| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 483,767 | G→T | 7.1% | V225V (GTC→GTA) | yeaG ← | protein kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 483,767 | 0 | G | T | 7.1% | 172.7 / 2.7 | 56 | V225V (GTC→GTA) | yeaG | protein kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (25/27); new base T (2/2); total (27/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.39e-01 | |||||||||||
GGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCAATGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGCAGGCGCTTGGTGG > NC_002947/483623‑483915 | ggTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCtt < 2:810976/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGc < 2:501444/150‑1 (MQ=255) cAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGAc > 1:1029627/1‑150 (MQ=255) cAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGAc > 2:68694/1‑150 (MQ=255) tGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGACCAGGGcc < 1:1579645/150‑1 (MQ=255) aGGAGCTTGATCAGCGCCTTGAACGTTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTCGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCgag < 2:1029627/150‑1 (MQ=255) gACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGAt < 2:899100/150‑1 (MQ=255) aTCGGCGTCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTgg < 1:68694/150‑1 (MQ=255) 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gCGGATCTCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCAATGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGc > 2:1049990/1‑145 (MQ=255) gCGGATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCAATGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGc < 1:1049990/145‑1 (MQ=255) ggATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTgg > 2:1106628/1‑66 (MQ=255) ggATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTgg < 1:1106628/66‑1 (MQ=255) ggATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCACTGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACGACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGCAGGCGCt > 1:223506/1‑150 (MQ=255) tatCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCACTGGCGATCTGGTTAAGACTCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGCAGGCGCTtgg > 2:21838/1‑150 (MQ=255) atCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCAATGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCAACGCCAAACTCCTGCAGGCGCTtggt > 1:768796/1‑150 (MQ=255) tCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCAATGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGCAGGCGCTtggtg < 1:888752/150‑1 (MQ=255) cGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTACTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCAATGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGCAGGCGCTtggtgg > 2:58489/1‑150 (MQ=255) | GGTGAGCAAGGGGTGCAGGACCTTGATCGGCGCCTTGAACATTTCGACGAATTCCATCAGGCCCTGGTTGGCCCGGCAAAGCGCGCCCGAGTAGCTATAGGCGTCGGCGTCGTTCTGTGGGTATTCCTCAAGTTTGCGGATATCGACCTTGCCGACCAGGGCCGAGATGTCCTGGTTGTTTTCATCGCCGGGTTCGGTCTTGGCAATGGCGATCTGGTTAAGAATCGACGGGTACAGCTTCACCACCTTGAACTTGGAGATGTCACCGCCAAACTCCTGCAGGCGCTTGGTGG > NC_002947/483623‑483915 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |