| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,341,621 | G→T | 6.5% | L266L (CTG→CTT) | yraO → | transporter YraO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,341,621 | 0 | G | T | 6.5% | 195.7 / 2.5 | 61 | L266L (CTG→CTT) | yraO | transporter YraO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/28); new base T (2/2); total (31/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.37e-01 | |||||||||||
TACATCAAGGAAATCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGTCGATGCAT > NC_002947/2341472‑2341760 | tACATCAAGGAAATCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtg > 2:405866/1‑150 (MQ=255) aCATCAAGGAAATCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtga < 1:405866/150‑1 (MQ=255) aTCAAGGAAATCCTCGGCGACACTCCTCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtgatg < 2:379158/150‑1 (MQ=255) aGGAAATCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtgat < 1:360995/145‑1 (MQ=255) aGGAAATCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtgat > 2:360995/1‑145 (MQ=255) gAAATCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAAc > 2:1376487/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACt > 1:770709/1‑150 (MQ=255) aTCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTAc < 2:628984/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCaa > 1:1060118/1‑143 (MQ=255) cTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCaa < 2:1060118/143‑1 (MQ=255) cGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCa > 2:1137943/1‑150 (MQ=255) gACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtgatg > 1:143282/1‑132 (MQ=255) gACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtgatg < 2:143282/132‑1 (MQ=255) ccGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtgat > 1:1147046/1‑125 (MQ=255) ccGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACtgat < 2:1147046/125‑1 (MQ=255) aaGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCCGGGTACGGTCCTGATGATGGTCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGaaa > 1:28870/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGaaa < 1:33077/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAaga > 1:839400/1‑150 (MQ=255) gcgcCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAaga > 2:907264/1‑150 (MQ=255) gcCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAgc < 2:322202/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCATCTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAgcgc > 1:1189467/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAgcgc > 2:1432784/1‑150 (MQ=255) cTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTc < 2:770709/150‑1 (MQ=255) gCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGcc < 1:1137943/150‑1 (MQ=255) cTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCa > 2:186074/1‑150 (MQ=255) aTGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCACCGCTGAACTGGAGTTTGGTGGTGTTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCAtt < 1:1598922/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGc > 1:1101416/1‑150 (MQ=255) aCCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCggg > 1:320767/1‑148 (MQ=255) aCCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCggg < 2:320767/148‑1 (MQ=255) gtgATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGAcc > 1:1287740/1‑150 (MQ=255) tgATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCg > 2:1116568/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCgtg < 1:1116568/150‑1 (MQ=255) tCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCgtgg > 1:1218847/1‑150 (MQ=255) ccGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGtgc > 1:1552332/1‑150 (MQ=255) tgatgaCCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGtgctgc < 1:1551255/150‑1 (MQ=255) gatgaCCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTgctgct > 1:65820/1‑150 (MQ=255) atgaCCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGctgctg < 2:839400/150‑1 (MQ=255) gaCCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGgt < 2:1552332/150‑1 (MQ=255) ccGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGAc < 1:152570/89‑1 (MQ=255) ccGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGAc > 2:152570/1‑89 (MQ=255) ccGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATAATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGgtgt > 1:378502/1‑150 (MQ=255) gTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCa > 2:733978/1‑125 (MQ=255) gTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCa < 1:733978/125‑1 (MQ=255) tGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCgg < 2:1519088/150‑1 (MQ=255) tGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCgg < 1:186074/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCggg > 2:1280170/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGc < 1:1376487/150‑1 (MQ=255) gggCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCgg > 1:683143/1‑145 (MQ=255) gggCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCgg < 2:683143/145‑1 (MQ=255) gCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATAATAGCGGAAGAGGGCAGCGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCtt > 2:458007/1‑150 (MQ=255) gATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGc > 1:1367842/1‑150 (MQ=255) gcgGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCAGTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTAtt < 2:385913/150‑1 (MQ=255) cATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTa < 2:1453625/143‑1 (MQ=255) cATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTa > 1:1453625/1‑143 (MQ=255) cATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGAGAAGCTCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTtctc > 1:430859/1‑150 (MQ=255) tCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCgg < 1:907264/150‑1 (MQ=255) tCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCgg < 2:1218847/150‑1 (MQ=255) aTGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGAc < 1:688340/48‑1 (MQ=255) aTGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGAc > 2:688340/1‑48 (MQ=255) gATCGGTTTCGTCGCCGCACTTATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAgc < 1:630599/59‑1 (MQ=255) gATCGGTTTCGTCGCCGCACTTATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAgc > 2:630599/1‑59 (MQ=255) gATCGGTTTCGTCGCCGCACTTATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAgc > 2:630617/1‑59 (MQ=255) gATCGGTTTCGTCGCCGCACTTATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAgc < 1:630617/59‑1 (MQ=255) gATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGAt > 2:292893/1‑150 (MQ=255) cGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGt < 2:65820/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTAACCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGTc > 2:1102584/1‑150 (MQ=255) gctttCGTCGTCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTAGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGTc < 1:908960/148‑1 (MQ=255) tttCGTCGCCGCACTGATGATCATCTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCACGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGTCGa < 2:1189467/150‑1 (MQ=255) tttCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGTCGa < 2:1287740/150‑1 (MQ=255) tcgCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGTCGATGCAt < 2:1367842/150‑1 (MQ=255) | TACATCAAGGAAATCCTCGGCGACAACCCGCACAAGCGCCCGCGCCTTGCCTATGTGAACCTGGTGCTGGTGATCGCCGTGATGACCGCGTTGGTGCTGGGGCTGATGCACGCGGCCATCCTGTTCATGATCGGTTTCGTCGCCGCACTGATGATCAACTACCCGCAGCTGGACCTGCAGAAAGAGCGCATCCTCGCCCATTCGGGCAACGCCATGACCGTGGTGCTGCTGGTGTTCGCCGCGGGCATCTTTGCCGGTATTTTCTCGGGTACCAAGATGGTCGATGCAT > NC_002947/2341472‑2341760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |