| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,778,504 | T→G | 6.3% | I270L (ATC→CTC) | pvdD ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,778,504 | 0 | T | G | 6.3% | 456.8 / 17.8 | 159 | I270L (ATC→CTC) | pvdD | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/67); new base G (6/4); total (88/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
ACGGTTGGCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGTTGCGC > NC_002947/4778355‑4778652 | aCGGTTGGCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATTAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAt < 1:1598827/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAtct > 1:1483936/1‑150 (MQ=255) ggCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGAt < 1:2305235/150‑1 (MQ=255) cGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGc < 1:2762972/150‑1 (MQ=255) gCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCcgcgc > 1:624833/1‑150 (MQ=255) ccACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGCTGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCTTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGCTCTCGGTGCCCACCCgcgcgc > 1:263616/1‑150 (MQ=255) ccACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCgcgcgc > 2:2571891/1‑150 (MQ=255) gcgcACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGcgcgccgcg < 1:2374739/150‑1 (MQ=255) cTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCt > 2:1718135/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGgcg > 1:1059502/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCa < 1:432275/150‑1 (MQ=255) cGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccg > 1:2040511/1‑150 (MQ=255) gCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccgg > 1:363286/1‑150 (MQ=255) tAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccggccgg < 2:363286/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGgcgc > 2:94645/1‑135 (MQ=255) gTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGgcgc < 1:94645/135‑1 (MQ=255) gcagcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGAGACTGCAGCAACACGGAATGGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGAt < 2:885812/150‑1 (MQ=255) gcagcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTCGCTGGGTGTCCGGCTGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGAt < 2:2384398/150‑1 (MQ=255) gcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTgg > 2:949547/1‑150 (MQ=255) gcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCACACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTgg > 1:2191287/1‑150 (MQ=255) gcaAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAGATCGATGcc > 1:2558030/1‑103 (MQ=255) caAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACCGCCTGCACCGAGATGCTCCCGGGCCAGTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGt < 1:687735/150‑1 (MQ=255) caAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGt > 1:2771995/1‑150 (MQ=255) aaGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTc < 2:206012/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCgg < 1:1077365/150‑1 (MQ=255) cTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGgc < 2:1277418/121‑1 (MQ=255) cTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGgc > 1:1277418/1‑121 (MQ=255) tGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCAccggccgg > 2:2016520/1‑132 (MQ=255) tGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCg < 2:842668/145‑1 (MQ=255) tGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAgg > 2:741487/1‑150 (MQ=255) tGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAgg > 2:1376401/1‑150 (MQ=255) tGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAgg > 2:434442/1‑150 (MQ=255) gAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCt > 2:2260357/1‑150 (MQ=255) aaCGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTg < 2:1059502/150‑1 (MQ=255) cGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAg > 1:2565993/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCAc > 2:2857372/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCg > 1:2847592/1‑150 (MQ=255) ccAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCg > 1:226706/1‑150 (MQ=255) cAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCgg > 2:287827/1‑150 (MQ=255) aGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGt < 2:1514693/150‑1 (MQ=255) gCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGTCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGtt > 2:374467/1‑150 (MQ=255) cAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGc > 2:2685523/1‑80 (MQ=255) cAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTg < 1:1207307/150‑1 (MQ=255) aaCAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGAATGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGc > 2:1198904/1‑150 (MQ=255) cAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTc > 1:1326889/1‑150 (MQ=255) aTGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGa > 1:2226422/1‑113 (MQ=255) aTGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGa < 2:2226422/113‑1 (MQ=255) aCAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGa < 1:1121052/150‑1 (MQ=255) cAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAg < 2:226706/150‑1 (MQ=255) aaGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCAATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAgg < 1:2872610/150‑1 (MQ=255) ggTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGgt < 2:2847592/150‑1 (MQ=255) tACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGa < 1:1522382/102‑1 (MQ=255) tACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGa > 2:1522382/1‑102 (MQ=255) tACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTc < 1:1198904/150‑1 (MQ=255) acCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCtt > 1:1940838/1‑150 (MQ=255) acCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGAAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCtt > 1:1781423/1‑150 (MQ=255) cccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGAGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTc < 2:627589/150‑1 (MQ=255) cccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGAGATCGATGccgt > 2:1167089/1‑59 (MQ=38) ccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCa > 1:1679949/1‑111 (MQ=255) ccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCa < 2:1679949/111‑1 (MQ=255) ccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCt < 1:1025716/115‑1 (MQ=255) ccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCt > 2:1025716/1‑115 (MQ=255) ccTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTcc < 1:1902740/131‑1 (MQ=255) cTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGcgcgccgcgc < 1:376111/73‑1 (MQ=255) tgagCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAg > 2:390/4‑150 (MQ=255) ggCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGa < 1:1788491/93‑1 (MQ=255) gCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTaa < 1:766724/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGc < 1:1001091/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTc > 1:3040915/1‑141 (MQ=255) ttGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTc < 2:3040915/141‑1 (MQ=255) tGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCa > 2:2537653/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCTTGAGCGATTGCAGCACCACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCt < 2:500732/150‑1 (MQ=255) cAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGt < 2:743054/93‑1 (MQ=255) ccTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTg < 1:827863/98‑1 (MQ=255) cTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCgcgc > 1:1522254/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCgcgc > 2:1467525/1‑150 (MQ=255) ttGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCa > 1:831428/1‑67 (MQ=255) ttGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCa < 2:831428/67‑1 (MQ=255) ttGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGcc > 2:2767309/1‑150 (MQ=255) gCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCt > 2:1847137/1‑150 (MQ=255) gcagcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCg < 1:741487/150‑1 (MQ=255) gcagcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCg > 1:2119976/1‑150 (MQ=255) cagcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCCCCCGCTGTCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGc < 2:1781423/150‑1 (MQ=255) cagcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTg < 1:37054/73‑1 (MQ=255) cagcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTg > 2:37054/1‑73 (MQ=255) cagcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGc > 2:1791711/1‑150 (MQ=255) cagcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGc > 2:1791231/1‑150 (MQ=255) agcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCt < 1:1791231/150‑1 (MQ=255) gcaACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCtt < 1:516566/150‑1 (MQ=255) caACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtc > 2:2242289/1‑150 (MQ=255) acacGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtcca > 1:407071/1‑150 (MQ=255) cacGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtccat > 2:2463032/1‑150 (MQ=255) tgggCATCGAGATCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtccatc > 1:2761347/3‑150 (MQ=255) gggCATCGAGATCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGa > 1:2077557/2‑99 (MQ=255) gggCATCGAGATCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGa < 2:2077557/98‑1 (MQ=255) cGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtccatcc > 2:978638/1‑150 (MQ=255) cGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTtccatcc > 2:2181876/1‑150 (MQ=255) cATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGt > 2:1790154/1‑150 (MQ=255) aTCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGtt < 1:1698919/150‑1 (MQ=255) aTCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGTTgcgc > 2:1846182/1‑150 (MQ=255) | ACGGTTGGCGATCGGTACGCCCACGCGCACCTGGGGCTGGCCGCTGTAGCGGTGCAGCAAGGTCTGGAACGATGCCAGCAACAGCATGAACAAGGTTACACCCTGGGCATTGGCCAACGCCTTGAGCGACTGCAGCAACACGGCATCGATCTCGATGCCCACCCGCGCGCCGCGCCCGCTGGGCGCCACCGGCCGGGAGCGATTGGTCGGCAGGCTGAGCACCGGTTGCTCCCCGCCGAGGGTGTCCTTCCAGTAAGCCAGCTGCCGCGCCTGCTCACCCGCTTCCATCCAGTTGCGC > NC_002947/4778355‑4778652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |