Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,049,187 | A→T | 6.5% | L139Q (CTG→CAG) | PP_0907 ← | RND transporter membrane fusion protein‑like protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,049,187 | 0 | A | T | 6.5% | 233.4 / 6.7 | 78 | L139Q (CTG→CAG) | PP_0907 | RND transporter membrane fusion protein‑like protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/38); new base T (3/2); total (37/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.64e-01 |
CATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTCCACCTCCAGGCTCAGATCCACGC > NC_002947/1049038‑1049334 | cATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCa < 2:879454/150‑1 (MQ=255) ttGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAgg < 1:565321/150‑1 (MQ=255) tGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCa > 1:842270/1‑150 (MQ=255) tttCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTc > 1:1467020/1‑150 (MQ=255) gATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAg > 2:957000/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCTAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTa > 1:1312804/1‑150 (MQ=255) tGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTa > 2:1210029/1‑150 (MQ=255) ccTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCAGACTCGCTAACCACCTTTCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGa > 1:371732/1‑150 (MQ=255) aaGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGAGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAg > 2:978617/1‑150 (MQ=255) tgctCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCt < 1:543179/150‑1 (MQ=255) gctCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTg < 2:842270/150‑1 (MQ=255) tCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAgg < 1:1236202/114‑1 (MQ=255) tCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAgg > 2:1236202/1‑114 (MQ=255) accaccGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTcc > 2:1254202/1‑150 (MQ=255) ccaccGCCTGGTTGCAGCGGTCCTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCt < 1:424/150‑1 (MQ=255) caccGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTg > 1:167902/1‑150 (MQ=255) ccGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGAt > 2:310782/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGCCCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAg > 1:1133128/1‑133 (MQ=255) ccTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAg < 2:1133128/133‑1 (MQ=255) cTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGAtcgtc < 1:957000/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGa < 2:712185/150‑1 (MQ=255) gcCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCt > 1:92411/1‑150 (MQ=255) gcCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGACGTTGAGCt > 1:20258/1‑150 (MQ=255) gTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGCACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCaa < 2:787280/150‑1 (MQ=255) aCTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAaga < 1:1498772/150‑1 (MQ=255) aCTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAaga < 1:236754/150‑1 (MQ=255) aCTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAaga < 2:371732/150‑1 (MQ=255) cTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCg > 1:873997/1‑106 (MQ=255) cTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCg < 2:873997/106‑1 (MQ=255) tGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGc > 1:908830/1‑150 (MQ=255) gggAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACAAGATGTGTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCa > 2:964570/1‑150 (MQ=255) ggaggaAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAg > 1:1051740/1‑150 (MQ=255) gaggaAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTACTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGt > 1:539010/1‑150 (MQ=255) aggaAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGtt < 2:92411/150‑1 (MQ=255) cGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGcc < 1:88071/150‑1 (MQ=255) gTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCtt < 1:1523574/150‑1 (MQ=255) gAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGAt < 1:1047531/113‑1 (MQ=255) gAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGAt > 2:1047531/1‑113 (MQ=255) tCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGc < 2:1122964/77‑1 (MQ=255) tCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGc > 1:1122964/1‑77 (MQ=255) tCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGAc < 1:876767/146‑1 (MQ=255) tCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGAc > 2:876767/1‑146 (MQ=255) cgGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCGGGTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCt < 1:864092/150‑1 (MQ=255) cgGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCt < 1:340891/150‑1 (MQ=255) gggAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTg > 1:1314054/1‑150 (MQ=255) ggAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCCGCCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGa < 1:216770/150‑1 (MQ=255) gagaTGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAg < 1:1210029/150‑1 (MQ=255) ggCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGaa < 2:629811/150‑1 (MQ=255) gCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGt < 1:1376032/86‑1 (MQ=255) gCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGt > 2:1376032/1‑86 (MQ=255) gCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGAtc < 2:1470850/95‑1 (MQ=255) gCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGAtc > 1:1470850/1‑95 (MQ=255) tCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAggg < 2:631663/61‑1 (MQ=255) tCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAggg > 1:631663/1‑61 (MQ=255) cccACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAggg > 2:181424/1‑73 (MQ=255) cccACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAggg < 1:181424/73‑1 (MQ=255) caGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAg < 1:1553643/141‑1 (MQ=255) caGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAg > 2:1553643/1‑141 (MQ=255) ctggctgCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGAt < 1:310782/150‑1 (MQ=255) tggctgCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAagag > 1:1619441/1‑95 (MQ=255) tggctgCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAagag < 2:1619441/95‑1 (MQ=255) gCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGa < 1:1090322/120‑1 (MQ=255) gCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGa > 2:1090322/1‑120 (MQ=255) ccACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTcc < 1:964570/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTCCAc < 1:1254202/150‑1 (MQ=255) cctggccGACCTGGGCCTGGCCAAGGTCGACCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCa < 2:47436/117‑1 (MQ=38) cctggccGACCTGGGCCTGGCCAAGGTCGACCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCa > 1:47436/7‑123 (MQ=38) cGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGaa > 1:93712/1‑118 (MQ=255) cGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGaa < 2:93712/118‑1 (MQ=255) cGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTCCACCTCCa > 2:196977/1‑150 (MQ=255) gccGACCTGGGCCTGGCCAAGGTCGACCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTCCACCTCCAGGCt > 1:1059022/3‑150 (MQ=255) cTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATcgtcgt < 2:1103709/59‑1 (MQ=255) cTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATcgtcgt > 1:1103709/1‑59 (MQ=255) ttGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTCCACCTCCAGGCTCAGATcc < 2:1051740/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGCCAAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCATTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCATGAGTCGaa > 1:1187072/1‑105 (MQ=255) ggCCTGGCCAAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCATTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCATGAGTCGaa < 2:1187072/105‑1 (MQ=255) ccAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGAt < 1:834085/121‑1 (MQ=255) ccAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGAt > 2:834085/1‑121 (MQ=255) ccAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTCCACCTCCAGGCTCAGATCCACGc < 2:1314054/150‑1 (MQ=255) | CATTGATGCGTTTCTTGATCTTCTGCGCCTTAAGCTGCTCGACCACCGCCTGGTTGCGCCGGTACTGGGAGGAAAGGCGGTCGAACTCGCCGCGGGAGATGGCCGAATCGCCCACCAGCTGGCTGCCACGGCCGAAGTCGACCTTGGCCAGGCCCAGGTCGGCCAGGGCGGTACCGAGCAGGGCTGTTTCCTGATCGTCGTTGAGCTGCAAGAGCAGTTGCCCGGCCTTGACCTGTTGGCCTGAGTCGAAGTGCAGGGATTTGACGATGCCTTCCACCTCCAGGCTCAGATCCACGC > NC_002947/1049038‑1049334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |