| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,064,165 | A→C | 5.9% | Q136P (CAG→CCG) | PP_2675 → | cytochrome c‑type protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,064,165 | 0 | A | C | 5.9% | 249.3 / 5.1 | 83 | Q136P (CAG→CCG) | PP_2675 | cytochrome c‑type protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/45); new base C (3/2); total (35/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
CCTGGAGGCCAAGTCCGGTGGTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGACGCGATCATCGC > NC_002947/3064016‑3064314 | ccTGGAGGCCAAGTCCGGTGGTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCa < 2:1151016/150‑1 (MQ=255)ccTGGAGGAAAAGTCCTGTGTTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCa > 2:887446/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCCAAGTCCGGTGGTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAgg < 2:852960/150‑1 (MQ=255) cAAGTCCGGTGGTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCt > 1:812174/1‑150 (MQ=255) cAAGTCCGGTGGTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGATCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCt > 1:838924/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGGTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTgg < 2:1305163/150‑1 (MQ=255) ggtggtATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCg < 1:740001/150‑1 (MQ=255) gtggtATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCGACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCGAGGAAGCCCTGTGGGCgg > 1:82083/1‑150 (MQ=255) tggtATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCggg > 2:116050/1‑149 (MQ=255) ggtATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGGGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTg < 2:707939/150‑1 (MQ=255) gtATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTgc < 1:1160276/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTgcgc < 1:703067/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCtg > 1:1117668/1‑135 (MQ=255) gcgcCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCtg < 2:1117668/135‑1 (MQ=255) tGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTAGTTTAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTGTCt > 1:1162536/1‑150 (MQ=255) gACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTg < 1:395959/150‑1 (MQ=255) tGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACa < 2:1155619/150‑1 (MQ=255) gcgcATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAg > 2:432442/1‑150 (MQ=255) cATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGt > 2:1382612/1‑150 (MQ=255) cATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGt < 1:432442/150‑1 (MQ=255) tGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGc < 2:1038443/150‑1 (MQ=255) gagcaTGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCAc < 2:1066706/146‑1 (MQ=255) cTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCt > 2:1611779/1‑116 (MQ=255) cTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCt < 1:1611779/116‑1 (MQ=255) cTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCa < 1:1631705/130‑1 (MQ=255) cTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCa > 2:1631705/1‑130 (MQ=255) cTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCAc < 2:345762/150‑1 (MQ=255) tCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACa > 1:34221/1‑141 (MQ=255) tCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACa < 2:34221/141‑1 (MQ=255) tCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACg > 1:141572/1‑150 (MQ=255) gATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTgg < 1:220470/117‑1 (MQ=255) gATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTgg > 2:220470/1‑117 (MQ=255) gATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGACACGGCGCGGTTCGCGACGGATGGGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTc < 1:1187774/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACCGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCga < 1:930400/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTTGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCgag < 1:19723/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCgag < 2:141572/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCgag < 1:887446/150‑1 (MQ=255) tGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTgcgc > 1:488645/1‑118 (MQ=255) tGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTgcgc < 2:488645/118‑1 (MQ=255) ccGACGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGCCCGCGTGGACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGc < 2:362054/150‑1 (MQ=255) ggCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCgg < 1:105903/106‑1 (MQ=255) ggCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCgg > 2:105903/1‑106 (MQ=255) gCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCAt < 2:89212/150‑1 (MQ=255) gATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGc < 1:269924/150‑1 (MQ=255) tGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCtgt > 2:733961/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCCGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTgg < 2:1212368/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCCGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTgg > 1:1212493/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCCGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTgg > 1:1212368/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCCGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTgg < 2:1212493/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCACGGCTGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTgg > 1:283108/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTgc > 2:1124032/1‑97 (MQ=255) ttCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTgc < 1:1124032/97‑1 (MQ=255) gtcgAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCgg < 2:812174/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTg > 2:1021589/1‑102 (MQ=255) gAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTg < 1:1021589/102‑1 (MQ=255) gggTACGCCAGCGCCCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGACGATTCCGTCAGCAGGGAAGCCCTGCACCCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGTGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGtt < 1:116050/150‑1 (MQ=255) gTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGa < 2:883718/150‑1 (MQ=255) ccACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGc < 2:838924/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGCTTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCctgctgctg < 1:163686/150‑1 (MQ=255) 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ggCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGt > 2:286125/1‑143 (MQ=255) ggCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGt < 1:286125/143‑1 (MQ=255) gCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCa < 2:321595/133‑1 (MQ=255) gCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCa > 1:321595/1‑133 (MQ=255) ccGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTa > 1:891650/1‑150 (MQ=255) cGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCAt > 2:350551/1‑77 (MQ=255) cGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCAt < 1:350551/77‑1 (MQ=255) gATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCAACTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATg > 1:835311/1‑150 (MQ=255) aTTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGa > 1:1431317/1‑150 (MQ=255) aTTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGa < 1:971205/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGccc > 2:207348/1‑122 (MQ=255) tCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGccc < 1:207348/122‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGACGCGat > 1:110251/1‑150 (MQ=255) tCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGACGCGat > 1:321199/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGACGCGatc < 1:399070/150‑1 (MQ=255) aGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGACGCGATCATCGc > 1:824208/1‑150 (MQ=255) | CCTGGAGGCCAAGTCCGGTGGTATCGCGCCTGACTTGCGCATGCTCGATGCGGGTGATGCCGGCGATGAATGGTTCGTCGAGCGGGTACGCCACGGCGCGGTTCGCGACGGCCGCGTGTACATGCCGAAGATGGCCGATTACCTCAGCCAGGAAGCCCTGTGGGCGGTGCGCACCTATCTGGACAGCGTGCACGTCGAGGAGTGACGGCCATGCGTCTGTGGGCGGTGCTGTTGAGTGGCCTGCTGCTGTGGTGCGCGGCGGCCCAGGCGCAGGTGCGCAACTATGACGCGATCATCGC > NC_002947/3064016‑3064314 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |