| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,521,033 | T→A | 5.3% | L83* (TTG→TAG) ‡ | murD → | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,521,033 | 0 | T | A | 5.3% | 231.5 / 2.3 | 74 | L83* (TTG→TAG) ‡ | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/36); new base A (2/2); total (36/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
TGCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAAT > NC_002947/1520884‑1521180 | tGCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCtt < 2:1071792/150‑1 (MQ=255) cGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCggg < 1:1363675/150‑2 (MQ=255) cGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGc < 1:461942/150‑1 (MQ=255) gCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGc < 1:161291/140‑1 (MQ=255) gCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGc > 2:161291/1‑140 (MQ=255) ccGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCt < 1:680627/150‑1 (MQ=255) aTACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTgc < 1:683313/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGCACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCCCGCCGGCCTTgcagcc > 2:1449191/1‑149 (MQ=255) ccGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTTGCCTTGGCCACGCCGGCCTTgcagca > 2:1279383/1‑150 (MQ=255) gAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCgcgtggc < 1:1400941/150‑1 (MQ=255) aaCTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCgcgtggcg > 2:1093991/1‑150 (MQ=255) tGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGcaag < 2:391797/139‑4 (MQ=255) tGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGcaag > 1:391797/1‑136 (MQ=255) ggAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGaa > 1:120559/1‑150 (MQ=255) tGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTg < 2:361907/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGCCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTg < 2:1291490/150‑1 (MQ=255) ccGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGa < 2:1479120/150‑1 (MQ=255) cGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGAc < 1:1123636/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATaga > 2:1356692/1‑150 (MQ=255) tACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATagag > 2:1625150/1‑150 (MQ=255) cccGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCt < 1:1073327/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg < 1:60519/87‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg > 2:60519/1‑87 (MQ=255) ccGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTg > 1:51376/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGtt < 2:120559/150‑1 (MQ=255) aGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTg > 2:472782/1‑150 (MQ=255) gTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCt > 1:509606/1‑150 (MQ=255) tGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTg < 2:90041/95‑1 (MQ=255) tGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTg > 1:90041/1‑95 (MQ=255) aGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCa < 2:51376/150‑1 (MQ=255) aaCTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGa > 1:184348/1‑150 (MQ=255) aCTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCAt < 1:873375/136‑1 (MQ=255) aCTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCAt > 2:873375/1‑136 (MQ=255) gACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAAGGAGCCGAACGTGAACCCCGGGACTGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTTCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGtt > 1:205155/1‑150 (MQ=255) gACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTTGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGtt < 1:1279383/150‑1 (MQ=255) gACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGtt > 2:1536832/1‑150 (MQ=255) cGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGc > 2:864085/1‑150 (MQ=255) gACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATc < 1:1477374/150‑1 (MQ=255) cTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAg < 2:205155/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTg > 1:1259057/1‑109 (MQ=255) ccTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTg < 2:1259057/109‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTgg < 1:1093991/150‑1 (MQ=255) cTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGt < 2:509606/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCa < 2:1645650/144‑1 (MQ=255) tgtgCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGCTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGtt < 1:1216612/150‑1 (MQ=255) tgggCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCa > 1:1645650/4‑144 (MQ=255) 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aCGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAaga < 1:1536832/150‑1 (MQ=255) gTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCacg > 2:1159163/1‑150 (MQ=255) tGAGCCACGGCCTGGCCTTGGACACGCCGGCCGTGCAGCGGCCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGTGCTTTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGTTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCacga < 2:623840/150‑1 (MQ=255) gAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGtt < 2:638770/112‑1 (MQ=255) gAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGtt > 1:638770/1‑112 (MQ=255) gAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCacgac > 1:1618763/1‑150 (MQ=255) ccGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGcc > 2:627080/1‑87 (MQ=38) ccGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGcc < 1:627080/87‑1 (MQ=38) ccGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGt < 1:142562/78‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGt > 2:142562/1‑78 (MQ=255) cGGCGTGGCCAAGGCCAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGAAATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGCCGCCGATCGTTGCAATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCCCGAGGCTggc > 2:279658/1‑149 (MQ=255) ggcctggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGt > 1:1516225/1‑117 (MQ=255) ggcctggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGt < 2:1516225/117‑1 (MQ=255) ctggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTg > 1:642565/1‑112 (MQ=255) ctggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTg < 2:642565/112‑1 (MQ=255) ctggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGc > 1:732765/1‑142 (MQ=255) ctggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGc < 2:732765/142‑1 (MQ=255) tggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCaa > 2:27535/1‑118 (MQ=255) tggcctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCaa < 1:27535/118‑1 (MQ=255) cctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGttt < 1:106856/71‑1 (MQ=255) cctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGttt > 2:106856/1‑71 (MQ=255) ctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCa > 2:674448/1‑125 (MQ=255) ctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCa < 1:674448/125‑1 (MQ=255) ctTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAAt > 2:249286/1‑150 (MQ=255) | TGCCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGAAAT > NC_002947/1520884‑1521180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |