Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,984,751 | C→A | 7.0% | G142V (GGC→GTC) | ycaC‑II ← | putative hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,984,751 | 0 | C | A | 7.0% | 222.2 / 3.5 | 72 | G142V (GGC→GTC) | ycaC‑II | putative hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/38); new base A (2/3); total (31/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
AGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGACGAAGTCTTC > NC_002947/5984613‑5984893 | agcagGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAg > 2:1453461/1‑144 (MQ=255) agcagGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAg < 1:1453461/144‑1 (MQ=255) cagGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCTTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGt < 1:1318599/150‑1 (MQ=255) agGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTc < 2:551250/150‑1 (MQ=255) gTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTcac > 1:454885/1‑150 (MQ=255) tACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTcacca < 1:1498011/150‑1 (MQ=255) tACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTcacca < 2:475687/150‑1 (MQ=255) cccAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACg > 1:1336958/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAgg < 2:743790/135‑1 (MQ=255) ccAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAgg > 1:743790/1‑135 (MQ=255) cAGCCCTTCGATGTCGGTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGACCGATGCCTCGGGcaccttcaa < 2:698086/150‑6 (MQ=38) gCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAaca < 2:1336958/150‑1 (MQ=255) cTTCGATGTCGTTGCGCCGGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAGCCTGTTCATCATCTGCGCCCCCGCCTGGGTCATCCGTACCCAAGCGGGTTGCTGCACCGTTTCGTTGAAGGTGTCGGAGGCAGCGGTCACCTCGacaacta > 2:151807/1‑144 (MQ=25) ttCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTc > 1:607791/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGCACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACAGTTTCGTTGAAGGTGCCCCAGGCATCGGAAACCACGAACACTTCAAAACCTTc > 2:378374/1‑150 (MQ=39) gTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTc < 2:607791/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTcc < 1:1315291/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTcc > 1:164881/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTcc < 2:164881/150‑1 (MQ=255) gTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAgcgc < 1:27315/150‑1 (MQ=255) cggCCAAGGAGAACGATTGGATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAgg < 2:41508/149‑1 (MQ=255) ggCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACTAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGc > 1:917482/1‑150 (MQ=255) gCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTc > 2:22679/1‑122 (MQ=255) gCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTc < 1:22679/122‑1 (MQ=255) ccACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCAAGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCa < 1:378374/150‑1 (MQ=255) ccACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACACGCCTGGGTTGTGCGTACCGAACCCGCTCGCTGCACGGTTTCGTGGAAGGTGCCCGAGGAATCGGTCACCACGAACACTTCCACCCCTTACGCTACCGCCGACAGCGTCGGGAAGGCCa < 2:1177337/150‑1 (MQ=255) cACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCgg > 1:1066282/1‑141 (MQ=255) cACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCgg < 2:1066282/141‑1 (MQ=255) aCCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACGCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGt > 2:1296928/1‑95 (MQ=255) aCCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGt < 1:1296928/95‑1 (MQ=255) cAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCaaaa > 2:654023/1‑105 (MQ=255) cAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCaaaa < 1:654023/105‑1 (MQ=255) aGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGc < 1:1508060/136‑1 (MQ=255) aGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGc > 2:1508060/1‑136 (MQ=255) tcatcaTCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTca < 1:148078/150‑1 (MQ=255) catcatCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTcac > 2:1099509/1‑150 (MQ=255) catcTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAgg < 1:677967/128‑1 (MQ=255) catcTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAgg > 2:677967/1‑128 (MQ=255) atcTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCCAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACcaca < 2:1253339/150‑1 (MQ=255) atcTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCAACGATTTGGTGAAGGTGGCCTATTTAGCTGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTTCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACcaca > 1:444261/1‑150 (MQ=255) tcTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCacac < 2:444261/150‑1 (MQ=255) tcTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCacac > 1:901994/1‑150 (MQ=255) cACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGACCGATGCCTCGGGcac < 1:846569/73‑1 (MQ=38) cACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGACCGATGCCTCGGGcac > 2:846569/1‑73 (MQ=38) aCCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCgat > 1:127640/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCg < 2:441421/148‑1 (MQ=255) aCCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCg > 1:441421/1‑148 (MQ=255) ccGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGGTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCgatga < 2:659240/150‑1 (MQ=255) cGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCaaaa < 2:988659/72‑1 (MQ=255) cGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCaaaa > 1:988659/1‑72 (MQ=255) ccAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAg < 2:1310469/40‑1 (MQ=255) ccAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAg > 1:1310469/1‑40 (MQ=255) ccAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCgat < 2:186841/129‑1 (MQ=255) ccAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCgat > 1:186841/1‑129 (MQ=255) cAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGACCGATGCCTCGGGcacc < 2:1100235/51‑1 (MQ=18) cAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGACCGATGCCTCGGGcacc > 1:1100235/1‑51 (MQ=18) aaGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCAc < 1:719667/100‑1 (MQ=255) aaGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCAc > 2:719667/1‑100 (MQ=255) aGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGt > 2:41219/1‑87 (MQ=255) aGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGt < 1:41219/87‑1 (MQ=255) cGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCCCCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCtt < 2:917482/150‑1 (MQ=255) gcACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCt < 1:1099509/150‑1 (MQ=255) gcACGGTTGCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCt < 1:151807/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGa < 2:619021/150‑1 (MQ=255) ttCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGACGaa < 2:372057/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCAACACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGACGAAGTc > 1:457959/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGc > 2:570126/1‑79 (MQ=255) ttGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGc < 1:570126/79‑1 (MQ=255) ttGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGACGAAGTCt > 1:560896/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGACGAAGTCt < 2:901994/150‑1 (MQ=255) tGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGACGAAGTCtt < 2:560896/150‑1 (MQ=255) gAACGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAAAACTGCAAAACCTTCCGCCAGCGCAGACATGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGTTCACCACACCGGCGATGGTCAGTTGCTTGCGGCCCTTGGCCTTGATTGCCTTGACGAAGTCTTc > 2:81130/1‑150 (MQ=37) | AGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCGTTGCGCCAGTCGCGGTGCAGTTCGCAGGCCACCGAGAACCAGTTCATCATCTGCGCACCCGCCTGGGTCATGCGTACCCAAGCCGCTTGCTGCACGGTTTCGTTGAAGGTGCCCGAGGCATCGGTCACCACGAACACTTCAAAACCTTCCGCCAGCGCCGACAGGGTCGGGAAGGCCACGCACACATCGGTCACCACACCGGCGATGATCAGTTGCTTGCGGCCCGTGGCCTTGATTGCCTTGACGAAGTCTTC > NC_002947/5984613‑5984893 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |