| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 937,771 | A→T | 10.2% | A2618A (GCT→GCA) | PP_0806 ← | surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 937,771 | 0 | A | T | 10.2% | 197.8 / 12.1 | 67 | A2618A (GCT→GCA) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/29); new base T (2/5); total (33/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.81e-01 | |||||||||||
TGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCCGACGACAATGCTGCT > NC_002947/937629‑937920 | tGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCTGCGCTGCCGggt < 2:1541592/150‑1 (MQ=255) gATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCTGCGCTGCCGggtg < 2:284781/150‑2 (MQ=255) gctgctgcCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCTGCGCTGCCGggtgaac < 2:397624/150‑5 (MQ=255) gctgctgcCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGggtcgag < 1:1443510/150‑1 (MQ=255) tgctgcCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGggtcgaggt < 2:916861/150‑1 (MQ=255) tgctgcCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGggtcgaggt > 1:803346/1‑150 (MQ=255) gcCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGAt > 1:344559/1‑150 (MQ=255) gcCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGAt < 1:1556983/150‑1 (MQ=255) ccATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATc > 2:97829/1‑150 (MQ=255) tCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGTCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAgg > 1:609626/1‑150 (MQ=255) tCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGCCGTACGTTAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAgg > 2:682650/1‑150 (MQ=255) cGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGa < 2:609626/150‑1 (MQ=255) cgacCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGt > 1:1050466/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTcg < 2:803346/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCCCCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGATTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGACATTCGCAACGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTcgc < 1:1518980/150‑1 (MQ=255) gCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCAc < 1:1470457/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGc < 1:1111133/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGc > 1:318796/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCg < 1:97829/150‑1 (MQ=255) tCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTAc > 1:1099841/1‑150 (MQ=255) ggCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGggt > 2:128636/1‑103 (MQ=255) ggCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGggt < 1:128636/103‑1 (MQ=255) cGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGAc > 1:1109508/1‑150 (MQ=255) ccaccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCCGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACGGACCAGCg > 2:728371/1‑150 (MQ=255) caccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGt > 1:1592830/1‑150 (MQ=255) accaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTTGAGCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTg > 1:1177543/1‑150 (MQ=255) accaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGaaa < 2:730167/111‑1 (MQ=255) accaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGaaa > 1:730167/1‑111 (MQ=255) accaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGCCTCAGGCGTTAACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCCACCAGCGTg > 2:683288/1‑150 (MQ=255) ccaGTGGCACGTCGTATGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGcc < 1:1018610/89‑1 (MQ=255) ccaGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGcc > 2:1018610/1‑89 (MQ=255) gCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTgg < 1:655394/150‑1 (MQ=255) aCGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCa > 2:494955/1‑150 (MQ=255) aCGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCa > 2:1452648/1‑150 (MQ=255) tcgtAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGcc < 1:1472262/140‑1 (MQ=255) tcgtAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGcc > 2:1472262/1‑140 (MQ=255) gtAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATcgcg < 1:1065404/150‑1 (MQ=255) gtAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATcgcg > 2:1065404/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCt > 2:1646800/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTTCAGAGCCGTTGCCGCCCGGGTCGTTCTGGGCCGGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCt < 2:14086/149‑1 (MQ=255) aGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGGAATTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCg > 1:1319897/1‑150 (MQ=255) agGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAg > 1:1175719/1‑115 (MQ=255) agGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAg < 2:1175719/115‑1 (MQ=255) gCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCg < 1:1646800/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGCTCGGGTCGGTCTTTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCTGCGCTGCCGggt < 2:1006135/59‑1 (MQ=37) gTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCTGCGCTGCCGggt > 1:1006135/1‑59 (MQ=38) gTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGt > 1:481929/1‑141 (MQ=255) gTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGt < 2:481929/141‑1 (MQ=255) gCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTc < 1:1527915/150‑1 (MQ=255) gCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCAGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTcgcc > 1:1138218/1‑150 (MQ=255) tctggtcggtcTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTcgccgc < 1:682650/147‑1 (MQ=255) ggtcggtcTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGAc < 1:494955/150‑1 (MQ=255) gtcggtcTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGAcc > 2:717391/1‑150 (MQ=255) tcTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGc < 1:65877/133‑1 (MQ=255) tcTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGc > 2:65877/1‑133 (MQ=255) ccAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGAc > 1:568462/1‑115 (MQ=255) ccAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGAc < 2:568462/115‑1 (MQ=255) cAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCCGCGCAACAAGGCCCTGGCCGTTCACGACAGTATCGTGCTCTTTCACTGTGCCGTTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTACACCCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAg < 2:1177543/150‑1 (MQ=255) aGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAgg < 2:318796/150‑1 (MQ=255) ggCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGc < 1:717391/150‑1 (MQ=255) gCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGgc < 1:1452648/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGgcgc > 2:1448152/1‑150 (MQ=255) gaCCCGGCTGCGCTGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTa > 1:656278/2‑104 (MQ=255) gaCCCGGCTGCGCTGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTa < 2:656278/103‑1 (MQ=255) cccGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacg > 1:922616/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacga < 1:728371/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCcgacga > 2:849431/1‑150 (MQ=255) gcagcgcagcCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTc < 1:1101051/91‑1 (MQ=255) gcagcgcagcCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTc > 2:1101051/1‑91 (MQ=255) agcCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCCGACGACAATgctgct > 2:832288/1‑150 (MQ=255) agcCGAGTCGAGGTCGATCAGGAAAGGACCGTTCGCGCTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTCCCATTCGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGTGACCGCCCAAGTTCAGGCCGTCGGCGCCGACGACAATgatgct < 1:830313/150‑1 (MQ=255) | TGATGCTGCTGCCATCGGCAGCGACGACCAGTTCGCTCGGGCTGGTCGGCGTGACCACCAGTGGCACGTCGTAGGTCAGCGCTTCAGAGGCGTTGCCGCTCGGGTCGGTCTGTACCAGGCTCAGGCGTTCACCCGGCAGCGCAGCCGGGTCGAGGTCGATCAGGAAAGTACCGTTCGCGGTCACTGTGCCGGTACCGACCAGCGTGCCATTGGCATCGCGCACCTCGACGGTAGCACCGGCTTCGCCGCGACCGCCCAAGGTCAGGCCGTCGGCGCCGACGACAATGCTGCT > NC_002947/937629‑937920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |