| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,614,754 | A→C | 7.8% | I273M (ATT→ATG) | hldE ← | bifunctional heptose 7‑phosphate kinase/heptose 1‑phosphate adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,614,754 | 0 | A | C | 7.8% | 403.0 / 21.6 | 147 | I273M (ATT→ATG) | hldE | bifunctional heptose 7‑phosphate kinase/heptose 1‑phosphate adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (64/71); new base C (5/7); total (69/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CAGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAGGCGCCCA > NC_002947/5614607‑5614902 | cAGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGNTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAAt > 1:2141057/1‑150 (MQ=255)cAGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAAt > 2:2487034/1‑150 (MQ=255) aGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATg > 1:727829/1‑150 (MQ=255) gccgcGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCcgc < 1:1051530/150‑1 (MQ=255) gcgTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGc > 2:819006/1‑150 (MQ=255) gcgTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGc < 1:2402998/150‑1 (MQ=255) gTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCaa < 1:2330537/150‑1 (MQ=255) ggAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAAt > 2:2416917/1‑135 (MQ=255) ggAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAAt < 1:2416917/135‑1 (MQ=255) gCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAAt < 1:1309631/132‑1 (MQ=255) ttCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAAt > 1:121832/1‑150 (MQ=255) ttCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAAt < 1:2600435/150‑1 (MQ=255) ttCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAAt < 1:1631383/150‑1 (MQ=255) ttCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCCGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAAt < 1:1458724/150‑1 (MQ=255) tCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATg > 1:1024670/1‑150 (MQ=255) ccTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGAAAAGGTGCAAATGa < 2:2293890/150‑1 (MQ=255) cTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGAc < 1:906560/150‑1 (MQ=255) tCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACa < 2:1024670/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGt > 2:1087276/1‑150 (MQ=255) cGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGAGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTa < 2:2945813/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCAGGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCgg < 2:742174/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCCATTGCCGCgggtg < 1:2897638/124‑4 (MQ=255) cccGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCAc > 1:999866/1‑150 (MQ=255) cgcAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTc < 2:536621/150‑1 (MQ=255) cAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGCCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTcac < 1:2487034/150‑1 (MQ=255) cTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATc < 1:1377832/150‑1 (MQ=255) aGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGTTTAGCCAGGGCCACCGAATGCGCCTGGTCCAATTGCCGCCCCCA‑CCCCCCGGGAAGTGTAGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGaa < 1:56429/150‑1 (MQ=255) aGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCCTGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGaa > 1:1906182/1‑150 (MQ=255) aGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGaa < 2:2749916/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCa > 2:1907160/1‑107 (MQ=255) gcTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTc > 1:2633237/1‑150 (MQ=255) tGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACAACAATCCCCGCTGCTAGGTTAGCCAGGACCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc < 2:727829/150‑1 (MQ=255) tGATGGCAGCCGTACCCAGCTTCCCTACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCACGGTCAAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc < 1:2493795/150‑1 (MQ=255) aTGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGGTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGt < 2:426493/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGTCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGcc > 2:987818/1‑150 (MQ=255) gCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGcc > 1:1433308/1‑150 (MQ=255) cAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGccc < 1:1959378/150‑1 (MQ=255) aGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCcg > 2:2922352/1‑150 (MQ=255) cGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCgcgc < 2:1382307/150‑1 (MQ=255) gTACCCAGTTTGCCGACCACAATGCCCGCGGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGTCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATTGCCGCCGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgca < 2:250801/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcaggcag < 1:1087276/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGc < 1:1625207/150‑1 (MQ=255) ccGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGt > 1:1984061/1‑83 (MQ=255) ccGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGt < 2:1984061/83‑1 (MQ=255) cGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGa < 2:1364608/85‑1 (MQ=255) cacaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCgg > 1:49737/1‑150 (MQ=255) cacaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCgg < 2:2249392/150‑1 (MQ=255) cacaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCgg > 2:1553326/1‑150 (MQ=255) aaTGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTc < 2:1508815/103‑1 (MQ=255) aaTGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTc > 1:1508815/1‑103 (MQ=255) cAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCaa > 1:1378992/1‑150 (MQ=255) aGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc < 1:2162243/106‑1 (MQ=255) aGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc > 2:2162243/1‑106 (MQ=255) gTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc < 1:621575/104‑1 (MQ=255) gTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc > 2:621575/1‑104 (MQ=255) gTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAg > 2:1875510/1‑150 (MQ=255) ttAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGTCCAACACGCAACAgg < 2:1186009/150‑1 (MQ=255) ttAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGGCCAACACGCAACAgg < 1:2953301/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTca > 1:1885974/1‑150 (MQ=255) aGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TTACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGa > 2:1303292/1‑129 (MQ=255) aGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TTACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCCGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGa < 1:1303292/129‑1 (MQ=255) aGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGc < 1:324131/117‑1 (MQ=255) ggCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgcc > 2:2181996/1‑150 (MQ=255) ggCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgcc < 2:49737/150‑1 (MQ=255) ccACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATAGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAacac > 1:459422/1‑132 (MQ=255) cACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTGACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCGACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGATcatgccatg > 1:1400386/1‑150 (MQ=255) cACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccatg < 1:256257/150‑1 (MQ=255) aCCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCCATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGATAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcag < 1:2674346/103‑1 (MQ=255) aCCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGATAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcag > 2:2674346/1‑103 (MQ=255) ccGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACa < 1:417086/56‑1 (MQ=255) ccGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACa > 2:417086/1‑56 (MQ=255) ccGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCt < 1:829017/150‑1 (MQ=255) cATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCAc > 2:1759354/1‑150 (MQ=255) aTGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCAcc > 2:796725/1‑150 (MQ=255) cAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcg < 1:1107123/79‑1 (MQ=255) cAGGTCC‑GCAGCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTAGCGCCGGCACCGGTCACATCGCACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGt < 2:1130142/150‑1 (MQ=255) aGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTg < 2:2550199/150‑1 (MQ=255) gTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGt > 1:850004/1‑60 (MQ=255) gTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGt < 2:850004/60‑1 (MQ=255) tCC‑TCACCAGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGGCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGAcc > 2:2039938/1‑150 (MQ=255) cc‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccat > 1:1805858/1‑132 (MQ=255) cc‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccat < 2:1805858/132‑1 (MQ=255) acccttgccGCGGCCATTGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCCCACCGCGGGt > 2:893781/8‑146 (MQ=255) tCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGATGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGc > 1:729241/1‑150 (MQ=255) ttgccGCGGCCATTGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGAc > 2:2417598/4‑105 (MQ=255) ttgccGCGGCCATTGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccat > 2:634118/4‑129 (MQ=255) cACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc < 2:2898897/72‑1 (MQ=255) cACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc > 1:2898897/1‑72 (MQ=255) cACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCa > 2:1772981/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCAGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCaa < 1:2190349/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGc > 2:1226369/1‑95 (MQ=255) cccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGc < 1:1226369/95‑1 (MQ=255) cccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAg > 2:2893986/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccat > 1:1779562/1‑126 (MQ=255) ccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAgg > 2:2080020/1‑150 (MQ=255) ccGCGAGAATGACCGCGGCAAGGGTGAAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGGGCCCGCGAAAGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAAGCGCATTCCATGCAAACCGCGTATGACCACCAAgg > 2:1096733/1‑150 (MQ=255) ggCAATGGCCGCGGCAAGCGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAGGCGcc < 2:3031331/150‑1 (MQ=255) cAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAGGCGCcca < 1:2224076/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgca > 1:2347074/1‑73 (MQ=255) aaTGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAg > 1:2933869/1‑142 (MQ=255) | CAGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCGCATGGGGCAGGTCC‑TCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAGGCGCCCA > NC_002947/5614607‑5614902 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |