Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,992,977 | Δ1 bp | 5.6% | coding (886/1233 nt) | bkdAA → | branched‑chain alpha‑keto acid dehydrogenase complex subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,992,977 | 0 | G | . | 5.6% | 226.8 / 7.9 | 71 | coding (886/1233 nt) | bkdAA | branched‑chain alpha‑keto acid dehydrogenase complex subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/40); new base . (2/2); total (29/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.80e-01 |
TTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATCGCCCGCCTGAAGCAGCACCTGATCAA > NC_002947/4992828‑4993125 | tttCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCcgcg > 2:1417890/1‑150 (MQ=255) cACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCt > 2:660515/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCTCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTggg < 1:1620267/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGc < 1:1587471/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCTTCGCCGGTGGAGAGTCGATCACCTTTCCCGGCCGTGGCGTGGTTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGccc < 2:1250339/150‑1 (MQ=255) aGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCaa > 2:1268281/1‑150 (MQ=255) gCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGc < 2:1323023/150‑1 (MQ=255) gCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGc < 1:1268281/150‑1 (MQ=255) gCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGc > 2:724259/1‑150 (MQ=255) gCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGc < 2:1535779/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCTCAAGCCTGa < 2:297384/150‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGAt < 1:273240/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATc < 2:1279237/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATc < 2:551326/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGa > 2:1482997/1‑150 (MQ=255) gTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGt < 1:660515/150‑1 (MQ=255) gTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGt < 2:963812/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGGTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGGCGCCGTGTACGCTCCCACGCGCGGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCGTGGGCCCAAGCCTGATCGGGTg < 2:1187155/150‑1 (MQ=255) ggCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTgg < 2:972856/150‑1 (MQ=255) aGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCACTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCa < 2:1059926/150‑1 (MQ=255) tCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACTGCAACGACTTCGTCGCCGTTTACGCGGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCAcc < 2:220928/150‑1 (MQ=255) accaccTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGACAATGCCGCGGACTGGGCCGAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTAc > 2:999127/1‑150 (MQ=255) ccaccTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTAcc < 2:938635/150‑1 (MQ=255) ccaccTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTAcc < 1:999127/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTg > 1:264524/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACAGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGc > 2:1423867/1‑150 (MQ=255) cTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGGGGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGc > 2:68304/1‑150 (MQ=255) cggccgTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGccc < 1:1482997/150‑1 (MQ=255) cggccgTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGccc < 2:493825/150‑1 (MQ=255) gccgTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCAGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGc > 2:1184763/1‑150 (MQ=255) gcgtggGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGa > 2:865934/1‑150 (MQ=255) cGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGgacga < 1:865934/150‑1 (MQ=255) aTTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGAcccc < 2:529231/150‑1 (MQ=255) tGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTc < 1:1417890/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTcc < 1:1254867/150‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGccc > 1:86250/1‑124 (MQ=255) cTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGccc < 2:86250/124‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCTCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCaa < 2:746028/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGC‑GCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAg > 1:425521/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGC‑GCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAg > 1:425326/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGAt > 2:1310833/1‑91 (MQ=255) tGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGAt < 1:1310833/91‑1 (MQ=255) gggTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGcc < 2:264524/150‑1 (MQ=255) ttGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTg > 2:182004/1‑150 (MQ=255) ggCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCAc > 1:1268027/1‑92 (MQ=255) ggCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCAc < 2:1268027/92‑1 (MQ=255) gCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATc < 1:1378964/80‑1 (MQ=255) gCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATc > 2:1378964/1‑80 (MQ=255) cAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGC‑GCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCgacgac < 2:425326/150‑1 (MQ=255) cAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGC‑GCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCgacgac < 2:425521/150‑1 (MQ=255) aaCGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCgacgac > 1:672576/1‑150 (MQ=255) aCGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGc > 1:660512/1‑142 (MQ=255) aCGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGc < 2:660512/142‑1 (MQ=255) aCGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACt < 2:286388/150‑1 (MQ=255) aCGACTTCGTCGCCGAGTACGCTGCCTCGCGCTGCGCCGCTGAGCGCGCCACCCGCGGCGTGGGCCCAAGCCTGATCGACTGGGTCACCTACCGTGCCGCCCCGCACTCGACGTCCGACGTCCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACt < 2:107936/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTgtt < 1:724259/150‑3 (MQ=255) cTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGACGACGACggggg > 2:1326919/1‑148 (MQ=255) ttCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGc > 2:319250/1‑150 (MQ=255) gtgtACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCg > 2:82529/1‑150 (MQ=255) aCGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTgg < 1:1326919/150‑1 (MQ=255) cTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGCCGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCCCTTCCCGCTGGGTg > 2:585879/1‑150 (MQ=255) ccTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCAGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGAcc > 1:894265/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTc > 1:1545695/1‑134 (MQ=255) cgcgCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTc < 2:1545695/134‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCAGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGa < 2:894265/150‑1 (MQ=255) cgcTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATc < 1:68304/150‑1 (MQ=255) gcTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTg < 2:576740/137‑1 (MQ=255) gcTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTg > 1:576740/1‑137 (MQ=255) gcTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATcg > 2:462442/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATCGCCCGCCTGaa > 2:1638407/1‑150 (MQ=255) cGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATCGCCCGCCTGaa < 2:451140/150‑1 (MQ=255) ccgccgCGGCCTGGGCCCAAGCCTGAGCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATCGCCCGCCTGAAGCAGCACCt > 1:221051/1‑150 (MQ=255) cgGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATCGCCCGCCTGAAGCAGCACCTGATCaa < 2:221051/150‑1 (MQ=255) | TTTCCACCTTCCAGGCCATCGCCGGTGGCGAGTCGACCACCTTTGCCGGCCGTGGCGTGGGTTGCGGTATTGCTTCGCTGCGGGTTGACGGCAACGACTTCGTCGCCGTGTACGCTGCCTCGCGCTGGGCGGCCGAGCGCGCCCGCCGCGGCCTGGGCCCAAGCCTGATCGAGTGGGTCACCTACCGTGCCGGCCCGCACTCGACGTCGGACGACCCCTCCAAGTACCGCCCTGCCGACGACTGGAGCCACTTCCCGCTGGGTGACCCGATCGCCCGCCTGAAGCAGCACCTGATCAA > NC_002947/4992828‑4993125 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |