New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2934858 = | 60 (1.000) | 3 (0.050) | 3/230 | NT | 5.4% | coding (532/927 nt) | PP_2567 | alpha/beta family hydrolase |
? | NC_002947 | 2934924 = | 48 (0.840) | coding (598/927 nt) | PP_2567 | alpha/beta family hydrolase |
GCGCATGGTACAGCGCAGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTACCTGCTGTTCGGCCGCCAGGGGGCC > NC_002947/2934779‑2935073 | gcgcATGGTACAGCGCAGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCt < 2:172722/150‑1 (MQ=255) gcATGGTACAGCGCAGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGc > 2:489209/1‑150 (MQ=255) gcATGGTACAGCGCAGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGCCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGc > 2:1122148/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGCAGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAg > 2:1223692/1‑150 (MQ=255) aCAGCGCAGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCt < 1:489209/150‑1 (MQ=255) aGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGAt < 2:275068/150‑1 (MQ=255) aGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGAt < 1:409834/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGc > 1:1337736/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTAtt < 1:1223692/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCt > 1:273062/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCt > 2:1386255/1‑150 (MQ=255) cGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCt > 1:273021/1‑150 (MQ=255) gggTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTg < 1:257893/150‑1 (MQ=255) ggTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGAACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTgg < 1:1634067/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGgc < 2:1337736/150‑1 (MQ=255) gAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGAc > 1:1618015/1‑150 (MQ=255) gTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTg > 2:1363814/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTgg > 2:1028446/1‑150 (MQ=255) ttCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGccc > 2:1626197/1‑150 (MQ=255) acCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCa > 1:1517215/1‑150 (MQ=255) ccTGGACAACGCCCTGGGGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACCCGGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGATCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCAt < 2:137528/150‑1 (MQ=255) ccTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCAt < 1:1028446/150‑1 (MQ=255) ccTGGACAACGCCATTTCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCAt > 1:56066/1‑150 (MQ=255) gACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCa < 1:1492754/150‑1 (MQ=255) aCAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCAc < 2:1360535/150‑1 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATg < 1:1492747/144‑1 (MQ=255) aaCGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATg > 2:1492747/1‑144 (MQ=255) gCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGAcc > 2:1366463/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGa < 1:1366463/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTAGCGCCACGACCCGCGACTTGGATTGCCCGAACCCATGGCACTGACCGa > 2:267711/1‑150 (MQ=255) gcagcgccagcagccgagcggcaccttccgacagttcggtgtccagccgctcgcggcgttgcgcGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGa > 1:438166‑M2/65‑150 (MQ=255) AACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAg < 2:658321‑M1/150‑1 (MQ=255) AACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAg < 1:582977‑M1/150‑1 (MQ=255) cgccagcagccgagcggcaccttccgacagttcggtgtccagccgctcgcggcgttgcgcGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCa > 2:241305‑M2/61‑98 (MQ=255) cgccagcagccgagcggcaccttccgacagttcggtgtccagccgctcgcggcgttgcgcGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCa < 1:241305‑M2/38‑1 (MQ=255) ggCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGc < 1:1363814/150‑1 (MQ=255) tGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCa > 1:19194/1‑150 (MQ=255) acCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGc > 2:223456/1‑72 (MQ=255) acCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGc < 1:223456/72‑1 (MQ=255) acCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAgc < 1:1469691/124‑1 (MQ=255) acCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAgc > 2:1469691/1‑124 (MQ=255) acCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGc > 2:1246704/1‑147 (MQ=255) acCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGc < 1:1246704/147‑1 (MQ=255) cTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGc < 1:1386255/150‑1 (MQ=255) tGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCt < 2:1517215/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTGCCGCGCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGccc < 2:232948/150‑1 (MQ=255) gAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGAc < 1:179596/126‑1 (MQ=255) gAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGAc > 2:179596/1‑126 (MQ=255) gAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCg > 1:1256261/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTa > 1:1509783/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAgcg > 2:1359257/1‑98 (MQ=255) ctgctgGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAgcg < 1:1359257/98‑1 (MQ=255) tgctgGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCTACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTACCTGCTGTTCg > 2:1146278/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTACCTGCTGTTCg > 2:851172/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTACCTGCTGTTCGgccg > 2:1041100/1‑150 (MQ=255) cgcTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTACCTGCTGTTCGgccgcc > 1:403650/1‑150 (MQ=255) gACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTACCTGCTGTTCGGCCGCCAGGGGGcc < 2:438166/150‑1 (MQ=255) | GCGCATGGTACAGCGCAGCCAGTTGCCGGGTTTTGCCGAGCCGGATGTTGGTCGCTTCGACGACCTGGACAACGCCCTGGCGCAACGCCGCGAGCGGCTGGACACCGAACTGTCGGAAGGTGCCGCTCGGCTGCTGGCGCTGCGCGACCTGCTACAGCTGGACGATGGCTATTGCTGGCGCCACGACCCGCGACTGGTATTGCCCGAACCCATGCCACTGACCGAGCGCGAAGCCTGCGACCTGCTCAGCCAGATCCGCTGCCCGTTGTACCTGCTGTTCGGCCGCCAGGGGGCC > NC_002947/2934779‑2935073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |