New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5984491 | 45 (1.070) | 13 (0.370) | 10/220 | 2.4 | 23.6% | intergenic (+31/+58) | PP_5242/ycaC‑II | GAF domain‑containing sensor histidine kinase/putative hydrolase |
? | NC_002947 | = 5984511 | 47 (1.350) | intergenic (+51/+38) | PP_5242/ycaC‑II | GAF domain‑containing sensor histidine kinase/putative hydrolase |
TTCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTG > NC_002947/5984364‑5984656 | ttCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgc > 1:936477‑M2/1‑148 (MQ=255) cTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttac > 1:215542‑M2/1‑140 (MQ=255) cTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAgcgggtttac > 1:514055‑M2/1‑140 (MQ=255) tCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacc > 2:299631‑M2/1‑139 (MQ=255) tCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAgcgg < 2:493478‑M2/143‑5 (MQ=255) cAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGTTGGTGTCGCTGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttaccc > 1:220490‑M2/1‑138 (MQ=255) aGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccg < 2:985261‑M2/150‑14 (MQ=255) ccACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaa < 1:892439‑M2/150‑18 (MQ=255) ccACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaa < 1:788966‑M2/150‑18 (MQ=255) cggcggGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagag > 1:968867‑M2/1‑130 (MQ=255) cggcggGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagag > 2:892439‑M2/1‑130 (MQ=255) gcggGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggc > 1:985261‑M2/1‑128 (MQ=255) gggCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGACTATCGCCTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCa < 2:349690/150‑1 (MQ=38) tGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAgg < 2:788966/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACACGCTCCTACGGTCGGCTGTAGCGGCGGGGTTA‑CCCGCGTAGAGGCCCGTACAgg > 1:899306/1‑150 (MQ=39) cAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGTATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGtt < 1:596816/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTAAGTGCGGGTAAATCCGCTTCTGCTGTCGGCTGTAGAGGCGGGTTTA‑ACCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTa < 1:918537/150‑1 (MQ=255) cGCAGTTGCGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACGGGTTTACATCAGCGCGa < 1:395509/150‑1 (MQ=255) gggTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTCCAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAgc > 2:957446/1‑150 (MQ=255) tGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAgcgctggcctc > 2:573957/1‑134 (MQ=255) tGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAgcgctggcctc < 1:573957/141‑8 (MQ=255) gctggATTCGTCTCAATCTGCCTTTGACTCACGCATAGCGTTTTCCAGCCTCTTCTCGGGTTACCCCTCTCATGCGCGCGGCTGTATGTTCGGGTTTA‑CGCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTa < 1:496386/147‑1 (MQ=255) cGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggttta < 1:41632‑M2/96‑10 (MQ=255) cGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggttta > 2:41632‑M2/1‑87 (MQ=255) gtgtCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTtcat > 1:651365/1‑150 (MQ=255) gtCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTtcatca > 1:1680/1‑150 (MQ=255) ccgTCTGCCTTTGAATCACCCATCGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCCGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAgg < 1:518782/148‑1 (MQ=255) cAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAgg > 1:652696/1‑150 (MQ=255) tttGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTACCCCGCG‑AGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGACGCAAGCCCTGCGAAGCCGTTCATCAGGGTGCGGTAg > 1:809416/1‑150 (MQ=37) tCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGa > 1:940883/1‑107 (MQ=255) tCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGa < 2:940883/107‑1 (MQ=255) tCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGt < 1:380613/127‑1 (MQ=255) tCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGt > 2:380613/1‑127 (MQ=255) tCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTtcatca > 1:283514/1‑133 (MQ=255) tCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTtcatca < 2:283514/133‑1 (MQ=255) tCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTgggg > 2:559243/1‑150 (MQ=255) cGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATa < 2:651365/150‑1 (MQ=255) gCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGGAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCGAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATAc > 2:895113/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCg > 1:590152/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGAcagcag > 1:751394/1‑150 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAgg < 2:652696/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgc > 1:435746‑M2/1‑42 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgc < 2:435746‑M2/44‑3 (MQ=255) ctctTCGCGCGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGGTGTCGGGGCGGGGTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTa > 2:802098/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCt > 2:969847/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCt > 1:627056/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCtt < 1:969847/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGa > 2:934276/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCCCTACAGCCGACCGTCGGAGCGGGTATA‑CCCGCGCAGAGGCCGGCACAGGTTTAGATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTTATCACGTTGCGGTAGTTAGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTCCCCGCCCCTTCgtt > 2:159195/1‑148 (MQ=21) cccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacaccagcgcctgcagctgcccgccgtgggcctgagccacc < 2:110706‑M2/150‑126 (MQ=255) cccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatc < 2:247599‑M2/90‑66 (MQ=255) cccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatc > 1:247599‑M2/1‑25 (MQ=255) cccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGCGGCCGGCACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATg > 2:346295/1‑150 (MQ=25) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacaccagcgcctgcagctgcccgccgtgggcctgagccaccg < 2:678873‑M2/150‑127 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacaccagcgcctgcagctgcccgccgtgggcctga < 1:493478‑M2/143‑120 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacac < 2:815162‑M2/112‑89 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacac > 1:815162‑M2/1‑24 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactga < 2:696132‑M2/81‑58 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactga > 1:696132‑M2/1‑24 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccagtacaggttatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacaccagcgcctgcagctgcccgccgtgggcctgagcc < 2:692694‑M2/146‑123 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccagtacaggttatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacaccagcgcctgcagctgcccgccgtgggcctgagcc > 1:692694‑M2/1‑24 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 1:904932/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 2:148828/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacaccagcgcctgcagctgcccgccgtgggcctgagccaccga < 2:637734‑M2/150‑128 (MQ=255) cGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTc < 2:1680/150‑1 (MQ=255) cTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGt < 2:590152/150‑1 (MQ=255) cTACGGTCGGCTGTAGGGgcgggtttacccgcgaagaggccagtacaggttatgcgtgattcaaaggcagactgacacgaatccggcatccacccaactgcgacaccagcgcctgcagctgcccgccgtgggcctgagccaccgaactac > 2:238693‑M2/1‑18 (MQ=255) cTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTgc > 1:823430/1‑150 (MQ=255) cTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTgc < 2:809416/150‑1 (MQ=255) aCGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTgcgc > 1:46781/1‑150 (MQ=255) tCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGt > 2:557580/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACGGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTcgcg < 1:957446/149‑1 (MQ=255) tGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCgg > 2:444891/1‑150 (MQ=255) tAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTg < 2:627056/150‑1 (MQ=255) gggCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGa < 2:6538/125‑1 (MQ=255) gggCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGa > 1:6538/1‑125 (MQ=255) | TTCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGCGGGTTTA‑CCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCAGGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTG > NC_002947/5984364‑5984656 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |