ=255) gcgcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTATacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccaccacacatccttgccatgc > 1:1402070‑M2/1‑25 (MQ=255) gcgcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTATacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccac > 2:1451900‑M2/1‑25 (MQ=255) gcgcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTATacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccctcaaaaccac < 1:1451900‑M2/69‑45 (MQ=255) gcgcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGt < 1:1928501/150‑1 (MQ=255) cgcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTa > 2:1402022/1‑150 (MQ=255) gcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGAt < 2:3041479/140‑1 (MQ=255) gcC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGAt > 1:3041479/1‑140 (MQ=255) cc‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGa > 1:1411238/1‑150 (MQ=255) cc‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGa > 1:2453290/1‑150 (MQ=255) c‑a‑caTTCAAGGTTGGCGCTATaccagtgggagcgggcgtgccagcgaagaggccctcaaaaccactacacatccttgccatgcccaaccacctccacagcccccacctaagcacccgcttccaggccctcgaccagttcctgatcgagca < 2:991817‑M2/150‑130 (MQ=255) a‑caTTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAac > 1:510794/1‑150 (MQ=255) | CAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTT‑GAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCC‑A‑CATTCAAGGTTGGCGCTACACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAGTCAGTGAGGTCTCAGCGGCCTTGGCAGGCATCCACGCGCAACCAGCGCTCCAGCAGCTTGAAGCCTTGCACCAGCATGAACGAGATCACCAGGTAGAAC > NC_002947/337673‑337969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |