New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2962001 = | 67 (1.120) | 4 (0.070) | 4/228 | NT | 5.7% | coding (296/1023 nt) | fatB | ferric anguibactin‑binding protein |
? | NC_002947 | 2962030 = | 68 (1.200) | coding (267/1023 nt) | fatB | ferric anguibactin‑binding protein |
GTCATAGTGGTTGGCCTGCAGCGAGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTG > NC_002947/2961853‑2962150 | ggcagccacagcggcaccggcgaacaccacgcgccatggcgactacacgccgttaaccgtacagcacaaactgggcaccacagtgatcagtcaactgccacagcgcacggtggctctggacatgaacgaagtggacttcctcgaccagtt > 2:424922‑M1/149‑150 (MQ=255) cATAGTGGTTGGCCTGCAGCGAGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTgg < 2:984796/150‑1 (MQ=255) gccacagcggcaccggcgaacaccacgcgccatggcgactacacgccgttaaccgtacagcacaaactgggcaccacagtgatcagtcaactgccacagcgcacggtggctctggacatgaacgaagtggacttcctcgaccagTTGGGc > 2:984627‑M1/145‑150 (MQ=255) gTTGGCCTGCAGCGAGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGc‑‑c > 2:1638443/1‑150 (MQ=255) tGCAGCGAGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑Cg < 1:1608128/150‑1 (MQ=255) gCAGCGAGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑Cgg < 1:765503/150‑1 (MQ=255) gCGAGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCTGTCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTa > 1:1206869/1‑150 (MQ=255) aGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGc > 2:241211/1‑150 (MQ=255) gatcaggatcagGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGACATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCaa < 1:1004097/150‑1 (MQ=255) tcaggatcaggTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGc‑‑cc > 1:798398/1‑131 (MQ=255) tcaggatcaggTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGc‑‑cc < 2:798398/131‑1 (MQ=255) tcaggatcaggTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACt > 1:931120/1‑150 (MQ=255) gatcaggTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGc > 2:1327216/1‑140 (MQ=255) gatcaggTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGc < 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gCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCagag < 2:1204186/150‑1 (MQ=255) ggTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCaa > 2:222548/1‑109 (MQ=255) ggTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCaa < 1:222548/109‑1 (MQ=255) ttGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTg > 1:533582/1‑150 (MQ=255) tcgggCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTg < 1:978869/148‑1 (MQ=255) gCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGGATGCAACGCCCAGCCGGTA‑‑‑CCTGCTGGGCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTTCAAAGCCACCGTgctcg > 1:1427172/1‑147 (MQ=255) 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GTCATAGTGGTTGGCCTGCAGCGAGGTGATCAGGATCAGGTCAGGCCGCGCCGCATGCACCCGCTCCAGGTTGGGCTGCACGATCGAGCCGACATCTGCCGTTTGCCCGGCATCCTTATAGCGTGCAAGAAAGTCCGGCACGAAGTCCTTGGGCATGC‑‑CCGCCA‑CGGGTACGCCCAACTGGTCGAGGAAGTCCACTTCGTTCATGTCCAGAGCCACCGTGCGCTGTGGCAGTTGACTGATCACTGTGGTGCCCAGTTTGTGCTGTACGGTTAACGGCGTGTAGTCGCCATGGCGCGTG > NC_002947/2961853‑2962150 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |