| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4350173 = | 65 (1.090) | 11 (0.210) | 9/206 | NT | 17.0% | intergenic (‑181/+56) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein |
| ? | NC_002947 | 4350224 = | 52 (1.010) | intergenic (‑232/+5) | galU/PP_3822 | UTP‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/cytochrome c family protein | |||||
TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350338‑4350173‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGG > NC_002947/4350224‑4350370 TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGA > 2:1212917/1‑150TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGA < 2:483538/150‑1 AGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGCGATCACCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAA < 1:1277882/150‑1 GGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAG < 1:415667/150‑1 GGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAG < 1:555473/150‑1 GGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGG < 1:1212917/150‑1 ATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCC < 1:420169/150‑1 ATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCGGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCC < 2:1622534/150‑1 ATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCA > 2:247529/1‑150 AGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGG > 2:385507/1‑150 GGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGA < 1:1349085/128‑1 GGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGA > 2:1349085/1‑128 ATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAG > 2:912321/1‑68 ATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAG < 1:912321/68‑1 GGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATG > 1:592205/1‑150 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGG < 1:866762/118‑1 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGG > 2:866762/1‑118 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTG > 2:1536993/1‑117 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTG < 1:1536993/117‑1 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCA < 1:926852/73‑1 GGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCA > 2:926852/1‑73 CTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTAACCGTCCCTT > 1:74498/1‑61 CTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTAACCGTCCCTT < 2:74498/61‑1 GGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCCACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTAC < 2:592205/150‑1 GCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACC > 1:1203878/1‑150 GAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGC < 2:109879/150‑1 GAGGCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGC < 1:1636445/150‑1 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGC < 1:967181/150‑1 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATT < 2:1278600/86‑1 GCCGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATT > 1:1278600/1‑86 CGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGCTCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTC > 1:1108775/1‑150 CGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTC > 2:739145/1‑150 CGCCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTC > 1:156232/1‑150 CCACCGGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGT < 2:420169/150‑1 GGCTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGG < 2:312560/150‑1 TAGAGGGATCCATCGAGAAGACGCGGGTGAAGTTTCATGCCAATGATGGGGTTAACCTGTATGGTAAGCAGGTTGATGGGGTGCTGATCGGACAAGGGACGGGTAGCTGAGGTAAGCCGGTGGCGGCCTCTTGGCGCGTGAGCCCGTCGAAGAGGCCGCCACCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4350338‑4350173‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aagaggccgccaccggcTTACCTCAGCTACCCGTCCCTTGTCCGATCAGCACCCCATCAACCTGCTTACCATACAGGTTAACCCCATCATTGGCATGAAACTTCACCCGCGTCTTCTCGATGGATCCCTCTACCAACCGCGGGTCCTGTGGCCGCTCGTGGCGG > NC_002947/4350224‑4350370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |