| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,736,578:1 | +G | 7.4% | coding (924/1674 nt) | hutU ← | urocanate hydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,736,578 | 1 | . | G | 7.4% | 320.9 / 19.0 | 81 | coding (924/1674 nt) | hutU | urocanate hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (38/37); new base G (4/2); total (42/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
ACGCCGCGGCAGAACAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTC > NC_002947/5736429‑5736727 | aCGCCGCGGCAGAACAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGcc < 2:677753/150‑1 (MQ=255) gggCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATc < 1:1368137/150‑1 (MQ=255) ggCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCg > 2:612068/1‑150 (MQ=255) ggATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACt > 1:625228/1‑150 (MQ=255) ccGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTggcgg > 2:1147477/1‑150 (MQ=255) gACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCtt < 1:595199/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCa > 2:180569/1‑150 (MQ=255) cTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTg > 1:914094/1‑150 (MQ=255) tGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGc > 1:1501925/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCGTTGACCACTGCAg > 1:169585/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGtt < 1:1147477/150‑1 (MQ=255) gAAGGCATTGGCCATGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTc < 1:1074095/150‑1 (MQ=255) gAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtgct > 2:1590551/1‑114 (MQ=255) gAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCAtgct < 1:1590551/117‑4 (MQ=255) gAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGc > 1:304976/1‑144 (MQ=255) gAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGc < 2:304976/144‑1 (MQ=255) gAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTc < 1:244972/150‑1 (MQ=255) gAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTc < 1:1624383/150‑1 (MQ=255) aaGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCTTTGCC‑TGCACGTGCACGGCAATCGACTGCTGGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCg > 1:837660/1‑150 (MQ=255) ggCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGt < 1:1209768/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTg > 2:160390/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATc < 1:253236/108‑1 (MQ=255) ttGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATc > 2:253236/1‑108 (MQ=255) ttGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCa > 2:465065/1‑130 (MQ=255) ttGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCa < 1:465065/130‑1 (MQ=255) gcACGCCCTCGTGGTTGGCTATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCAc < 2:1501925/149‑1 (MQ=255) cACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACg > 1:713406/1‑150 (MQ=255) ctcctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATcgcg < 1:1054424/150‑1 (MQ=255) ctcctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATcgcg < 1:503399/150‑1 (MQ=255) ctcctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATcgcg < 1:160390/150‑1 (MQ=255) tcctcctTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCgg < 1:1595910/150‑1 (MQ=255) ttGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGTGGCCTTGACCACTGCAGCGGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGt > 2:416583/1‑150 (MQ=255) ttGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGt > 1:434061/1‑150 (MQ=255) ggCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCCGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTc < 2:29407/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTc < 2:713406/150‑1 (MQ=255) gCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTggcg > 2:679990/1‑91 (MQ=255) gCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTggcg < 1:679990/91‑1 (MQ=255) ggATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGc > 1:1039967/1‑150 (MQ=255) ttgttgCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGt < 1:1166013/140‑1 (MQ=255) ttgttgCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGt > 2:1166013/1‑140 (MQ=255) gttgCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGGACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTgg > 2:1442035/1‑150 (MQ=255) gCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCAGGcgg < 2:313296/150‑3 (MQ=255) gTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTa < 1:612068/150‑1 (MQ=255) tAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGt < 1:1556423/101‑1 (MQ=255) tAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGt > 2:1556423/1‑101 (MQ=255) tAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAg > 2:1524608/1‑150 (MQ=255) tAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAg > 1:772292/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc < 1:210899/123‑1 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTcc > 2:210899/1‑123 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGc < 1:745553/133‑1 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGc > 2:745553/1‑133 (MQ=255) tCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCg > 1:254484/1‑150 (MQ=255) gAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGtt > 2:538024/1‑150 (MQ=255) gTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGt < 1:525909/150‑1 (MQ=255) gTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGt < 1:1524608/150‑1 (MQ=255) tCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTg > 1:1423373/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGt < 1:180569/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑tgcacgtgcacg < 1:1453414/40‑1 (MQ=255) gCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑tgcacgtgcacg > 2:1453414/1‑40 (MQ=255) gcggCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTggg > 1:1550304/4‑150 (MQ=255) ccTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTggg > 2:244018/1‑150 (MQ=255) cTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgc > 2:892445/1‑150 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCCGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctg < 2:914094/150‑1 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCa < 2:815429/110‑1 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCa > 1:815429/1‑110 (MQ=255) ttCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctg < 1:695044/150‑1 (MQ=255) atCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctg < 1:1170072/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctggt > 2:1356855/1‑150 (MQ=255) ggAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctg < 2:352352/146‑1 (MQ=255) ggAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGctg > 1:352352/1‑146 (MQ=255) gAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGt < 2:416406/130‑1 (MQ=255) gAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGt > 1:416406/1‑130 (MQ=255) gAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgcgc < 2:1119471/143‑1 (MQ=255) gAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGgcgc > 1:1119471/1‑143 (MQ=255) tCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCg > 2:504155/1‑150 (MQ=255) ccAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCgg < 2:625228/150‑1 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGt > 2:251793/1‑150 (MQ=255) cAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGt < 2:772292/150‑1 (MQ=255) gCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGa > 1:10923/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGTGGCCTTTACCACTGCAGTCGGTTCGGTCTGCGCACGATCCCGGTACTGTTCCCAGGTCCATCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGGGGGTCGTGGGTGCTGGTCTGGTCGGTGa < 1:416583/150‑1 (MQ=255) gaTGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGa > 2:132847/2‑149 (MQ=255) gaTGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGa < 1:132847/148‑1 (MQ=255) gaTGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGAc > 2:940150/2‑150 (MQ=255) gaTGGCCGTGCACGTGCA‑GGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGAc > 1:312184/2‑150 (MQ=255) cc‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTCCAGCGGGTCCGGTCTGCGCACGATCGCTGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGt > 1:1265458/1‑150 (MQ=255) c‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTc > 1:1615396/1‑150 (MQ=255) | ACGCCGCGGCAGAACAGTGGGCGGATGTAGGCCGGGACGAAGCCTGGGAAGTCGAAGGCATTGGCCACGCCCTCCTCCTTGGCCATCTGGCGGATGTTGTTGCCGTAATCGAAGGTCGGGATGCCCTGCTTCTGGAAGTCCAGCATGGCC‑TGCACGTGCACGGCCATCGACTGCTTGGCGGCCTTGACCACTGCAGCCGGTTCGGTCTGCGCACGATCGCGGTACTGTTCCCAGGTCCAGCCGGCTGGCAGGTAGCCGTTCAGTGGGTCGTGGGCGCTGGTCTGGTCGGTGACCATGTC > NC_002947/5736429‑5736727 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |