| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,481,522 | T→C | 10.1% | S75G (AGC→GGC) | rhlB ← | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,481,522 | 0 | T | C | 10.1% | 190.6 / 10.2 | 69 | S75G (AGC→GGC) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/28); new base C (4/3); total (38/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 | |||||||||||
CCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTT > NC_002947/1481378‑1481662 | ccAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCCTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCt > 2:88051/1‑150 (MQ=255) aGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCtgt < 1:1358772/150‑1 (MQ=255) gACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTgg > 1:250945/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggctt < 1:420106/150‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCCAGCCTGTggaagc < 2:977991/150‑5 (MQ=255) tGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggcttg < 2:992953/150‑1 (MQ=255) ggATCGGCGTGCAGTACGGTAATCCCATGCCGGGGATGGCGTGCATCAGCTCGTGGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggcttcc < 1:1291182/150‑3 (MQ=255) ggATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTg > 1:1547038/1‑131 (MQ=255) ggATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTg < 2:1547038/131‑1 (MQ=255) ggATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGc < 2:250945/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTc < 2:1340971/150‑1 (MQ=255) gCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTcgcggcg < 1:244134/150‑1 (MQ=255) cAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCCAGCCTGTggaa > 2:258877/1‑128 (MQ=255) cAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCCAGCCTGTggaa < 1:258877/130‑3 (MQ=255) gAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTc > 1:88973/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTgg > 2:12428/1‑150 (MQ=255) aGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGcc > 2:915536/1‑150 (MQ=255) gTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGtt > 2:1229223/1‑149 (MQ=255) gTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGtt < 1:1229223/149‑1 (MQ=255) tGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCgg < 2:684394/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCATACTGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGc < 1:430636/150‑1 (MQ=255) aTCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGc > 1:482360/1‑150 (MQ=255) aTCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGGTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTggg > 1:716192/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCtg < 2:783638/91‑1 (MQ=255) tCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCtg > 1:783638/1‑91 (MQ=255) tCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTg < 1:1387844/128‑1 (MQ=255) tCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTg > 2:1387844/1‑128 (MQ=255) aGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTc > 1:291629/1‑150 (MQ=255) gCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTcgcgg > 1:524089/1‑110 (MQ=255) gCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTcgcgg < 2:524089/110‑1 (MQ=255) gCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCgg > 2:994527/1‑138 (MQ=255) gCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCgg < 1:994527/138‑1 (MQ=255) cTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTg > 1:1260823/1‑131 (MQ=255) cTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTg < 2:1260823/131‑1 (MQ=255) cTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTg > 2:857377/1‑150 (MQ=255) gTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCCTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTcgc < 1:1218199/132‑1 (MQ=255) gTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCCTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTcgc > 2:1218199/1‑132 (MQ=255) tCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGcc > 2:1053441/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggctt > 2:467878/1‑77 (MQ=255) tGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggctt < 1:467878/77‑1 (MQ=255) ggAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg < 1:1216500/150‑1 (MQ=255) aaGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgggg > 2:306644/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTg < 2:1016437/97‑1 (MQ=255) gCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTg > 1:1016437/1‑97 (MQ=255) ggttggtGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGCGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCgg < 1:22809/144‑1 (MQ=255) gTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCgggg > 2:979009/1‑150 (MQ=255) ttttGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGt > 1:506143/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggctt > 2:125703/1‑63 (MQ=255) gCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggctt < 1:125703/63‑1 (MQ=255) cTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGc < 1:973815/148‑1 (MQ=255) cTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGc > 2:973815/1‑148 (MQ=255) ccTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATtgg < 1:857377/150‑1 (MQ=255) gCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGGTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTGGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTg < 2:88973/150‑1 (MQ=255) aCGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGtttt > 1:1197616/1‑150 (MQ=255) cGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGt < 1:902127/74‑1 (MQ=255) cGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGt > 2:902127/1‑74 (MQ=255) cGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTg > 2:194447/1‑150 (MQ=255) gTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCcgc > 1:123633/1‑150 (MQ=255) tCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCcgcg > 1:881578/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcggg > 2:112863/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTAACCTGGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcggg > 1:920238/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccgg < 1:88051/150‑1 (MQ=255) ccaagccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccgg > 2:1337301/6‑150 (MQ=255) cTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccgggc > 1:945002/1‑150 (MQ=255) gccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATg < 2:659472/117‑1 (MQ=255) gccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATg > 1:659472/2‑118 (MQ=255) gccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCtt > 1:560351/2‑150 (MQ=255) cacaGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGc < 2:1418405/113‑1 (MQ=255) cacaGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGc > 1:1418405/1‑113 (MQ=255) | CCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTT > NC_002947/1481378‑1481662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |