| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 478264 = | 54 (0.900) | 6 (0.130) | 6/180 | NT | 15.5% | intergenic (+9/+101) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase |
| ? | NC_002947 | 478359 = | 25 (0.560) | intergenic (+104/+6) | PP_0393/cca | 2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑ hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase/multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase | |||||
CGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAA > NC_002947/478213‑478503 | aaaggtgaacggctgaaagcgctcgaggcttaccagcgcggttagacctatCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAg > 2:991742‑M1/52‑150 (MQ=255) gCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCATGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCt < 1:290800/150‑1 (MQ=255) cTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTaa > 2:1195498/1‑150 (MQ=255) cTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTaa > 2:133843/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTgg > 1:822044/1‑150 (MQ=255) gCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGcc > 1:38877/1‑150 (MQ=255) ttGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCgcgc > 2:112967/1‑123 (MQ=255) ttGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCgcgc < 1:112967/123‑1 (MQ=255) gCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCAc > 1:1234459/1‑150 (MQ=255) gCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCAc < 1:1195498/150‑1 (MQ=255) cTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCt < 1:423972/150‑1 (MQ=255) gTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 2:822044/150‑1 (MQ=255) ctaccggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgATAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt > 2:991742‑M2/100‑150 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACAGTGGGGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGc > 2:56395‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAg > 2:38877‑M1/1‑150 (MQ=255) GGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGt < 1:1130522‑M1/150‑1 (MQ=255) AAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt > 1:406945‑M1/1‑130 (MQ=255) AAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 2:406945‑M1/130‑1 (MQ=255) cccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCAc > 2:592435‑M2/77‑123 (MQ=255) cccgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCAc < 1:592435‑M2/47‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTaa > 1:304079‑M1/1‑97 (MQ=255) CCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTaa < 2:304079‑M1/97‑1 (MQ=255) cgctcctacagggggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCg > 2:1506562‑M2/75‑150 (MQ=255) CCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCa > 2:1130522‑M1/1‑150 (MQ=255) TACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCa > 2:1043486‑M1/1‑148 (MQ=255) TACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCa < 1:1043486‑M1/148‑1 (MQ=255) gacgGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTGCCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGccc > 2:1210344/1‑150 (MQ=255) gggcacacatcagaggttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCt < 1:1506562‑M2/88‑1 (MQ=255) gCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGACTGACCGGTCAGCCCGGCTTg > 1:1225332/1‑150 (MQ=255) tGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCa < 2:1234459/150‑1 (MQ=255) ccAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAAc < 1:133843/150‑1 (MQ=255) tctGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTg > 2:1370325/1‑99 (MQ=255) tctGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTg < 1:1370325/99‑1 (MQ=255) tctGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTg < 2:251902/119‑1 (MQ=255) tctGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTg > 1:251902/1‑119 (MQ=255) gttgggctcagcccgtcgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgATAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTc < 1:991742‑M2/103‑1 (MQ=255) tGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt > 1:976646/1‑96 (MQ=255) tGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCttt < 2:976646/96‑1 (MQ=255) gtg‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCTCGAAGAGGCCGGTAGGt < 2:840193/45‑1 (MQ=255) gtg‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGt > 1:840193/1‑45 (MQ=255) g‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGa < 1:1144380/90‑1 (MQ=255) g‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGa > 2:1144380/1‑90 (MQ=255) ccccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCAGCGCt > 2:1273836/1‑150 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTcgcg > 2:1037441/1‑150 (MQ=255) tGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTcgcg > 1:59793/1‑150 (MQ=255) taggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTc > 2:1277997‑M2/30‑89 (MQ=255) taggagcgggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTGTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTc < 1:1277997‑M2/60‑1 (MQ=255) ggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCgctgc < 1:478924‑M2/129‑1 (MQ=255) ggtttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCgctgc > 2:478924‑M2/22‑150 (MQ=255) gtttacccgcgaagaggccgATAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCgctgct > 1:1106559‑M2/21‑150 (MQ=255) ttacccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCtgctgc < 2:1571316‑M2/132‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCtgctgc < 1:1244267‑M2/132‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCtgctgc > 2:1244267‑M2/15‑146 (MQ=255) ccgcgaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCt > 1:75432‑M2/15‑150 (MQ=255) gaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCa > 1:502689‑M2/11‑90 (MQ=255) gaagaggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCa < 2:502689‑M2/80‑1 (MQ=255) caagcggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACCTCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCa < 1:1222238‑M2/140‑1 (MQ=255) ggccgGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGCCAGCCCGGCTTGCATCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTaa < 1:1273836‑M2/145‑1 (MQ=255) | CGTGGCCTTTGAGTGGCGCGGGTTGCAGTTGACGCCCGCTTGAGCCTGTATCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGACGGGCTGAGCCCAACCTCTGATGTGTG‑CCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTAGGTCTAACCGCGCTGGTAAGCCTCGAGCGCTTTCAGCCGTTCACCTTTGAGTGCTTCGCCCAGTGCCTGACCGGTCAGCCCGGCTTGCACCAACGGCTTCACATCCACCGCTCGCGCCGCCGCTGCTGCGCCTCGCAGGTAA > NC_002947/478213‑478503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |