| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,422,549 | G→A | 5.2% | V222M (GTG→ATG) | PP_3038 → | TraC domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,422,549 | 0 | G | A | 5.2% | 233.6 / 2.3 | 76 | V222M (GTG→ATG) | PP_3038 | TraC domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/32); new base A (2/2); total (42/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 | |||||||||||
GGGGCGGGACAAGTCCTACTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGAATCCTGGTGA > NC_002947/3422401‑3422691 | ggggCGGGACAAGTCCTACTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGt < 1:736391/150‑1 (MQ=255) gggCGGGACAAGTCCTACTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTg < 2:260039/150‑1 (MQ=255) gACAAGTCCTACTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGGGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATc < 2:606278/150‑1 (MQ=255) gTCCTACTGGCCGCCTCGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCCCCCAGGCGGTGGCCATCGCCtt < 2:40303/150‑1 (MQ=255) tACTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGAt < 1:369405/150‑1 (MQ=255) tACTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGAt < 2:371076/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGc > 1:632817/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCtt > 2:275151/1‑143 (MQ=255) tGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCtt < 1:275151/143‑1 (MQ=255) gCCGCATGGCATGGCAAAGGACGGTGATTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGTCTGTGCTGGGGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCggg > 2:431261/1‑150 (MQ=255) ccAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCg > 1:241735/1‑134 (MQ=255) ccAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCg < 2:241735/134‑1 (MQ=255) tGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCaa < 2:632817/150‑1 (MQ=255) cTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCata > 1:1411043/1‑150 (MQ=255) tttCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCatat > 2:1192930/1‑150 (MQ=255) tCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGc < 2:236359/150‑1 (MQ=255) caTGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGTTCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGa > 1:784975/1‑150 (MQ=255) gATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACg > 2:948897/1‑150 (MQ=255) tggtggCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCtt > 1:393009/1‑150 (MQ=255) gCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTg > 2:786516/1‑150 (MQ=255) cATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTggt > 1:747756/1‑150 (MQ=255) cTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTggtcggt > 2:1511561/1‑150 (MQ=255) tGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTggtcggtc < 1:1511561/150‑1 (MQ=255) tGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTggtcggtc > 1:1355752/1‑150 (MQ=255) gCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCCCCGGGGCTAGCCCGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATACGTGAACGCTTCCATGGTCGGTcccc > 2:140814/1‑148 (MQ=255) caggTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatca > 2:730330/3‑150 (MQ=255) gTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatcatca < 2:747756/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGCTGGTGTGTGAGCGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATg < 2:784975/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCgg > 2:118863/1‑85 (MQ=255) ccTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCgg < 1:118863/85‑1 (MQ=255) ccTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAAc < 1:670502/121‑1 (MQ=255) ccTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAAc > 2:670502/1‑121 (MQ=255) ccTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGc > 2:731539/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCCCATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCca < 1:1252543/137‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCtt > 2:1464951/1‑123 (MQ=255) tgtgCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCtt < 1:1464951/123‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCca > 2:1252543/1‑137 (MQ=255) tgtgCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCcg > 2:709030/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCcg > 2:521817/1‑150 (MQ=255) tGGTGTGTGAGGGCTACGCCACTGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGTTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATg > 2:1440546/1‑150 (MQ=255) gtgtgtGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGc > 1:1116105/1‑74 (MQ=255) gtgtgtGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGc < 2:1116105/74‑1 (MQ=255) tgtgtgAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATgacg > 1:213643/1‑150 (MQ=255) gtgAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTccc < 2:316518/115‑1 (MQ=255) gtgAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTccc > 1:316518/1‑115 (MQ=255) tACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGAcc > 1:1537205/1‑150 (MQ=255) ccACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAAc > 2:586297/1‑65 (MQ=255) ccACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAAc < 1:586297/65‑1 (MQ=255) cACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTGCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCAACATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCg > 2:416480/1‑150 (MQ=255) cACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCg > 2:1159349/1‑150 (MQ=255) aCCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCt < 2:576712/49‑1 (MQ=255) aCCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCt > 1:576712/1‑49 (MQ=255) aCCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCgg > 1:156547/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGc < 1:521817/150‑1 (MQ=255) tAGGCTGCACATTGGGACCGCCCAGGCGGTGGCCATGGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGGTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGGTGACGAGTGGAAGACCAAGCGGCCGACggg > 2:774629/1‑150 (MQ=255) tAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACggg > 2:675170/1‑150 (MQ=255) acaTGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGAGGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCt < 2:393009/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCCGGCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGa < 1:140814/150‑1 (MQ=255) ggCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAATACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGaa < 1:1192930/150‑1 (MQ=255) cTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTg < 2:1031645/141‑1 (MQ=255) cTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTg > 1:1031645/1‑141 (MQ=255) taccAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGGCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTTGGTCCATCATCATATGCCGCGAGGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGAATCCTGGt < 1:1383805/148‑1 (MQ=255) tCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatcatc > 2:1133995/1‑90 (MQ=255) tCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatcatc > 2:1133306/1‑90 (MQ=255) tCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatcatc < 1:1133995/90‑1 (MQ=255) tCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatcatc < 1:1133306/90‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatcatca > 1:956483/1‑89 (MQ=255) ccAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCcatcatca < 2:956483/89‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCTACGGGCGAACCCTGGAATCCTGGTGa > 1:821212/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGAATCCTGGTGa < 1:1440546/150‑1 (MQ=255) aaGGCGATGGCCACCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGc > 2:1535076/2‑118 (MQ=255) aaGGCGATGGCCACCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGc > 2:1534500/2‑118 (MQ=255) aaGGCGATGGCCACCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGc < 1:1535076/117‑1 (MQ=255) aaGGCGATGGCCACCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGc < 1:1534500/117‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGAATCCTgg > 2:668047/1‑145 (MQ=255) aGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGAATCCTgg < 1:668047/145‑1 (MQ=255) gTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGcc > 2:462279/1‑116 (MQ=255) gTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGcc < 1:462279/116‑1 (MQ=255) | GGGGCGGGACAAGTCCTACTGGCCGCATGGCATGGCCAAGGATGGTGCTTTCCACATGATTGGTGGCCATCCTGAGCCCGGTGAGCCTGTGCTGGTGTGTGAGGGCTACGCCACCGGGGCTAGCCTGCACATGGCGACCTCCCAGGCGGTGGCCATCGCCTTCGATGCGGGCAACCTGATGGCGGTCGCCAAGCATATGCGTGAACGCTTCCCTGGTCGGTCCATCATCATATGCCGCGATGACGACTGGAAGACCAAGCGGCCGACGGGCGAACCCTGGAATCCTGGTGA > NC_002947/3422401‑3422691 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |