| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,986,096 | C→G | 5.6% | P97R (CCG→CGG) | flgA → | flagella basal body P‑ring formation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,986,096 | 0 | C | G | 5.6% | 461.9 / 14.9 | 146 | P97R (CCG→CGG) | flgA | flagella basal body P‑ring formation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (75/62); new base G (4/4); total (80/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGG > NC_002947/4985951‑4986234 | tttCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTg > 2:2503784/1‑150 (MQ=255)tttCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTg < 2:1233448/150‑1 (MQ=255) tCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCACGGCCCAGCGGCTggg > 2:1793255/1‑150 (MQ=255) tCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCACGGCCCAGCGGCTggg < 1:1793255/150‑1 (MQ=255) ttGACTTAACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCGAGACTGCCAACCGATATGAAATGCAGGTGAACCCGGTGGACCCACGCCTGAGCATGCCCTTGTGTGGCGAGCAGCTGGA‑GGTCTCACTGGTACGCCCGGACCAGCCCATGGGcc > 2:84688/1‑150 (MQ=255) aaTTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGAGCGCTTC‑CGCGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgtg > 2:1779970/1‑150 (MQ=255) aaTTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCACGGCCCAGCGGCTGGGCCggg < 1:2886344/150‑3 (MQ=255) aTTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgtgt > 1:2577945/1‑150 (MQ=255) aTTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgtgt > 1:492118/1‑150 (MQ=255) ttCTCCGTTGAAGATTATCTGTCGACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCAGGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGtgtg < 1:1534330/150‑1 (MQ=255) ttCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACACACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGtgtg > 2:366532/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTg > 1:1031990/1‑138 (MQ=255) aCCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTg < 2:1031990/138‑1 (MQ=255) aCCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGAc > 1:1227877/1‑149 (MQ=255) aCCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACg > 2:2660299/1‑150 (MQ=255) aaGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGa < 1:1039816/150‑1 (MQ=255) aGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGAt < 2:1217489/150‑1 (MQ=255) ttATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACg > 1:1324123/1‑150 (MQ=255) aTCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCTGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCt < 1:2719919/150‑1 (MQ=255) aTCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCt < 1:2871738/150‑1 (MQ=255) tCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTg < 2:1226947/150‑1 (MQ=255) tCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTg > 1:1947109/1‑150 (MQ=255) ccaccaCCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACg > 1:238073/1‑150 (MQ=255) caccacCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgt > 1:1688236/1‑124 (MQ=255) caccacCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCgt < 2:1688236/124‑1 (MQ=255) caccacCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACgg < 2:239102/150‑1 (MQ=255) caccacCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACgg > 2:2774128/1‑150 (MQ=255) caccacCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACgg > 2:1835585/1‑150 (MQ=255) accaccCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGgc > 1:296551/1‑150 (MQ=255) accaccCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCACGGCCCAGCGGCTGGGCCggg > 1:1477726/1‑122 (MQ=255) accaccCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCACGGCCCAGCGGCTGGGCCggg < 2:1477726/124‑3 (MQ=255) accCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGgcgcc > 2:2614647/1‑149 (MQ=255) accCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCgca > 2:835097/1‑150 (MQ=255) ccAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCgcagc > 2:2717759/1‑150 (MQ=255) ccAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACACCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCgcagc > 2:1177952/1‑150 (MQ=255) ccggccgCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGa < 1:2444662/150‑1 (MQ=255) cggccgCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGAc < 1:2389622/150‑1 (MQ=255) gccgCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACgg > 2:2438640/1‑150 (MQ=255) tATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTc < 1:1554088/150‑1 (MQ=255) tATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTc < 1:2438640/150‑1 (MQ=255) tATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTc > 2:2796525/1‑150 (MQ=255) tATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGGGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTc < 1:401056/150‑1 (MQ=255) gAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTg < 1:1835585/150‑1 (MQ=255) aaTCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGcc > 1:117233/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCgg > 2:2810739/1‑150 (MQ=255) cAGGTCAACCCGCCGATCCCAACCATTGGCCTTCCGTTTTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCTTGCCTTCGCCGTTCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGcc < 1:835097/150‑1 (MQ=255) aGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGAc > 1:2805162/1‑97 (MQ=255) ggTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCAc < 1:2989179/150‑1 (MQ=255) cAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGt < 1:608501/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACNCTGCAANGGCGCAGCACCGNGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGc < 1:2810739/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCg > 2:737042/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGa > 2:1702510/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGACCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGgcg > 2:2997366/1‑112 (MQ=255) gCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACt > 2:2316209/1‑150 (MQ=255) cccACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCcg > 1:2771415/1‑150 (MQ=255) cccACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCcg < 2:1257995/150‑1 (MQ=255) ccACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTg > 1:2206336/1‑113 (MQ=255) ccACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTg < 2:2206336/113‑1 (MQ=255) aCGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGTCGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGa > 1:1412916/1‑150 (MQ=255) tGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtgg > 2:1181551/1‑150 (MQ=255) tGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtgg < 2:1412916/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtg < 1:737042/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtg < 2:309526/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtggt > 1:193900/1‑150 (MQ=255) cGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGa < 1:3026284/150‑1 (MQ=255) cGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGa > 1:2325085/1‑150 (MQ=255) agccagcAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGa > 2:1842541/1‑142 (MQ=255) agccagcAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGAcccgcccg > 2:1294831/1‑150 (MQ=255) gccagcAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACccgcccgc < 1:1177952/150‑1 (MQ=255) cagcagCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTc > 1:602739/1‑150 (MQ=255) agcagcTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCa > 1:2609243/1‑150 (MQ=255) agcagcTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGGGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCa > 1:716365/1‑150 (MQ=255) gcagcTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCaa < 2:602739/150‑1 (MQ=255) gcagcTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCaa < 2:2903014/150‑1 (MQ=255) ttgca‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGCGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCAGGCCTCCTTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAgcgc < 1:328933/146‑1 (MQ=255) tGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGcgcg > 1:1258570/1‑150 (MQ=255) ggA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGa < 2:1375028/150‑1 (MQ=255) ggA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGa < 1:2388554/150‑1 (MQ=255) gA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGt < 1:817895/83‑1 (MQ=255) a‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGaca > 1:2332444/1‑150 (MQ=255) tCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACg < 2:1024963/150‑1 (MQ=255) tCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGACGGCCACCTTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACg > 2:93967/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTc > 2:1146749/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTc < 1:1702510/150‑1 (MQ=255) gAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAGCGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGc > 2:2213896/1‑150 (MQ=255) aaaGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggt > 2:954211/1‑112 (MQ=255) aaaGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggt < 1:954211/112‑1 (MQ=255) tcacacGGCCCAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGCCCCGCCCGCTCGAGCGCGGCAACACGGTCGGCGa > 2:711616/6‑150 (MQ=255) aGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGaa < 1:1553791/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAg < 1:1425880/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTAAAGATAAGGTCAAACGTTGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTTCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAg > 1:535532/1‑150 (MQ=255) cccGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAgg < 1:1294831/150‑1 (MQ=255) cacGGCCCAGCGGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCt > 2:452036/3‑123 (MQ=255) ccAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGATGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggt > 2:2369823/1‑102 (MQ=255) ccAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtg > 1:2221654/1‑103 (MQ=255) ccAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACgtggtggtg < 2:2221654/103‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAgc < 2:380139/122‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAgc > 1:380139/1‑122 (MQ=255) cGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTg > 1:1121336/1‑74 (MQ=255) cGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTg < 2:1121336/74‑1 (MQ=255) | TTTCTTGAATTCACCGTTGAAGATTATCTGTCCACCACCCAGACTGCCGGCCGCTATGAAATCCAGGTCAACCCGCTGGACCCACGCCTGCGCATGCCGTTGTGCAGCCAGCAGCTGGA‑CGCCTCACTGGAAAGCCCGGCCCAGCCGCTGGGCCGTGTGACGGTACGGATACGCTGCAACGGCGCAGCACCGTGGACGGTATTCGTGCCGGCCACCGTGCGACTTTTCCGCGACGTGGTGGTGGTGACCCGCCCGCTCAAGCGCGACAACACGGTCGGCGAAGG > NC_002947/4985951‑4986234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |