| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 713,087 | C→G | 6.6% | L25V (CTG→GTG) | lspA → | lipoprotein signal peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 713,087 | 0 | C | G | 6.6% | 193.5 / 5.1 | 61 | L25V (CTG→GTG) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/31); new base G (2/2); total (28/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
CTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGG > NC_002947/712938‑713234 | cTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGc < 1:1115858/150‑1 (MQ=255)cTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGc < 1:50336/150‑1 (MQ=255)cTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGc < 1:334687/150‑1 (MQ=255)cTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTCGc < 1:1644787/150‑1 (MQ=255) ttCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGct < 2:12378/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACAATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctgg < 2:1280609/150‑1 (MQ=255) gcgcCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtt > 1:573202/1‑149 (MQ=255) ccGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtcctg < 1:501829/150‑1 (MQ=255) cGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtcctgg < 1:489119/150‑1 (MQ=255) gACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtcctggt < 1:1312295/150‑1 (MQ=255) cGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑a < 2:1634224/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGa > 2:1059853/1‑150 (MQ=255) aGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGTCCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGct < 2:1331593/132‑1 (MQ=255) aGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGct > 1:1331593/1‑132 (MQ=255) cATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtcctgg > 1:711483/1‑137 (MQ=255) cATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtcctgg < 2:711483/137‑1 (MQ=255) cATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctg > 1:803797/1‑130 (MQ=255) cATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctg < 2:803797/130‑1 (MQ=255) aTCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑cc > 1:860356/1‑150 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑cca < 1:1467705/150‑1 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑cca > 1:201662/1‑150 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑cca > 1:1136853/1‑150 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑cca > 2:395243/1‑150 (MQ=255) gAGCACCCGGAAATCTGCTGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGCTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCaa < 1:122837/150‑1 (MQ=255) cACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCt < 2:1348903/150‑1 (MQ=255) gAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACtt < 1:1059853/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTc < 2:201662/150‑1 (MQ=255) aTCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaa < 2:573202/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaaca > 1:1522970/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTC‑GATGACCAGGACCAGCAAGCtca > 1:800519/1‑138 (MQ=37) tGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTC‑GATGACCAGGACCAGCAAGCtca < 2:800519/140‑3 (MQ=37) gCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGcc < 2:860356/150‑1 (MQ=255) gTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtc > 2:136174/1‑105 (MQ=255) gTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGctggtc < 1:136174/105‑1 (MQ=255) tCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATg < 2:37906/150‑1 (MQ=255) cAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCaa < 2:1498061/118‑1 (MQ=255) cAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCaa > 1:1498061/1‑118 (MQ=255) ccGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCaa < 2:1492350/110‑1 (MQ=255) ccGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCaa > 1:1492350/1‑110 (MQ=255) ccGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACcagca > 2:776698/1‑146 (MQ=255) ccGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACcagca < 1:776698/146‑1 (MQ=255) ccGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATc > 1:548539/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATc < 2:360644/150‑1 (MQ=255) cGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTc < 2:297504/150‑1 (MQ=255) tGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGTACGACTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTc > 1:380212/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa < 1:632946/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAACTAAGCCCTACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa < 2:1275322/150‑1 (MQ=255) tGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCGTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGac < 2:157577/150‑1 (MQ=255) gcCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAc < 2:423007/116‑1 (MQ=255) gcCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAc > 1:423007/1‑116 (MQ=255) gcCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGactac > 2:971300/1‑150 (MQ=255) ccACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGAT‑GACCAGGACCAGCAAGCtca > 1:1473781/1‑94 (MQ=18) ccACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGAT‑GACCAGGACCAGCAAGCtca < 2:1473781/96‑3 (MQ=18) aTGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGc < 2:1522970/150‑1 (MQ=255) tGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCt > 2:1580893/1‑150 (MQ=255) tGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCt < 1:180591/150‑1 (MQ=255) ccTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTgg > 2:231624/1‑150 (MQ=255) cTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCGTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGa > 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gcgcTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAacac > 1:230736/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGt > 1:383305/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGt > 2:965183/1‑150 (MQ=255) ccTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGtt < 2:1136853/150‑1 (MQ=255) cTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa > 1:854778/1‑107 (MQ=255) cTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa < 2:854778/107‑1 (MQ=255) ttGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCa < 2:230736/150‑1 (MQ=255) ttGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCACGTTCa < 1:231624/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTc < 1:425586/98‑1 (MQ=255) aTGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTc > 2:425586/1‑98 (MQ=255) gctgAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGa > 1:809991/1‑150 (MQ=255) gctgAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGa < 1:354379/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGc < 1:395243/150‑1 (MQ=255) tGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCgg < 1:965183/150‑1 (MQ=255) gCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTc > 1:845427/1‑91 (MQ=255) gCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTc < 2:845427/91‑1 (MQ=255) | CTTCCGCGCCGACGTCGGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTC‑ATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGG > NC_002947/712938‑713234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |