| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,316,298:1 | +C | 5.9% | coding (59/1548 nt) | PP_2038 → | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,316,298 | 1 | . | C | 5.9% | 280.5 / 11.0 | 68 | coding (59/1548 nt) | PP_2038 | long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/28); new base C (2/2); total (38/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.61e-01 | |||||||||||
GCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGTGG > NC_002947/2316155‑2316447 | gCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGCCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGa > 2:1217202/1‑150 (MQ=255) gTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGt > 1:1464071/1‑142 (MQ=255) gTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGt < 2:1464071/142‑1 (MQ=255) tGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACTTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATGGGTTCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCg < 1:42025/150‑1 (MQ=255) gCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGc < 1:1398719/150‑1 (MQ=255) aTACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCca > 2:883521/1‑150 (MQ=255) cGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCacac > 2:1605950/1‑150 (MQ=255) cTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGc < 1:23661/150‑1 (MQ=255) tATTACTTGTCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGAc < 2:415915/150‑1 (MQ=255) ttGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCg > 1:1232392/1‑129 (MQ=255) ttGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCg < 2:1232392/129‑1 (MQ=255) tGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTGTTAACAGTCGACGAGAACAATAACGTGTACAGTTGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCt < 1:443129/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCcagac > 2:1574024/1‑127 (MQ=255) ccGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCCagac < 1:1574024/130‑1 (MQ=255) ccGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGc > 1:708453/1‑150 (MQ=255) cGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACAcc > 2:1237480/1‑122 (MQ=255) cGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACAcc < 1:1237480/122‑1 (MQ=255) gTTTCGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTGCCCAGTCGAAGTGCCAGACACTGGCCTGACCGTATGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGc < 1:1605950/150‑1 (MQ=255) cATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTg < 2:44898/118‑1 (MQ=255) cATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTg > 1:44898/1‑118 (MQ=255) tcgatcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCcagac > 2:735597/1‑106 (MQ=255) tcgatcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGTCGATC‑ACCGCCagac < 1:735597/109‑1 (MQ=255) catcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTg < 2:754430/149‑1 (MQ=255) tcgGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGc > 1:156466/1‑150 (MQ=255) gTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGGCCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTc > 2:1125096/1‑149 (MQ=255) gTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTc < 1:1125096/149‑1 (MQ=255) ttAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGcc > 1:1055793/1‑150 (MQ=255) aaCCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCtt > 2:710719/1‑150 (MQ=255) ccGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGc > 1:332606/1‑150 (MQ=255) cGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga > 2:654933/1‑80 (MQ=255) cGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑Ga < 1:654933/80‑1 (MQ=255) aacaacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGc > 2:1470823/1‑150 (MQ=255) aacaacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGc > 1:813498/1‑150 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAAc < 2:173669/117‑1 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAAc > 1:173669/1‑117 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATc > 1:1168995/1‑150 (MQ=255) aacaacGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATc > 1:1580301/1‑150 (MQ=255) tGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACgg < 2:529573/150‑1 (MQ=255) gAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACggg > 1:1170042/1‑150 (MQ=255) aCCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCg > 2:1326570/1‑150 (MQ=255) aCCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCg > 1:1395247/1‑150 (MQ=255) ttGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCCCGGGCGAGc > 1:233261/1‑150 (MQ=255) aaCCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGt > 1:231315/1‑150 (MQ=255) ccTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCt > 1:1301731/1‑102 (MQ=255) ccTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCt < 2:1301731/102‑1 (MQ=255) cTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGcc > 2:874436/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATc < 2:813498/150‑1 (MQ=255) aGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAAc > 2:1229677/1‑90 (MQ=255) aGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAAc < 1:1229677/90‑1 (MQ=255) tCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGgc < 2:227365/150‑1 (MQ=255) gAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTGTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGgcgc > 1:1454840/1‑150 (MQ=255) tGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCaa < 2:1263939/150‑1 (MQ=255) ccAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCAc < 2:212784/118‑1 (MQ=255) ccAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCAc > 1:212784/1‑118 (MQ=255) ccAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAAcc > 2:1479823/1‑150 (MQ=255) tACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGccc < 2:1597706/141‑1 (MQ=255) tACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGccc > 1:1597706/1‑141 (MQ=255) tGGCCTGAACGTCTTTCGGT‑GATCTACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGaa < 2:1168995/150‑1 (MQ=255) ggCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAAc < 2:445499/150‑1 (MQ=255) cTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACtgg > 1:404403/1‑150 (MQ=255) tGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATcc > 2:1149707/1‑125 (MQ=255) tGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATcc < 1:1149707/125‑1 (MQ=255) tGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACtggt > 1:482721/1‑150 (MQ=255) gAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACtggtg < 2:404403/150‑1 (MQ=255) gAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACtggtg > 1:79263/1‑150 (MQ=255) aCGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGa > 1:174694/1‑150 (MQ=255) cGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGaa < 1:1217202/150‑1 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCagag > 2:1594817/1‑150 (MQ=255) gCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCagag < 2:156466/150‑1 (MQ=255) ggT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGt < 1:1326570/150‑1 (MQ=255) t‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGTgg < 1:883521/150‑1 (MQ=255) | GCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGAGAACAACAACGTGAACCTTGGAACCCTATCCAGTCGAAGTGCCAGATACTGGCCTGAACGTCTGGCGGT‑GATCGACCGCCACACCCGGCTGACCTTCGCTCAGCTCGAACAACGGGCCAACCAGCTGGCCTCGGCCTTGCTGGCACAGGGCATCGCCACGGGCGAGCATGTCGCCATCCTGGCGCCCAACCGCGCCGAACTGGTGGAAGCAGAGGTGG > NC_002947/2316155‑2316447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |