New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4573251 = | 61 (1.020) | 7 (0.150) | 8/190 | NT | 11.1% | intergenic (+15/‑122) | PP_4054/glgX | hypothetical protein/glycogen debranching enzyme |
? | NC_002947 | 4573318 = | 64 (1.350) | intergenic (+82/‑55) | PP_4054/glgX | hypothetical protein/glycogen debranching enzyme |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AAGGCAGCCCCGCGCAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACC > NC_002947/4573105‑4573399 | aGGCAGCCCCGCGCAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCG > 2:159852‑M1/1‑150 (MQ=255) ccaggtggcgccgagggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggttcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCgg > 1:268571‑M1/143‑150 (MQ=255) caggtggcgcggagggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggtgcgagcgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCggg < 2:1609251‑M1/9‑1 (MQ=255) caggtggcgccgagggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggtgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCggg < 2:649488‑M1/9‑1 (MQ=255) cccGCGCAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAA > 1:1506890‑M1/1‑150 (MQ=255) tggcgccgagggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggtgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTaaa < 1:158291‑M1/13‑1 (MQ=255) ccGCGCAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAA > 2:819659‑M1/1‑150 (MQ=255) ccGCGCAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTACCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAA > 1:189323‑M1/1‑150 (MQ=255) cgcgCAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 2:443359‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgccgagggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggtgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTAAAcc > 2:19989‑M1/136‑150 (MQ=255) cAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGC < 2:818374‑M1/150‑1 (MQ=255) cagaaggCAGCGGCCAAGCCGCAGGCGCCTGCCAAACCCAACCCCGGGCCCCTGCCGCGGGGCAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGGAAACCCGCT > 2:438109‑M1/2‑150 (MQ=255) gagggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggtgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:138030‑M1/131‑150 (MQ=255) gggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggtgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:745166‑M1/22‑1 (MQ=255) ggggaagggcatgccttcgcgaatgcgcgatggtgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:1187728‑M1/23‑1 (MQ=255) cAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGACGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:1160367/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTtcat < 2:1553589/150‑1 (MQ=255) aaGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTtcatca > 1:1239022/1‑150 (MQ=255) gCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATcaca > 2:190919/1‑150 (MQ=255) gAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGgc > 2:1488959/1‑150 (MQ=255) aGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGgcgc < 2:1239022/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAt > 2:476154‑M2/1‑149 (MQ=255) gcCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgt < 2:5782‑M2/150‑4 (MQ=255) ccTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAtgcgcctgtgatgaacctgta < 1:1311681‑M1/150‑22 (MQ=255) cTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtag < 1:875128‑M2/150‑6 (MQ=255) tGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtagg < 1:1529389‑M2/150‑7 (MQ=255) gAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcg < 2:1418195‑M2/150‑11 (MQ=255) tggtgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCgg > 1:649488‑M1/98‑150 (MQ=255) aCCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcggg > 1:208600‑M2/1‑138 (MQ=255) tgcgaccgagcgggttttctttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTAAAc < 2:533625‑M1/14‑1 (MQ=255) ccAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtt < 2:847351‑M2/150‑15 (MQ=255) ccAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGAGCAggtagaagcgggtt < 2:912856‑M2/150‑15 (MQ=255) ggcTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtttacccgc < 1:1445005‑M2/150‑22 (MQ=255) ggcTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgg > 1:271818‑M2/1‑129 (MQ=255) ggcTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgg < 2:271818‑M2/140‑12 (MQ=255) tgccctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAtgcgcctgtgatgaacctgtaggagcgggtttacccgcgaa < 2:1506890‑M1/150‑42 (MQ=255) tgccctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:746073‑M2/150‑25 (MQ=255) tgccctgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:688610‑M2/1‑126 (MQ=255) ccctaccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGt < 2:189323/150‑1 (MQ=255) tgccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGc < 2:1590171/150‑1 (MQ=255) ccGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCAAAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCa > 1:500301/1‑150 (MQ=255) cGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtttaccc < 2:418115‑M2/137‑20 (MQ=255) cGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtgtaggagcgggtttaccc > 1:418115‑M2/1‑118 (MQ=255) tttggggtgcgggggctcatgacgatcctcgagtggccgtgatggaaggggaattgtgctgtcctgcattggccaCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGc < 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gCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCAc > 1:745166/1‑150 (MQ=255) cTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACTCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCAccc > 2:1110239/1‑150 (MQ=255) cGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAg > 2:917430/1‑150 (MQ=255) cGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAg > 2:967129/1‑150 (MQ=255) cGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGACACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAg > 1:827544/1‑150 (MQ=255) gggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGa > 2:126435/1‑150 (MQ=255) gggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGa > 2:122231/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtg > 2:160108‑M2/1‑46 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCAtg < 1:160108‑M2/48‑3 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGaaa > 1:1492702/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTCGCCAATGCAGGACAGCACAAGTCCCGTTCCATCACGGCCACTCTTGGATCGTTCTGAGTCCCCGCACCCCAAAGaaa > 2:1414622/1‑150 (MQ=38) ccaCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGCGCCTGTGATGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCAGAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGaaaa < 2:59179‑M1/147‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGaaaa < 2:26290/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGaaaa > 2:1349736/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATc > 2:1168435/1‑121 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATc < 1:1168435/121‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAAc < 1:979883/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAAc < 1:967129/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCCTCATAGTTCTCCGCACCCCAAAGAAAAcc > 2:378731/1‑150 (MQ=38) | AAGGCAGCCCCGCGCAAGAAGGCAGCGGCCAAGCCGAAGGCGCCTGCCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACC > NC_002947/4573105‑4573399 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |