| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,416,598 | A→T | 7.6% | intergenic (+88/+27) | pdxB → / ← PP_2118 | erythronate‑4‑phosphate dehydrogenase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,416,598 | 0 | A | T | 7.6% | 256.0 / 10.6 | 79 | intergenic (+88/+27) | pdxB/PP_2118 | erythronate‑4‑phosphate dehydrogenase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/41); new base T (2/4); total (34/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.04e-01 | |||||||||||
TGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATACTTGCG > NC_002947/2416449‑2416746 | tGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCaa < 2:431981/150‑1 (MQ=255)cgCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCaa < 2:1309195/149‑1 (MQ=255) ggAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGTTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCgg < 1:723537/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCgg < 2:110452/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCgg < 2:110523/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGt < 1:222517/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGt < 1:924497/150‑1 (MQ=255) cgcagttggcgcagttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCaga < 2:851269/150‑1 (MQ=255) gcagttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCg > 1:320862/1‑150 (MQ=255) cagttggTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGa < 2:1476405/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGc < 2:763649/150‑1 (MQ=255) cccTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGt < 1:411445/150‑1 (MQ=255) cTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCgg > 1:1079999/1‑116 (MQ=255) cTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCgg < 2:1079999/116‑1 (MQ=255) cTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGa > 2:253405/1‑135 (MQ=255) cTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGa < 1:253405/135‑1 (MQ=255) tgggtgggGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCaa > 1:650012/1‑108 (MQ=255) tgggtgggGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCaa < 2:650012/108‑1 (MQ=255) gggtgGTCGGCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCg > 2:1642616/1‑150 (MQ=255) gtgtTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGac < 1:111551/150‑1 (MQ=255) ttGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGc > 2:1347337/1‑109 (MQ=255) ttGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGc < 1:1347337/109‑1 (MQ=255) cTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCttt > 2:117222/1‑150 (MQ=255) tAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTttc > 2:1353970/1‑150 (MQ=255) aaGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTttct > 2:916002/1‑150 (MQ=255) cACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTcc < 1:916002/150‑1 (MQ=255) gCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAgg > 2:1479141/1‑150 (MQ=255) tGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCCGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACTGCTTTCTTCCAGGGCCt < 2:654910/150‑1 (MQ=255) ttGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTc > 2:673148/1‑123 (MQ=255) ttGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTc < 1:673148/123‑1 (MQ=255) ttGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCtt > 1:1483163/1‑147 (MQ=255) ttGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCtt < 2:1483163/147‑1 (MQ=255) ttGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCAAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCa > 1:1363505/1‑150 (MQ=255) tGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCCCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTCCCAGGGCCTTGCAg < 2:678713/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCCAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCa < 1:1532339/138‑1 (MQ=255) gACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCa > 2:1532339/1‑138 (MQ=255) gACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCa > 2:1532436/1‑138 (MQ=255) gACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCa < 1:1532436/138‑1 (MQ=255) gACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAgg < 2:811892/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGc < 2:294294/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGc < 1:809192/150‑1 (MQ=255) acaggCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGcc < 2:1632555/146‑1 (MQ=255) ttGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGATCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCctg > 1:364184/1‑150 (MQ=255) gCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCctgct < 2:662602/150‑1 (MQ=255) tgtgGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCctg < 1:107405/139‑1 (MQ=255) tgtgGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCctg > 2:107405/1‑139 (MQ=255) tgtgGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCt > 2:199725/1‑150 (MQ=255) tgGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACgcgc < 1:832978/102‑1 (MQ=255) tgGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACgcgc > 2:832978/1‑102 (MQ=255) gTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTc < 1:1459461/150‑1 (MQ=255) ttACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCg < 1:1353970/150‑1 (MQ=255) tGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGc < 1:861399/126‑1 (MQ=255) tGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGc > 2:861399/1‑126 (MQ=255) ttGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCGGGtttt > 2:1337895/1‑57 (MQ=25) ttGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCTTGCGCCGGGtttt < 1:1337895/59‑3 (MQ=25) ttGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCg < 1:1479141/150‑1 (MQ=255) gcggcCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGaca > 1:764474/1‑93 (MQ=255) gcggcCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGaca < 2:764474/93‑1 (MQ=255) gcggcCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACt > 1:1498470/1‑150 (MQ=255) ggcCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTc < 1:1642616/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGa > 1:1645970/1‑123 (MQ=255) ccAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGa < 2:1645970/123‑1 (MQ=255) ccAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTcgc > 2:1286494/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACgcgc < 2:290426/82‑1 (MQ=255) cAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACgcgc > 1:290426/1‑82 (MQ=255) cAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATAATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTcgcg > 1:1158002/1‑150 (MQ=255) aaGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCgcgc > 2:1239150/1‑150 (MQ=255) ccACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGaca < 2:735408/83‑1 (MQ=255) ccACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGaca > 1:735408/1‑83 (MQ=255) aCTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatcat < 1:141450/119‑1 (MQ=255) aCTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatcat > 2:141450/1‑119 (MQ=255) aCTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTg < 1:1239150/150‑1 (MQ=255) tggctggGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGc < 1:117222/150‑1 (MQ=255) gctggGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCa < 1:777776/100‑1 (MQ=255) gctggGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCa > 2:777776/1‑100 (MQ=255) gctggGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGCCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGt < 1:341622/150‑1 (MQ=255) tggGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACGCGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCg > 2:569768/1‑150 (MQ=255) ggCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCgat < 1:194247/150‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatcat < 1:1195982/107‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGatcat > 2:1195982/1‑107 (MQ=255) tctgcaaCCCGGCGCTTGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCgg < 2:699846/109‑1 (MQ=255) tctgcaaCCCGGCGCTTGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCgg > 1:699846/6‑114 (MQ=255) ccGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCAt > 1:1513159/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATACTTGCg > 2:1318023/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGATGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATACTTGCg > 1:255668/1‑150 (MQ=255) aaGCCCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGACGACAAGCTGGATCATCAGCT‑GGTCGCCGAACAGTGCACGGTCCTGAGCGGCGATGATCGAACCGCATACTTGCg < 1:284034/150‑1 (MQ=255) | TGCACGGGGAGGCGCCGCAGTTGGCGCAGTTGGTCAGTGCCCTGGGTGGGGTGTTGGTCTAAGCACGCCTTGTCTTGACCTTGCAGGTAGGTGTGGTTACCTGTTGGGGCGGCCAAGCCCACTGGCTGGGCCAATAAAAACCCGGCGCAAGCGCCGGGTTGCAGAGAATTCGCCGATCAACCTTTGCGTACGCGCTCGACACGGCTTTCTTCCAGGGCCTTGCAGGCCTGCTGGATCATCTGCTCGGTGATCG‑GCACTTCGCGCCCCTTGGCGTCGATGATCGAACCGCATACTTGCG > NC_002947/2416449‑2416746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |