Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 546,893 | G→T | 8.5% | G81C (GGC→TGC) | rpsG → | 30S ribosomal protein S7 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 546,893 | 0 | G | T | 8.5% | 237.5 / 6.8 | 79 | G81C (GGC→TGC) | rpsG | 30S ribosomal protein S7 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/34); new base T (3/4); total (41/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
AAGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTGGATGCTGCCGAAG > NC_002947/546748‑547040 | aaGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTcggcgg < 1:223909/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGTAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCTGCGGt > 2:655993/1‑150 (MQ=255) gCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCa < 1:519965/150‑1 (MQ=255) aagGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTAc < 1:1367959/150‑1 (MQ=255) aagGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTAc < 1:632126/150‑1 (MQ=255) ggCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCTCTGAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCa < 1:919765/150‑1 (MQ=255) ggCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAGGTAACGTAAGCGCGTGTCGGCGGGGCCACGTACCa > 2:1586569/1‑150 (MQ=255) ccGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGTTAATGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTAGGCGGGGCCACTGACCAgg > 1:920345/1‑150 (MQ=255) gcgcATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGa > 1:714645/1‑150 (MQ=255) cATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGTAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCTGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGt < 1:655993/150‑1 (MQ=255) cGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCg < 1:181260/150‑1 (MQ=255) tttACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGCGACAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGCAGTAAAGTCCCGTCGTGTCTGCGGCGCCCCTTACCAGGTCACGGTTGAAGATCGTc > 2:89986/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATc < 1:596348/150‑1 (MQ=255) ggTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATcc > 1:695501/1‑150 (MQ=255) gCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCcgt < 2:714645/150‑1 (MQ=255) cTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCcgtcgt > 1:134519/1‑150 (MQ=255) aCCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGct > 1:1500701/1‑150 (MQ=255) aCCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACAAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGct > 1:310749/1‑150 (MQ=255) gTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGATAAAGCTATCAACGTGATGGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTg < 2:793099/150‑1 (MQ=255) gTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTg < 1:1554763/150‑1 (MQ=255) gTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTg > 2:1554763/1‑150 (MQ=255) aGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCAc < 2:911402/99‑1 (MQ=255) aGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCAc > 1:911402/1‑99 (MQ=255) aGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGt < 2:819320/124‑1 (MQ=255) aGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGt > 1:819320/1‑124 (MQ=255) aGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACTCTCTGGCAAt < 2:920345/150‑1 (MQ=255) aaGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTgg > 2:1567659/1‑150 (MQ=255) gAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCt > 1:1076195/1‑150 (MQ=255) aGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTa < 1:1567659/150‑1 (MQ=255) cGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCTGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGa < 2:891415/150‑1 (MQ=255) cccccTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCTGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTa > 1:509470/1‑150 (MQ=255) ccTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATc < 1:1481018/108‑1 (MQ=255) ccTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATc > 2:1481018/1‑108 (MQ=255) ccTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGCCCATCCCGTCGTAACGCCCTGGCAACGCGCTGGCTCGTACACTCCGc > 2:817590/1‑150 (MQ=255) ccTGAAAACCTTCAAGAAAGCTCTCAACGCCATCGCTCCGCTGCTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGc > 2:881467/1‑150 (MQ=255) aaaTCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCa > 2:864895/1‑150 (MQ=255) aTCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAg > 1:452712/1‑150 (MQ=255) gagaAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCgcggc > 2:930789/1‑150 (MQ=255) gaAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCTGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCga < 1:89986/150‑1 (MQ=255) gaAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTgg < 1:79428/110‑1 (MQ=255) gaAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTgg > 2:79428/1‑110 (MQ=255) gaAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCga > 2:523462/1‑150 (MQ=255) aGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGaa < 2:1076195/150‑1 (MQ=255) ctctCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCACGTCGTAAAGCTGTGGCAAGGCGCTGGCTTGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGt > 1:773969/1‑150 (MQ=255) tctcGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTc < 1:1586569/150‑1 (MQ=255) tctcGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTc > 2:1321037/1‑150 (MQ=255) gACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCTGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATg < 2:509470/150‑1 (MQ=255) gACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTc > 1:733412/1‑79 (MQ=255) gACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTc < 2:733412/79‑1 (MQ=255) gCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGACGATAAGTCGaatgct > 2:913666/1‑145 (MQ=255) ccATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTcc < 1:334708/76‑1 (MQ=255) ccATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTcc > 2:334708/1‑76 (MQ=255) ccATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGctc > 1:423740/1‑150 (MQ=255) aTCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGt > 2:254609/1‑139 (MQ=255) aTCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGt < 1:254609/139‑1 (MQ=255) cTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGa > 2:498723/1‑138 (MQ=255) cTCCGATGGTGGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGa < 1:498723/138‑1 (MQ=255) tCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAAt < 2:366746/93‑1 (MQ=255) tCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAAt > 1:366746/1‑93 (MQ=255) tCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCt > 1:235957/1‑150 (MQ=255) cctttGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTg < 1:881467/146‑1 (MQ=255) gCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCcgtc > 1:1186944/1‑74 (MQ=255) gCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCcgtc < 2:1186944/74‑1 (MQ=255) gTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGc > 2:935398/1‑150 (MQ=255) gAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCt < 2:341545/88‑1 (MQ=255) gAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCt > 1:341545/1‑88 (MQ=255) tAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAActgc > 2:640678/1‑150 (MQ=255) aaaGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAActgct < 2:235957/150‑1 (MQ=255) aaGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGCAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGCTGGCTCTGCGTCTGGTCGGCGAActgctg < 1:817590/150‑1 (MQ=255) aaGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATc > 2:1643057/1‑56 (MQ=255) aaGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATc < 1:1643057/56‑1 (MQ=255) aaGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAActgctg < 2:423740/150‑1 (MQ=255) aGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTgg < 2:134519/150‑1 (MQ=255) gTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGCTCTGGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTGGa < 1:1251279/150‑1 (MQ=255) cgtcgtGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCTGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTGGAtgct > 2:703054/1‑150 (MQ=255) gtcgtGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCTGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTGGAtgctg < 1:703054/150‑1 (MQ=255) gtCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTACTGGATGCTGCCGaa > 1:1272040/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGc > 2:375964/1‑117 (MQ=255) tCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGc < 1:375964/117‑1 (MQ=255) tCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCAGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTGGATGCTGCCGAAg < 2:695501/150‑1 (MQ=255) | AAGCGGCAAGAAGGCCGTAGCCGAGCGCATCGTTTACGGTGCCCTGGATACCGTCAAAGCACGCAAGAACAGCGACCCCCTGGAAATCTTCGAGAAAGCTCTCGACGCCATCGCTCCGCTGGTCGAAGTAAAGTCCCGTCGTGTCGGCGGTGCCACTTACCAGGTCCCGGTTGAAGTTCGTCCATCCCGTCGTAACGCTCTGGCAATGCGCTGGCTCGTAGACTACGCCCGCAAGCGCGGCGAGAAGTCGATGGCTCTGCGTCTGGCCGGCGAACTGCTGGATGCTGCCGAAG > NC_002947/546748‑547040 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |