| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,024,313 | G→C | 6.2% | S279R (AGC→AGG) | opdP ← | glycine‑glutamate dipeptide porin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,024,313 | 0 | G | C | 6.2% | 204.5 / 3.1 | 64 | S279R (AGC→AGG) | opdP | glycine‑glutamate dipeptide porin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/29); new base C (2/2); total (33/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
TCATTGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCA > NC_002947/1024164‑1024461 | tCATTGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAgg > 2:78227/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGa < 1:52953/150‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTgcg > 1:960566/1‑150 (MQ=255) ctgctgCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTTGGGAGCTTGCAGATTTTCTCGCTGTCGGCGTCG‑ACGATCTTGTAGTAGTTCAAGCCGGTGCTCAGGCGGAGCAGTGTGCt > 1:528910/1‑150 (MQ=255) ggaggCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAg > 2:1191975/1‑150 (MQ=255) gaggCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGc > 2:366863/1‑150 (MQ=255) gcTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATg > 2:574872/1‑150 (MQ=255) gcTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCAGTGCTCAGCCTGAGCAccg > 2:217266/1‑129 (MQ=255) gcTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCAGTGCTCAGCCTGAGCAccg < 1:217266/131‑3 (MQ=255) cTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATgg > 1:1272555/1‑150 (MQ=255) tgtgGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGgcgc < 1:574872/150‑1 (MQ=255) gggCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGa > 1:236037/1‑150 (MQ=255) ggCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGaa > 2:74411/1‑150 (MQ=255) ttGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagta < 2:236037/150‑1 (MQ=255) ttGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagta > 1:282249/1‑150 (MQ=255) ttGATGGGTCAGACCGAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGGTGCGGGCGTCG‑ACGCCACCATAGTAGTTCAGGACGGTGATCACGCTGAGCACTGCGCCGTCGCTGAGCACATGGTTGGCGCCGAagta < 1:1349951/150‑1 (MQ=255) gATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAagtagt > 2:960597/1‑150 (MQ=255) aTGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAgtagta > 2:558909/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTgg < 2:955492/150‑1 (MQ=255) gTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGCCt < 2:1401409/101‑1 (MQ=255) gTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGCCt > 1:1401409/1‑101 (MQ=255) tCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGt > 2:914820/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTc < 1:914820/150‑1 (MQ=255) aGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCT‑ACAACGACGTTCAGTAGGGAAGGAGTTCCGGCCGGTGCTCAGGCTGCGCCCTGCGCTGTCATCAAGCTCATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTc < 1:1191975/150‑1 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGcaca > 2:209279/1‑119 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGcaca < 1:209279/119‑1 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAg > 2:695371/1‑149 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAg < 1:695371/149‑1 (MQ=255) ccAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGa > 2:560330/1‑150 (MQ=255) aGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAg < 1:558909/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTc < 1:960597/150‑1 (MQ=255) tggaaGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCt > 1:1643240/4‑150 (MQ=255) tCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCg > 2:510378/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTa > 1:291916/1‑150 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAg > 1:1020971/1‑150 (MQ=255) gTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAg > 1:1468291/1‑150 (MQ=255) aTCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGa > 2:66034/1‑85 (MQ=255) aTCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGa < 1:66034/85‑1 (MQ=255) aTCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg < 2:1020971/150‑1 (MQ=255) aTCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTg > 2:1500954/1‑150 (MQ=255) tCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTgg < 2:1272555/150‑1 (MQ=255) cTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGaa > 1:1567137/1‑120 (MQ=255) cTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGaa < 2:1567137/120‑1 (MQ=255) cTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGCCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGCCGTACAGGCTCGt > 2:642364/1‑150 (MQ=255) ttGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTa < 1:1392963/150‑1 (MQ=255) cccATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTc < 1:78227/150‑1 (MQ=255) ccATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCa > 1:165100/1‑150 (MQ=255) ttttCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGc < 1:74411/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGctc < 2:960566/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCtt < 2:165100/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACg < 2:291916/150‑1 (MQ=255) gCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGATGAGCTTCACGCTGGCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTgg < 1:366863/150‑1 (MQ=255) g‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGtt < 1:206463/150‑1 (MQ=255) ggTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGAt < 1:560330/150‑1 (MQ=255) ttGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGc < 1:1366483/104‑1 (MQ=255) ttGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGc > 2:1366483/1‑104 (MQ=255) aGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCa > 1:1628034/1‑150 (MQ=255) gCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGctct > 2:918057/1‑113 (MQ=255) gCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGctct > 2:918035/1‑113 (MQ=255) gCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGctct < 1:918035/113‑1 (MQ=255) gCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGctct < 1:918057/113‑1 (MQ=255) cTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGtt > 2:979731/1‑150 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGc > 1:1602595/1‑102 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGc < 2:1602595/102‑1 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGttt < 1:510378/150‑1 (MQ=255) ggCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCa < 2:1643240/150‑1 (MQ=255) | TCATTGCCGTTGACCTGCTGCCAGGAGGCGCTGAGGGTGTGGGCTTGATGGGTCAGGCCCAGTGACAGGCTGTAAGTGTCGTTGTCGATCTTGCCCATTTTCTGGCTGCCGGCGTCG‑ACGGTCTTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCA > NC_002947/1024164‑1024461 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |