New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1340018 | 51 (0.850) | 5 (0.090) | 5/228 | NT | 8.5% | coding (583/897 nt) | PP_1164 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1340032 | 59 (1.040) | coding (597/897 nt) | PP_1164 | LysR family transcriptional regulator |
GACCGTTGCCCGACTCCGGGTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGGCTGCTGTCGTACCAGGT > NC_002947/1339872‑1340166 | gACCGTTGCCCGACTCCGGGTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑t > 1:228785/1‑150 (MQ=255) aCCGTTGCCCGACTCCGGGTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑c < 2:228785/150‑1 (MQ=255) cccGACTCCGGGTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACAAACAACATG‑T‑CGCCGCGt > 2:828966/1‑150 (MQ=255) ccGACTCAGGGTTGACGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTg > 2:645340/1‑150 (MQ=255) aCTCCGGGTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGg > 1:287213‑M2/1‑149 (MQ=255) gggTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGggttgg > 1:433977‑M2/1‑144 (MQ=255) gTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGgcg < 2:504300/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGa > 1:914089/1‑150 (MQ=255) gTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑c > 1:1565863/1‑116 (MQ=255) gTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑c < 2:1565863/116‑1 (MQ=255) gggCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCCGCA‑CGCGGCGA‑CAggttggtggtgccgattatcgcatgc > 2:1325901‑M2/1‑124 (MQ=255) aGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCg > 2:163827/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGgg < 2:518181‑M2/118‑3 (MQ=255) tGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGgg > 1:518181‑M2/1‑116 (MQ=255) gcggcgCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCGCCAACCCG‑CACGCGGCGA‑CAggttggtggtgccgattatc < 2:583123‑M2/135‑21 (MQ=255) gcggcgCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCGCCAACCCG‑CACGCGGCGA‑CAggttggtggtgccgattatc > 1:583123‑M2/1‑115 (MQ=255) cggcgCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTCCCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTg < 1:363637/150‑1 (MQ=255) cggcgCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTg < 1:687523/150‑1 (MQ=255) ggcgCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTgg > 1:35896/1‑150 (MQ=255) gcATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTgc > 2:806221/1‑150 (MQ=255) ttgtGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATg > 1:819608/1‑150 (MQ=255) gtgtgCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGaa > 1:763544/1‑150 (MQ=255) gtgtgCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGaa < 1:806221/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCATCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCcgc < 2:398628/150‑1 (MQ=255) cTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGa < 1:966338/112‑1 (MQ=255) cTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGa > 2:966338/1‑112 (MQ=255) cTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGAc > 1:423932/1‑117 (MQ=255) cTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGAc < 2:423932/117‑1 (MQ=255) cTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTgcgc > 1:341977/1‑139 (MQ=255) cTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTgcgc < 2:341977/139‑1 (MQ=255) tCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCgg < 1:813251/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCa > 1:1578898/1‑150 (MQ=255) ggCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAg < 2:1578898/150‑1 (MQ=255) gcgcCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCaa > 2:912956/1‑150 (MQ=255) gcCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTAGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATg > 1:1033215/1‑150 (MQ=255) ggTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACggg < 1:912956/150‑1 (MQ=255) ccGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGa < 1:1598412/85‑1 (MQ=255) ccGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGa > 2:1598412/1‑85 (MQ=255) ccGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGa < 1:1142785/124‑1 (MQ=255) ccGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGa > 2:1142785/1‑124 (MQ=255) gAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGc > 1:932403/1‑150 (MQ=255) aaGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGc > 1:1060078/1‑91 (MQ=255) aaGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGc < 2:1060078/91‑1 (MQ=255) cccGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGc < 2:656042/150‑1 (MQ=255) gTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCaa < 1:1015421/126‑1 (MQ=255) gTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCaa > 2:1015421/1‑126 (MQ=255) aCCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGt < 2:1169615/67‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGt > 1:1169615/1‑67 (MQ=255) aCCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAgcggcg > 1:747485/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAg > 2:257426/1‑72 (MQ=255) gCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAg < 1:257426/72‑1 (MQ=255) ggCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGa < 2:914089/150‑1 (MQ=255) gCATGCGATAATCGGCACCACCAACCtgtcgccgcgtgcgggttggtggtgccgattatcgcatgcccggccaggtccgacgggtgcttcggcacaccatggcgcgccaggtagtcgggcgaggcacacaacatgcgccgcaccctgccc > 2:1325901‑M1/1‑26 (MQ=255) tGCGATAATCGGCACCACCAACCcgcacgcggcgacaggtt > 1:350562‑M1/1‑23 (MQ=255) tGCGATAATCGGCACCACCAACCcgcacgcggcgacaggtt < 2:350562‑M1/41‑19 (MQ=255) gATAATCGGCACCACCAACCtgtcgccgcgtgcgggttggcggtgccgattatcgcatgcccggccaggtccgacgggtgcttcggcacaccatggcgcgccaggtagtcgggcgaggcacacaacatgcgccgc > 1:583123‑M1/1‑20 (MQ=255) gATAATCGGCACCACCAACCtgtcgccgcgtgcgggttggcggtgccgattatcgcatgcccggccaggtccgacgggtgcttcggcacaccatggcgcgccaggtagtcgggcgaggcacacaacatgcgccgc < 2:583123‑M1/135‑116 (MQ=255) gATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCt > 2:977956/1‑138 (MQ=255) gATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCt < 1:977956/138‑1 (MQ=255) gATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCg > 2:1478931/1‑150 (MQ=255) tCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGgctgc > 2:4701/1‑150 (MQ=255) ggCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGGctgctg < 2:35896/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAg > 2:454556/1‑42 (MQ=255) gCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAg < 1:454556/42‑1 (MQ=255) ccaccaACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTggg < 1:1146387/130‑1 (MQ=255) ccaccaACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTggg > 2:1146387/1‑130 (MQ=255) accaACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGGCTGCTGTCGTAc < 1:163827/150‑1 (MQ=255) ccaACCcgcacgcggcgacaggttggtggtgccgattatcgcatgcccggccaggtccgacgggtgcttcggcacaccatggcgcgccaggtagtcgggcgaggcacacaacatgcgccgcaccctgcccacccgcagcgccttcaaccc > 1:433977‑M1/1‑6 (MQ=255) caACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATTACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGAtt > 2:1320714/1‑130 (MQ=255) caACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATTACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGAtt < 1:1320714/130‑1 (MQ=255) aaCCTG‑T‑CGCCGCGTGCGggttggtggtgccgattatcgca > 1:350562‑M2/1‑18 (MQ=255) aaCCTG‑T‑CGCCGCGTGCGggttggtggtgccgattatcgca < 2:350562‑M2/41‑24 (MQ=255) aaCCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGGCTGCTGTCGTACCAg < 2:1293481/150‑1 (MQ=255) aaCCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGGCTGCTGTCGTACCAg < 1:1085152/150‑1 (MQ=255) cccgcacgcggcgacaggttggtggtgccgattatcgcatgcccggccaggtccgacgggtgcttcggcacaccatggcgcgccaggtagtcgggcgaggcacacaacatgcgccgca > 1:518181‑M1/1‑2 (MQ=255) cccgcacgcggcgacaggttggtggtgccgattatcgcatgcccggccaggtccgacgggtgcttcggcacaccatggcgcgccaggtagtcgggcgaggcacacaacatgcgccgca < 2:518181‑M1/118‑117 (MQ=255) ccTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCTGACCTTGGTGCGCATGAAGCCACGGCTGACCGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGGCTGCTGTCGTACCAGGt < 1:197788/150‑1 (MQ=255) ccgcacgcggcgacaggttggtggtgccgattatcgcatgcccggccaggtccgacgggtgcttcggcacaccatggcgcgccaggtagtcgggcgaggcacacaacatgcgccgcaccctgcccacccgcagcgccttcaacccggagt > 1:287213‑M1/1‑1 (MQ=255) | GACCGTTGCCCGACTCCGGGTTGAAGGCGCTGCGGGTGGGCAGGGTGCGGCGCATGTTGTGTGCCTCGCCCGACTACCTGGCGCGCCATGGTGTGCCGAAGCACCCGTCGGACCTGGCCGGGCATGCGATAATCGGCACCACCAACCTG‑T‑CGCCGCGTGCGGGTTGGCGCTTCGGAGTGACCGACGAGCCGACCTTGGTGCGCATGAAGCCGCGGCTGACGGTCACCAGCAATGACGGGGCAATCGCAGCTGCCAGCGGCGGGCTGGGGATTGCCCGGCTGCTGTCGTACCAGGT > NC_002947/1339872‑1340166 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |