| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,366,352 | G→A | 6.2% | G118G (GGC→GGT) | PP_1191 ← | S4 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,366,352 | 0 | G | A | 6.2% | 189.5 / 2.5 | 64 | G118G (GGC→GGT) | PP_1191 | S4 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/29); new base A (2/2); total (33/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.75e-01 | |||||||||||
TCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTT > NC_002947/1366206‑1366501 | tCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCg > 1:88949/1‑150 (MQ=255) gcgcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgc > 1:923814/1‑150 (MQ=255) gcATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGgcgc > 2:1304554/1‑150 (MQ=255) ccccACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCt > 1:1527570/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAg < 2:521376/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACGCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCg < 2:47984/150‑1 (MQ=255) gcCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGt < 2:987640/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCa > 1:1263285/1‑150 (MQ=255) cGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACg < 1:73514/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCa > 2:1166043/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCa > 1:1630368/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCAATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCa > 1:1410138/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGACCg > 2:1500072/1‑116 (MQ=255) gcgcCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGACCg < 1:1500072/116‑1 (MQ=255) gcCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGTTACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCACTGGCGGCACGCGCCAGCGGGGCCACGCAGGCCTGc > 1:107153/1‑150 (MQ=255) gtggtTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCaaaa < 2:51437/150‑1 (MQ=255) tggtTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAAt < 2:1263285/150‑1 (MQ=255) ggtTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATg > 1:975119/1‑150 (MQ=255) gtTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAgg < 2:661622/99‑1 (MQ=255) gtTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAgg > 1:661622/1‑99 (MQ=255) gtTTCACCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCGCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGc > 2:1257116/1‑150 (MQ=255) tttCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGcc < 2:918775/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCAATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGccc < 2:1410138/150‑1 (MQ=255) gcACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAggg > 1:1475632/1‑150 (MQ=255) tgatgaACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCatttt < 1:1378253/129‑5 (MQ=255) tgatgaACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCatttt < 1:1377957/129‑5 (MQ=255) tgatgaACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCatttt > 2:1378253/1‑125 (MQ=255) tgatgaACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCatttt > 2:1377957/1‑125 (MQ=255) gaACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCaa < 2:1401376/122‑1 (MQ=255) gaACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCaa > 1:1401376/1‑122 (MQ=255) cTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGc > 1:459343/1‑108 (MQ=255) cTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGc < 2:459343/108‑1 (MQ=255) tCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCgg < 1:762198/150‑1 (MQ=255) ctggtCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGc < 2:158971/87‑1 (MQ=255) cTGGTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGc > 1:158971/1‑91 (MQ=255) cTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTg < 2:1630368/150‑1 (MQ=255) cTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTg < 2:416486/150‑1 (MQ=255) cTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGc > 2:1143946/1‑150 (MQ=255) aGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCATGGCGCGCACGCCTTCGCGGGGGGCcgcg > 2:774818/1‑150 (MQ=255) aGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGC‑AAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGc > 2:948157/1‑150 (MQ=255) aGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGACCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTc < 2:967417/149‑1 (MQ=255) aGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGACCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTc > 1:967417/1‑149 (MQ=255) gACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGa < 1:1312606/150‑1 (MQ=255) gCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAgg > 2:681594/1‑56 (MQ=255) gCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAgg < 1:681594/56‑1 (MQ=255) ggTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGc < 2:1115174/150‑1 (MQ=255) gCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATg > 1:991064/1‑150 (MQ=255) tCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTc > 1:1601804/1‑150 (MQ=255) tCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTc > 1:1587885/1‑150 (MQ=255) cGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCa < 2:1601804/150‑1 (MQ=255) cTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCt < 2:1475632/150‑1 (MQ=255) cccGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCAt < 2:770416/150‑1 (MQ=255) cAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCa < 1:1257116/150‑1 (MQ=255) cAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCa < 1:1166043/150‑1 (MQ=255) tCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTg > 2:709218/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGccc > 1:1204624/1‑72 (MQ=255) cTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGccc < 2:1204624/72‑1 (MQ=255) cTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTgg < 2:139611/100‑1 (MQ=255) cTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTgg > 1:139611/1‑100 (MQ=255) cTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTg > 1:1462920/1‑99 (MQ=255) cTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTg < 2:1462920/99‑1 (MQ=255) tGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTcc > 2:803064/1‑150 (MQ=255) gggTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTgg < 2:720507/98‑1 (MQ=255) gggTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTgg > 1:720507/1‑98 (MQ=255) aaCACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCg > 1:932573/1‑150 (MQ=255) ccggCATGCCGGTGGCGCCACGCGCGAGTGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCggctg < 2:88949/147‑1 (MQ=255) cTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCggctgg > 2:1218274/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCGCTGGCGCCACGCGCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCggctggct < 2:819104/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCGAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGtt > 1:786573/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGtt < 2:923814/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGtt > 1:261342/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGtt > 2:984773/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGtt < 1:1304554/150‑1 (MQ=255) | TCATTGCGCATGGCCCCACGCGCCAGGCGTTCCAGCGCCTGGGGGGTGGTTTCGCCGCGCACTTCAATGATGAACTCCTGCTCCAGGCGACGCAGGTCGGCCTCGATCTTGCGGGATACCCGCCAGTCCTGGGTAAACACCTGCAGGCCGCTGGCGCCACGCTCCAGCGGTGCCACGCAGGCCTGCCGGGCAAAATGCCCGTGCAGGGCGCGCACGCCTTCGCGGTGGGCCTCGCTGAGGCTGCCCATGTTCATGCTGGCGCGGGCATCTTCACTGTCCATGCCGGCTGGCTGGTT > NC_002947/1366206‑1366501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |