| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,720,469 | G→A | 5.3% | R56H (CGC→CAC) | PP_1516 → | RND membrane fusion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,720,469 | 0 | G | A | 5.3% | 229.0 / 2.7 | 76 | R56H (CGC→CAC) | PP_1516 | RND membrane fusion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/44); new base A (2/2); total (30/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.20e-01 | |||||||||||
CATCGCTCTGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGCCTGCAACTTGAAGCCAACCGCGCCCAG > NC_002947/1720323‑1720614 | cATCGCTCTGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCtt > 2:132537/1‑150 (MQ=255)cATCGATCTGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCtt > 2:407348/1‑150 (MQ=255) aTCGCTCTGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTc > 1:39192/1‑150 (MQ=255) gCTCTGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAg < 1:494032/150‑1 (MQ=255) ctctGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGc > 1:1374833/1‑150 (MQ=255) tctGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGcc < 1:439282/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGTCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCGGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCg < 2:126965/149‑1 (MQ=255) ctGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGCGCGCGCGCACTTCgccggg < 1:233914/150‑6 (MQ=255) 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ccTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCAt < 1:505651/150‑1 (MQ=255) cTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGCAGCCGCTGTCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCAtt > 1:1427827/1‑150 (MQ=255) cTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCAtt > 2:1535658/1‑150 (MQ=255) cTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCAtt > 1:976272/1‑150 (MQ=255) gCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCCTCCGCATTgg < 1:562286/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCtt < 2:1582334/121‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCtt > 1:1582334/1‑121 (MQ=255) tCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTggcgg < 1:1535658/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAg < 2:923359/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGCAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAg < 1:630808/150‑1 (MQ=255) ggcgTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGt < 1:671607/150‑1 (MQ=255) tCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCg > 1:1489608/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCtg < 2:1374833/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCtgg > 2:533671/1‑150 (MQ=255) cgccCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTgga < 1:1300419/150‑1 (MQ=255) cccACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAACGCAAGCTAGCGTCGGGTggagga < 2:1637334/150‑1 (MQ=255) cACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGaggagg < 2:1315401/150‑1 (MQ=255) cACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCGTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGaggagg < 2:340204/150‑1 (MQ=255) aCCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAggg > 2:1581050/1‑150 (MQ=255) aCCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAggg > 1:1510796/1‑150 (MQ=255) ccgccgCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTgg < 2:793453/102‑1 (MQ=255) ccgccgCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTgg > 1:793453/1‑102 (MQ=255) accagcgccgggcgCGGCGCGGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTgg < 2:156056/110‑1 (MQ=255) accagcgccgggcgCGGCGCGGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTgg > 1:156056/5‑114 (MQ=255) ccagcgccgggcgCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGaggagg > 1:171390/4‑145 (MQ=255) ccagcgccgggcgCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGaggagg < 2:171390/142‑1 (MQ=255) cagcgccgggcgCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGc > 1:637872/3‑150 (MQ=255) gcgccgggcgCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCgg < 2:637872/150‑1 (MQ=255) gcgccgcgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGTCAGCgg > 1:1113300/1‑150 (MQ=255) gcgccgcgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCgg < 2:1489608/150‑1 (MQ=255) gcgccgcgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGCCTGGTGGAGGAGGGGCAGCgg < 2:922536/150‑1 (MQ=255) cgccgcgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGGGCTGGCTTTCCGCCTTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCggg < 2:723900/150‑1 (MQ=255) gcgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCaa < 2:814860/120‑1 (MQ=255) gcgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCaa > 1:814860/1‑120 (MQ=255) gcgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCaa < 1:1389084/150‑1 (MQ=255) cgccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACCGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTCCCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGACTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAg < 2:29535/150‑1 (MQ=255) gccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAgg < 2:39192/150‑1 (MQ=255) gccCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAgg < 2:976272/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTcc < 2:409507/94‑1 (MQ=255) ccGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTcc > 1:409507/1‑94 (MQ=255) ggCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGa < 2:1012096/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGa < 1:999681/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGAc > 2:286456/1‑150 (MQ=255) gcggCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGc < 1:488630/147‑1 (MQ=255) cacaGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGATGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGTCCGACCAGCCGCTGGCCGAAc < 2:745031/150‑1 (MQ=255) acaGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAgggg > 1:255051/1‑115 (MQ=255) acaGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAgggg < 2:255051/115‑1 (MQ=255) cggccgAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGAcc > 1:1201806/1‑150 (MQ=255) ggccgAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGAccc > 2:1309261/1‑150 (MQ=255) cgAAGTCGCTGCCGATATTGATCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCa < 2:507016/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGa > 2:1506650/1‑53 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGa < 1:1506650/53‑1 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAg < 1:193949/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAg < 1:153122/150‑1 (MQ=255) ccGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGcc < 2:1201806/150‑1 (MQ=255) ccccGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGTCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGCCTGCAACTTGa > 1:1396425/1‑150 (MQ=255) cccGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGCCTGCAACTTGaa < 1:132537/150‑1 (MQ=255) cGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAgg < 2:23686/95‑1 (MQ=255) cGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAgg > 1:23686/1‑95 (MQ=255) cGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGCCTGCAACTTGAAGc > 2:1566919/1‑150 (MQ=255) tcGAAGCGCGCGCGCACTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAAc < 1:562738/113‑1 (MQ=255) tcGAAGCGCGCGCGCACTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAAc > 2:562738/2‑114 (MQ=255) tcGAAGCGCGCGCGCACTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGCCTGCAACTTGAAGCCa > 2:345472/2‑150 (MQ=255) gcgcgcTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGCCTGCAACTTGAAGCCAACCGCGCCCAg > 1:1208321/1‑150 (MQ=255) | CATCGCTCTGCCCGCCGCCGCTGCCCTGCTTCTGGCGGCGTGTGGTCAGGAAGCCGCCCCACCCGCCGCGCCGCGCCCGGCGCTGGTGGTGCAGCCACAGCCGGCCGAAGCCGCTGCCGACAGTTACCCCGGCGAAGTGCGCGCGCGCTTCGAGCCGGAGCTGGCCTTCCGCATTGGCGGCAAGGTCAGCAAGCGTCTGGTGGAGGAGGGGCAGCGGGTCAAGGCCGACCAGCCGCTGGCCGAACTGGACCCGCAGGACGTGCGCCTGCAACTTGAAGCCAACCGCGCCCAG > NC_002947/1720323‑1720614 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |