| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,569,751 | C→A | 8.4% | L183L (CTG→CTT) | nnrD ← | ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,569,751 | 0 | C | A | 8.4% | 208.5 / 5.5 | 67 | L183L (CTG→CTT) | nnrD | ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/34); new base A (3/3); total (30/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCTGCCAGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAGGCATCGGCATC > NC_002947/5569604‑5569900 | ggCTGCCAGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCAAg > 2:1050068/1‑150 (MQ=255) aGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGAACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTgcgc > 2:1644306/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCAAGCTGgcgcgcc < 1:1050068/150‑2 (MQ=255) cAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCAc > 2:588293/1‑150 (MQ=255) cAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCAc < 1:45609/150‑1 (MQ=255) tCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCat > 1:946668/1‑149 (MQ=255) aGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCAACAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACTCAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAggg < 2:136149/150‑1 (MQ=255) acaTCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCTCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCgg > 1:822481/1‑150 (MQ=255) acaTCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCgg < 1:159772/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCTCGCGCGCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTc < 2:1621409/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTc > 2:890027/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGc < 1:386348/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGcc < 2:1304875/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGcc > 1:955792/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGt < 2:696699/150‑1 (MQ=255) gccggcgccggcCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCAACTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGTGTCAGCTTGCGCGAAGCACGAGGGAGGTCAGCCTGTAc > 1:15148/1‑150 (MQ=255) cgccggcCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCt > 1:271143/1‑150 (MQ=255) gcCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTg < 2:1505191/150‑1 (MQ=255) aTCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCa > 2:206156/1‑150 (MQ=255) tGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGcc > 2:622414/1‑150 (MQ=255) cccGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCATGTCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCATTGccactgag < 2:946668/150‑7 (MQ=255) ccGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGATGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCagcagc > 2:534932/1‑150 (MQ=255) cgcgCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgcc > 2:174073/1‑150 (MQ=255) cGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgccg < 2:1505951/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGt < 1:843495/100‑1 (MQ=255) gCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGt > 2:843495/1‑100 (MQ=255) cAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGAGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTAAAGCCTCAGTAACCATGCCCAGCAACCCCGCCGCCTccccctg > 2:732979/1‑148 (MQ=255) gCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGt < 1:890027/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTg < 1:737474/150‑1 (MQ=255) ggggCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGCCGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAgg < 1:588293/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGAt < 2:1640203/150‑1 (MQ=255) tGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGAtgct < 2:478903/150‑1 (MQ=255) caccaGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAAGGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGcc > 2:219817/1‑150 (MQ=255) accaGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgcc < 1:1638515/117‑1 (MQ=255) accaGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgcc > 2:1638515/1‑117 (MQ=255) ccaGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCAc > 2:123146/1‑150 (MQ=255) aGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTg < 1:206156/150‑1 (MQ=255) ccGGCACCTTTGAGTACACAGATGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAgg < 1:534932/150‑1 (MQ=255) ccGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAgg < 2:1466486/150‑1 (MQ=255) ccGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGAAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAgg < 2:271143/150‑1 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCcagca > 2:471651/1‑99 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCcagca < 1:471651/99‑1 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgc < 2:728130/106‑1 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgc > 1:728130/1‑106 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAggg > 2:1049867/1‑150 (MQ=255) ggCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCca < 2:810227/95‑1 (MQ=255) ggCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCca > 1:810227/1‑95 (MQ=255) aCCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTaa > 2:1338485/1‑125 (MQ=255) aCCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTaa < 1:1338485/125‑1 (MQ=255) aCCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGAtgc > 1:1094188/1‑131 (MQ=255) aCCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGAtgc < 2:1094188/131‑1 (MQ=255) cTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCg < 1:870017/150‑1 (MQ=255) ttGAGTACACAGACGCTGTTATACCGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCggg < 1:520552/150‑1 (MQ=255) ttGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGc < 2:531391/147‑1 (MQ=255) ttGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGc > 1:531391/1‑147 (MQ=255) ttGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCggg < 1:123146/150‑1 (MQ=255) gAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGt > 1:1323823/1‑150 (MQ=255) acacAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTcgc < 2:687818/150‑1 (MQ=255) cacaGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTcgcg > 2:438040/1‑150 (MQ=255) gACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAg < 2:955792/150‑1 (MQ=255) ataACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCaa < 1:174073/150‑1 (MQ=255) taACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTgg > 1:773123/1‑58 (MQ=255) taACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTgg < 2:773123/58‑1 (MQ=255) ctgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCgggg > 2:972629/3‑127 (MQ=255) ctgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCgggg < 1:972629/125‑1 (MQ=255) tgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCa < 1:641743/113‑1 (MQ=255) tgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCa > 2:641743/2‑114 (MQ=255) cAGCTTGCGCGCAGCACCCGGGCGGTAAGCCTGTACGGCCTGAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCTGCCTCCCCAGGCTGCGCAGTACGGATGCTGCAACTGGGAAGGGCCAGCGGGATTTTCGCCATGAAATTCAAggcatcggcatc < 2:431047/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAggcatcggcatc < 1:438040/150‑1 (MQ=255) | GGCTGCCAGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAGGCATCGGCATC > NC_002947/5569604‑5569900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |