| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,001,196 | A→T | 9.3% | Q57L (CAG→CTG) | PP_0863 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,001,196 | 0 | A | T | 9.3% | 225.7 / 13.5 | 75 | Q57L (CAG→CTG) | PP_0863 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/36); new base T (3/4); total (35/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.84e-01 | |||||||||||
GTGGATGTGGCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCAGGCGGCCGTTCACTACGCCCGTGCGG > NC_002947/1001057‑1001345 | gtggATGTGGCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCTGCTGGATGcc > 2:407310/1‑150 (MQ=255)gtggATGTGGCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGa < 1:708092/146‑1 (MQ=255)gtggATGTGGCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGa > 2:708092/1‑146 (MQ=255) ggATGTGGCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCTGCTGGATGCCAc < 1:624455/150‑1 (MQ=255) ggATGTGGCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCTGCTGGATGCCAc < 1:407310/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGc > 2:1624248/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAACCTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCTGCTGGATGCCa < 1:927770/140‑1 (MQ=255) cGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCTGCTGGATGCCa > 2:927770/1‑140 (MQ=255) ttGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGt < 2:719247/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGtt < 1:1224871/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGtt < 1:401567/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTg < 2:397606/150‑1 (MQ=255) aGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGTGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGt > 1:92598/1‑150 (MQ=255) ggCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGtt < 1:1624248/150‑1 (MQ=255) gCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTc > 1:259038/1‑150 (MQ=255) cgcGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTc > 2:1510626/3‑144 (MQ=255) cTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTc < 1:1510626/144‑1 (MQ=255) cTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATc > 1:940264/1‑150 (MQ=255) tCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCg > 1:611658/1‑150 (MQ=255) gAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGc > 2:436240/1‑149 (MQ=255) gAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGc < 1:436240/149‑1 (MQ=255) ccGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTg > 1:1360809/1‑150 (MQ=255) ccGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTg < 2:207124/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCa > 1:1360351/1‑150 (MQ=255) aaGGCCGGCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGt < 2:445935/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGtt < 1:563119/121‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGtt > 2:563119/1‑121 (MQ=255) gccgccCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGcg > 2:756306/1‑149 (MQ=255) gccCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATg < 1:546596/150‑1 (MQ=255) aGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGAt < 2:825610/92‑1 (MQ=255) aGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGAt > 1:825610/1‑92 (MQ=255) ggCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGca < 1:1177396/150‑1 (MQ=255) aTTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCacaac < 2:1331127/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCacaaca > 2:1600660/1‑150 (MQ=255) ggcAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCgg > 1:396320/1‑150 (MQ=255) cAGCGGGGCAGGGTGTGGTTGAGGCGCAGTTGCTGGTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGCGGCATCCAGCAGGATGCGACGGTGGCCCGGCGTTGGTTAGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCTGGc < 2:702630/150‑1 (MQ=255) cGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGtt < 2:259038/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAgg > 1:843308/1‑110 (MQ=255) gCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAgg < 2:843308/110‑1 (MQ=255) gCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGt > 1:1210509/1‑118 (MQ=255) gCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGt < 2:1210509/118‑1 (MQ=255) aGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTgg > 1:1299831/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGc < 1:1125120/76‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGc > 2:1125120/1‑76 (MQ=255) gTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGc > 2:117084/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTc < 2:718739/83‑1 (MQ=255) tCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTc > 1:718739/1‑83 (MQ=255) tCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCt < 2:997170/139‑1 (MQ=255) tCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCt > 1:997170/1‑139 (MQ=255) gAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGc > 2:1204957/1‑92 (MQ=255) gAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGc < 1:1204957/92‑1 (MQ=255) ggCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCgg < 2:164885/126‑1 (MQ=255) ggCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCgg > 1:164885/1‑126 (MQ=255) cAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGc < 2:1360809/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCCCGGTTACCCGCCGTTAAGCAGTGAGCGCTGCACAGTGTGTGAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGa < 1:1017772/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGa < 2:1367924/150‑1 (MQ=255) ggCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCTCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTgg < 2:940264/150‑1 (MQ=255) gCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGt < 1:736794/85‑1 (MQ=255) gCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGt > 2:736794/1‑85 (MQ=255) gCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGt < 2:611658/150‑1 (MQ=255) gCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGt < 2:742861/150‑1 (MQ=255) gATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCa > 1:472720/1‑150 (MQ=255) ctgctgGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCacaa > 1:1235261/1‑92 (MQ=255) ctgctgGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCacaa < 2:1235261/92‑1 (MQ=255) ctgGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCAGGCGGcc < 1:714975/150‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGtt > 2:579480/1‑44 (MQ=255) ggATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGtt < 1:579480/44‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTc < 1:937369/49‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTc > 2:937369/1‑49 (MQ=255) ggATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCAt < 1:1588994/78‑1 (MQ=255) ggATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCAt > 2:1588994/1‑78 (MQ=255) cGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCAGGCGGCCGTTCACTAc > 2:1427916/1‑150 (MQ=255) tGGCATCCTGCTGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGgc > 1:314222/1‑72 (MQ=39) tGGCATCCTGCTGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGgc < 2:314222/72‑1 (MQ=39) gCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCAGGCGGCCGTTCACTACGccc > 1:440213/1‑150 (MQ=255) agcagGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCAGGCGGCCGTTCACTACGCCCGTGCgg > 2:797471/1‑150 (MQ=255) agcagGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCAGGCGGCCGTTCACTACGCCCGTGCgg > 1:1198316/1‑150 (MQ=255) | GTGGATGTGGCCGGCTTGCAGGCCATGCTCGAGGAAACTCCCGGCAAGGCCGCCCAGGCGATTCTGGCGGCAGCGGGGCAGGGTGTGGTCGAGGCGCAGTTGCTGCTGGGGCAGATCCTGCTGGATGGGCGTGGCATCCAGCAGGATGCCACGGTTGCCCGGCGTTGGTTCGGTATCGCTGCACAGGGTGGCAGTGCCATGGCGCACAACATGCTCGGGCGTTGCCTGGAGCATGGCTGGGGTGGCGAGGTGAATTTGGTGCAGGCGGCCGTTCACTACGCCCGTGCGG > NC_002947/1001057‑1001345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |