| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,172,360 | G→A | 7.7% | G216G (GGC→GGT) | fadD‑I ← | long‑chain‑fatty acid‑‑CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,172,360 | 0 | G | A | 7.7% | 300.2 / 10.4 | 104 | G216G (GGC→GGT) | fadD‑I | long‑chain‑fatty acid‑‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/42); new base A (3/5); total (57/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ACGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACGTACTTGATCACGCT > NC_002947/5172212‑5172509 | aCGCATAGATGTGGTAGATCGGCAGCGGGGTTATGAGGATTTCCCCGGCTTTTTCCTTCGTGATATCTAGCATTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTAccgc < 1:1897147/150‑1 (MQ=19)aCGCATAGATGTGGTACAGCCGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTAccgc < 2:2238919/150‑1 (MQ=255) gCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTAccgccg < 1:1207321/150‑1 (MQ=255) aTAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCggg > 1:722328/1‑149 (MQ=255) aTAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCggg > 1:1821303/1‑149 (MQ=255) aTAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGgt > 1:2804120/1‑150 (MQ=255) gATGTTTTACATCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCACCATTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGCTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGCGGTACCACCGgtgtg < 2:1244738/150‑2 (MQ=37) aTGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGCGGTACCACCGgtgtgg < 1:1231046/150‑3 (MQ=255) aTGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGCGGTACCACCGgtgtgg < 1:164169/150‑3 (MQ=255) tgtgGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTAccgc > 2:2489955/1‑141 (MQ=255) tgtgGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGACTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGCGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTAccgc < 1:2489955/141‑1 (MQ=255) tgGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTgc > 1:2672174/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTgcag > 1:1314030/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTgcag > 1:1556856/1‑150 (MQ=255) aCAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTgcagca > 1:739516/1‑150 (MQ=255) ggTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGtt < 2:3002243/150‑1 (MQ=255) atgaGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGcc > 2:1625788/1‑150 (MQ=255) gaGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGcc > 1:63729/1‑136 (MQ=255) gaGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGcc < 2:63729/136‑1 (MQ=255) gaGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTg > 2:911381/1‑150 (MQ=255) aGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGc < 1:2016618/150‑1 (MQ=255) aGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGc < 1:2104737/150‑1 (MQ=255) ggATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTAccgc < 1:438540/114‑1 (MQ=255) ttCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCgggct < 2:1584426/150‑3 (MQ=255) tCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTg < 1:1874049/150‑1 (MQ=255) gCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGc < 1:253370/150‑1 (MQ=255) ttCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTgcag < 2:1388966/114‑1 (MQ=255) ttCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGt < 1:1777337/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCAc > 1:1933853/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCAc < 1:911381/150‑1 (MQ=255) gTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCAc > 2:817377/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCTGCGGGACAGCATGGCGCCTTTGGTCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGc > 2:3049825/1‑150 (MQ=255) ggTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCt < 2:2993125/150‑1 (MQ=255) gTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTg > 2:1661711/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTg > 1:812565/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTg < 2:1933853/150‑1 (MQ=255) ttGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTgg < 2:2672174/150‑1 (MQ=255) gCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCtt > 1:2249022/1‑150 (MQ=255) cccATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTg > 2:2764438/1‑150 (MQ=255) cccATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCATTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTg < 2:958889/150‑1 (MQ=255) gTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGc > 1:1179721/1‑121 (MQ=255) gTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGc < 2:1179721/121‑1 (MQ=255) aCGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACCCCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAg > 1:255487/1‑150 (MQ=255) cGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAgg < 1:2986561/150‑1 (MQ=255) cGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAgg < 2:1314030/150‑1 (MQ=255) cGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAgg < 1:817377/150‑1 (MQ=255) gCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGc > 1:503766/1‑150 (MQ=255) tGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTTGGGGTTGCCGG‑TGGCTTCGGTCACGTGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCa > 2:859548/1‑150 (MQ=37) tGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCa > 1:1592548/1‑150 (MQ=255) cagcaTGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCAtt > 1:1547804/1‑150 (MQ=255) agcaTGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTg > 2:49346/1‑150 (MQ=255) gcaTGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGa < 1:49346/150‑1 (MQ=255) gcaTGGTGGCGACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGTTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGTCTTCGGTCACGGGCGGGCCCTGGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGa < 2:255487/150‑1 (MQ=255) aTGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGaaa < 1:893194/150‑1 (MQ=255) aTGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGCCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGaaa < 1:223248/150‑1 (MQ=255) tGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAAc < 2:1556856/150‑1 (MQ=255) ttGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCAt > 2:501277/1‑142 (MQ=255) ttGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCAt < 1:501277/142‑1 (MQ=255) tGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCa < 2:2018130/150‑1 (MQ=255) ggCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGGGCCTGTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGCTTGGCTTCGGTAAAGCGCTTGGTCTTGTCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCAc > 2:3023025/1‑150 (MQ=37) ggCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCAc < 1:1514399/150‑1 (MQ=255) gCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACg < 1:1661711/150‑1 (MQ=255) caccaGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGc > 2:1912243/1‑150 (MQ=255) caGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTg > 1:283450/1‑150 (MQ=255) aGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGc < 2:643587/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAg < 1:1912243/150‑1 (MQ=255) gTCAGCATGGGGCCTTTGGACACTCCGGTCGTACCGCCGGTGTACCGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTTATTGGAACGCACGGCCTGCGGGAGGTTGTAg < 2:2039809/150‑1 (MQ=255) gTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTg > 1:643392/1‑102 (MQ=255) gTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTg < 2:643392/102‑1 (MQ=255) tCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAgg > 1:1537254/1‑150 (MQ=255) aGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGcc > 1:2331747/1‑150 (MQ=255) ggCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCAc < 2:2804120/150‑1 (MQ=255) ggCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCATT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCAAGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCAc > 1:2371621/1‑150 (MQ=255) gcCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCAt > 2:1224907/1‑150 (MQ=255) ccTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCAtc > 2:97059/1‑150 (MQ=255) ggCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATcttctt < 2:1821303/150‑1 (MQ=255) cagtacacCGGCGGTACCACCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATcttctt > 1:543884/5‑150 (MQ=255) gCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCTGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTCCCGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCttcttc < 1:859548/150‑1 (MQ=255) agtacacCGGCGGTACCACCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAg < 1:1068692/122‑1 (MQ=255) agtacacCGGCGGTACCACCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAg > 2:1068692/4‑125 (MQ=255) gtacacCGGCGGTACCACCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAgc > 2:1742805/3‑89 (MQ=39) gtacacCGGCGGTACCACCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAgc < 1:1742805/87‑1 (MQ=39) ccACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCa > 1:2863556/1‑150 (MQ=255) cacaCCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGaaa < 1:2287117/106‑1 (MQ=255) cacaCCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCAc > 1:1017269/1‑150 (MQ=255) cacaCCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTAGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCAc > 1:419437/1‑150 (MQ=255) acacCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACg > 2:3035/1‑150 (MQ=255) acacCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACg > 1:776595/1‑150 (MQ=255) acacCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACg > 1:1630867/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCa < 1:531444/133‑1 (MQ=255) ccGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCa > 2:531444/1‑133 (MQ=255) gtggtACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCAtcttc > 1:2460933/1‑138 (MQ=255) gtggtACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCAtcttc < 2:2460933/138‑1 (MQ=255) tACCGCCGGTGTACTGAAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACGTACTTGATCa < 1:1875522/150‑1 (MQ=255) ccgccgGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACGTACTTGATCACg < 2:1017269/150‑1 (MQ=255) gccgGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGaaa > 1:1611411/1‑91 (MQ=255) gccgGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGaaa < 2:1611411/91‑1 (MQ=255) gccgGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCAtcttc > 2:3044743/1‑130 (MQ=255) gccgGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCAtcttc < 1:3044743/130‑1 (MQ=255) gccgGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACGTACTTGATCACGCt < 1:1748276/150‑1 (MQ=255) | ACGCATAGATGTGGTACAGCGGCAGCGGGGTGATGAGGATTTCGCAGCCTTCGTGCAGGTTGGAGCCCATCAGTGCACGGCACTGCAGCATGTTGGCCACCAGGTTGCGGTGGGTCAGCATGGCGCCTTTGGCCACACCGGTGGTACCGCCGGTGTACTGCAGCACCGCCACGTCGTT‑GGCCTGCGGGTTGGCTTCGGTCACGGGCTGGCCCTTGCCCAGCGCCAGGGCGTCATTGAAACGCACGGCCTGCGGCAGGTTGTAGGCCGGCACCATCTTCTTCACGTACTTGATCACGCT > NC_002947/5172212‑5172509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |