| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,501,098 | C→T | 6.6% | P138P (CCG→CCA) | PP_2194 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,501,098 | 0 | C | T | 6.6% | 173.4 / 3.1 | 61 | P138P (CCG→CCA) | PP_2194 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/21); new base T (2/2); total (38/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
CCGTACAGCACATGCCCCCTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGCCGTTGGC > NC_002947/2500952‑2501247 | ccGTACAGCACATGCCCCCTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGt < 1:1364654/150‑1 (MQ=255) gCACATGCCCCCTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCGGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTgc > 1:1325023/1‑149 (MQ=255) ccccTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCCGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTcc > 2:122797/1‑150 (MQ=255) ccccTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTcc < 2:481133/150‑1 (MQ=255) ccccTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTcc > 1:178637/1‑150 (MQ=255) cccTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCa < 1:571192/150‑1 (MQ=255) cccTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCa > 2:1174486/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTg < 2:1617314/134‑1 (MQ=255) ccTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTg > 1:1617314/1‑134 (MQ=255) tGCCGCAATACAGCCGCCGTCGTGCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTGCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGtt < 2:692233/150‑1 (MQ=255) cGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGcc > 2:655178/1‑149 (MQ=255) cGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCa < 1:1154078/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCCTGCCCCATCCGCTGTTCCAGCAACAGGCGTTGCATCTTCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTcc > 1:774061/1‑150 (MQ=255) aGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTcc > 2:490850/1‑150 (MQ=255) gTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGc > 2:762645/1‑150 (MQ=255) gaCAAGTGCCAGTAATCAAAGGGCGCCTGGTTGACGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGcc < 2:418372/149‑1 (MQ=255) aaCAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCAAATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGcc > 1:1116605/1‑150 (MQ=255) aCAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTACACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCg > 2:462688/1‑150 (MQ=255) tGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGgcc > 2:1318369/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCGAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGAc > 2:1061054/1‑95 (MQ=255) tCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGAc < 1:1061054/95‑1 (MQ=255) cAAAGGCCGCCTCGTTGCCGCAACAATAGCTGATCACATAGTCCCGCCGCTGTTCCAACACCAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCCCCGATTCCTCTCGCCTGCGCAATCCCGCCATGGCCGCGGCCa > 2:439880/1‑150 (MQ=255) aaaGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAg > 1:899926/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGc > 2:1462888/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGTGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCt > 1:803895/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGTGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCt > 1:804064/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCAc > 2:1076285/1‑150 (MQ=255) cGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGa < 2:65085/94‑1 (MQ=255) cGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGa > 1:65085/1‑94 (MQ=255) cGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGATCACGCACCGCCGCCACTGCACTGACAAGCTGCATGTCCACCGAGTCTTAGCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCt > 2:184364/1‑150 (MQ=255) cGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAAAAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCGATCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCt > 2:184402/1‑150 (MQ=255) gAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAgg > 2:458566/1‑138 (MQ=255) gAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAgg < 1:458566/138‑1 (MQ=255) aaaaTAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGTGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTc < 2:803895/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGTGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTc < 2:804064/150‑1 (MQ=255) aaaTAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTACACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTcc < 1:462688/150‑1 (MQ=255) tAGCTGATGGCATAGTCCCAGAGGTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACACGCTCCAGGTGCACCGATTTCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGa < 1:1318369/150‑1 (MQ=255) tAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGa < 1:122797/150‑1 (MQ=255) tGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCg > 1:248699/1‑150 (MQ=255) cATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCGGCCa > 2:600624/1‑150 (MQ=255) aGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCAGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGc < 1:1076285/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTAt < 2:159318/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTAt > 1:159318/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTAt > 1:212754/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGa > 1:1166599/1‑83 (MQ=255) gCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGa < 2:1166599/83‑1 (MQ=255) ccGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGtt > 2:980287/1‑59 (MQ=255) ccGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGtt < 1:980287/59‑1 (MQ=255) gCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCTTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGca > 1:415588/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGcac > 1:889579/1‑150 (MQ=255) tGTTCCAGCAACAGTCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGcaca < 2:706980/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGt < 1:1174486/150‑1 (MQ=255) aGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTcccc > 1:1078877/1‑150 (MQ=255) aaCAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCcagc > 1:1466409/1‑150 (MQ=255) aCAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCcagca > 1:982204/1‑150 (MQ=255) gCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAgcc > 2:1535063/1‑150 (MQ=255) cccAGCTCCGCCCCCTGAGCACCGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCGATGGCCGCCGCCAGTTTCAGACTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCg < 2:1116605/149‑1 (MQ=255) gCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCaa > 2:288365/1‑150 (MQ=255) cTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAAc > 1:285229/1‑150 (MQ=255) cgccgGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGcc > 1:1260541/1‑150 (MQ=255) ccgGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGCCGt < 1:1462888/150‑1 (MQ=255) ggcggTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGCCGTTg < 2:415588/150‑1 (MQ=255) ggcggTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGCCGTTg > 2:879792/1‑150 (MQ=255) gcggTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGCCGTTgg < 2:1078877/150‑1 (MQ=255) cggTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGCCGTTGGc < 2:774061/150‑1 (MQ=255) | CCGTACAGCACATGCCCCCTGCCGCAATACAGCCGCTGTCGTTCCGCGAACAAGGGCTGGTAATCAAAGGCCGCCTGGTTGCCGGAAAAATAGCTGATGGCATAGTCCAGCCGCTGTTCCAGCAACAGCCGTTCCAGCTCCGCCGGCGGTGCACTGACAAGCTCCAGTTGCACCGATTCCTCTCGCCTGCGAAATGCCGCAATGGCCGCCGCCAGTTTCAGGCTCACCGCCTTGTCCTGATTTTCCGCCATGCCTATGCGCACAGTCCCCAGCAGCCGCCCGGCAACGCCGTTGGC > NC_002947/2500952‑2501247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |