| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,033,417 | C→G | 5.2% | I285M (ATC→ATG) | pgi‑I → | glucose 6‑phosphate isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,033,417 | 0 | C | G | 5.2% | 205.0 / 2.3 | 70 | I285M (ATC→ATG) | pgi‑I | glucose 6‑phosphate isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/32); new base G (2/2); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCGGAAGCCGAGCTGTACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTATGGCAA > NC_002947/2033268‑2033551 | tCGGAAGCCGAGTTGTACCGCCATTTTATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCTTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGCCTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATc < 2:1574730/150‑1 (MQ=11)tCGGAAGCCGAGCTGTACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATc > 1:733909/1‑150 (MQ=35) aGCCGAGCTGTACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCt < 2:1388667/150‑1 (MQ=34) cGAGCTGTACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGc > 1:1488952/1‑150 (MQ=35) gAGCTGTACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCAGCCTGCCGATCGCCCTGGcc > 1:1557553/1‑150 (MQ=25) tGTACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCATTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCg > 1:1097924/1‑150 (MQ=25) tACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGc > 2:792574/1‑150 (MQ=34) ccGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GTTGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATGGCCAGGGCGATCGGCag < 2:398632/150‑2 (MQ=11) ccGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCAc > 1:1044403/1‑150 (MQ=35) ttGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCa > 2:563686/1‑150 (MQ=35) tGCCGTACCCAGCAACAAGGCCG‑CGGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAAAAAACATCTTCCC‑GATGGGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCaa < 2:1191485/150‑1 (MQ=255) tGCCGTACCCAGCAACAAGCCGG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTACCCGCGAAGAAAACACCTCCCT‑GTTGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCaa < 2:1307276/150‑1 (MQ=11) ggCCGTACCCAGC‑ACAAATCCGCCTGCTTAAGCGTTCGGTATCCGCAAAGAAACCCTTTCCCC‑GATGTGGGCCGGGGTGGCTCGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCaa < 1:902098/149‑1 (MQ=11) gCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTCCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAg < 2:1567279/150‑1 (MQ=21) tCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAActg < 1:792574/150‑1 (MQ=34) aGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAAc > 1:1042938/1‑145 (MQ=35) aGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAAc < 2:1042938/145‑1 (MQ=34) caacaaGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTc < 2:1488952/150‑1 (MQ=34) ggCCG‑CTGCTGTGGCTTTCGGTATCCGCGAAAAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGc < 2:1044403/150‑1 (MQ=255) ggCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGTTATCCGCGAAAAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCAGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGc < 2:1557553/150‑1 (MQ=255) ggCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGc > 1:1308401/1‑150 (MQ=38) cG‑CTGCTGTAGCGTCGGGTACCCGCAAAAAAACCATCTCCCT‑GTTGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTa < 1:292565/150‑1 (MQ=11) tgTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATAGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCAt > 1:130028/1‑150 (MQ=255) ttAGCGTTCGGTATCGGCGAAGAAAACA‑CTTCCCGGAGGGGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATg < 2:74815/149‑1 (MQ=11) tATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACtt > 1:1286429/1‑150 (MQ=38) tATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACtt > 1:979303/1‑150 (MQ=39) tCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCa < 2:1381060/142‑1 (MQ=38) tCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCa > 1:1381060/1‑142 (MQ=39) gaaAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCAt > 2:730341/1‑128 (MQ=40) gaaAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCAt < 1:730341/128‑1 (MQ=40) gaaAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCa > 2:1110713/1‑150 (MQ=39) aaCATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCg > 2:375985/1‑150 (MQ=39) cATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATAGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGtt < 2:130028/150‑1 (MQ=38) aTCTTCCC‑GATGTGGGCCTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGt < 2:464091/111‑1 (MQ=37) aTCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTc < 2:1097924/150‑1 (MQ=38) aTCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGAGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGt > 1:464091/1‑111 (MQ=38) ttCCC‑GATGTGGGACTGGGGGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCgg > 2:21735/1‑77 (MQ=255) ttCCC‑GATGTGGGACTGGGGGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGAc < 2:753330/150‑1 (MQ=38) ttCCC‑GATGGGGGACGGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCgg < 1:21735/77‑1 (MQ=255) gATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGaa > 1:685889/1‑150 (MQ=35) tgGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGaa > 2:706008/1‑146 (MQ=35) tgGGACTGGGTGGGGGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGaa < 1:706008/146‑1 (MQ=17) gggACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGt < 1:1136060/98‑1 (MQ=34) gggACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCAATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGt > 2:1136060/1‑98 (MQ=25) aCTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCgg > 2:864408/1‑150 (MQ=35) tgggtgggtgggCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATg < 2:356377/105‑1 (MQ=38) tgggtgggtgggCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATg > 1:356377/1‑105 (MQ=38) tgggtgggCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTAc < 2:1286429/150‑1 (MQ=35) ggtgggCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTg > 1:1241524/1‑150 (MQ=35) gtgggCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTgg < 1:80581/150‑1 (MQ=34) tACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCGGACGCCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGAGACGAAACTGCCGGGGCTACTGGCCctgctg > 1:1179706/1‑150 (MQ=11) cTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTggg > 1:554263/1‑150 (MQ=32) tCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGc < 1:1615813/150‑1 (MQ=32) gCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGAc > 2:1227932/1‑102 (MQ=33) gCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGAc < 1:1227932/102‑1 (MQ=33) cTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCgtg < 1:1110713/150‑1 (MQ=32) tgtgGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGc < 2:573361/146‑1 (MQ=32) tgtgGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGc > 1:573361/1‑146 (MQ=32) tgtgGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCgtgt > 1:1233460/1‑150 (MQ=32) tgtgGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCgtgt < 2:554263/150‑1 (MQ=32) gTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTa > 1:1405226/1‑150 (MQ=32) cGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTATg > 1:152343/1‑150 (MQ=32) gcgaTCGGCAGGCCGATGGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTc > 2:1225006/4‑102 (MQ=11) gCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTATGGc < 2:733909/150‑1 (MQ=32) ccATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGtgtg > 1:1547577/1‑142 (MQ=32) ccATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGtgtg < 2:1547577/142‑1 (MQ=32) cATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGTTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCTTGTGGTATGGCaa > 2:1604962/1‑150 (MQ=12) cATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTATGGCaa < 1:375985/150‑1 (MQ=32) cTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTATGGc < 1:1255570/141‑1 (MQ=32) cTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTATGGc > 2:1255570/1‑141 (MQ=32) tGCCGATGGCCAGGGCGATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTgg > 2:1481744/1‑126 (MQ=11) tGCCGATGGCCAGGGCGATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTgg < 1:1481744/126‑1 (MQ=11) | TCGGAAGCCGAGCTGTACCGCCACTTCATTGCCGTATCCAGCAACAAGGCCG‑CTGCTGTAGCGTTCGGTATCCGCGAAGAAAACATCTTCCC‑GATGTGGGACTGGGTGGGTGGGCGCTACTCGCTGTGGTCGGCCATCGGCCTGCCGATCGCCCTGGCCATCGGCACTGCCAACTTCAAGGAACTGCTGTCCGGTGCCTACACCATGGACCAGCACTTCCAGACCGCACCGTTCGACAAGAACATGCCGGTGCTACTGGCCCTGCTGGGCGTGTGGTATGGCAA > NC_002947/2033268‑2033551 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |