| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,931,935 | G→T | 7.1% | A529D (GCC→GAC) ‡ | PP_3466 ← | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,931,935 | 0 | G | T | 7.1% | 214.6 / 3.0 | 69 | A529D (GCC→GAC) ‡ | PP_3466 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/31); new base T (2/3); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.45e-01 | |||||||||||
TCGATGATGCCAACGCGCACGTCAGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCGTTGTTTCTGGCCCCCGGACAACTGCTGG > NC_002947/3931790‑3932084 | tCGATGATGCCAACGCGCACGTCAGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGaa < 1:993253/150‑1 (MQ=255) tgatgCCAACGCGCACGTCAGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCTCGTGCGGCCGGCGAACAGc > 2:1611336/1‑150 (MQ=255) cAACGCGCACGTCAGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTgg > 1:115458/1‑147 (MQ=255) cAACGCGCACGTCAGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTgg < 2:115458/147‑1 (MQ=255) gcgcACGTCAGTGCCCCTGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTCCCTACAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATgg < 1:251856/150‑1 (MQ=255) gcACGTCAGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGAGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCATCGACCAGCTGTTCgccggcc < 2:611616/150‑7 (MQ=255) aGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCa > 1:565517/1‑150 (MQ=255) cccATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTc > 2:21131/1‑150 (MQ=255) ccATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACtt < 2:1339094/148‑1 (MQ=255) ccATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACtt > 1:1339094/1‑148 (MQ=255) aTCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTg < 2:395373/150‑1 (MQ=255) aTCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTg < 1:21131/150‑1 (MQ=255) tCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGCGCGGCCATCGACCAGCTGTTCGCCGGCcgcacgc < 1:1123592/134‑5 (MQ=38) tCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGCGCGGCCATCGACCAGCTGTTCGCCGGCcgcacgc > 2:1123592/1‑130 (MQ=37) tCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGACGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTgg > 2:1549639/1‑150 (MQ=255) ctcctGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATTGCCGCGa < 2:881254/128‑1 (MQ=255) ctcctGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGa > 1:881254/1‑128 (MQ=255) ctcctGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTc > 1:272103/1‑150 (MQ=255) tcctGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACt < 1:183205/132‑1 (MQ=255) tcctGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACt > 2:183205/1‑132 (MQ=255) tcctGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCAATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCa < 1:464050/150‑1 (MQ=255) ctGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATc < 2:825320/150‑1 (MQ=255) cAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCCTCCatcgc < 2:565517/150‑5 (MQ=255) cAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGc > 1:960414/1‑150 (MQ=255) cAGTAACTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGc > 2:1180244/1‑150 (MQ=255) gTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCg > 1:267427/1‑150 (MQ=255) cttcgcgCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCg > 2:334666/7‑150 (MQ=255) tACCTGTAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGa > 1:1204148/1‑150 (MQ=255) cTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGt > 1:267040/1‑150 (MQ=255) tGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTg < 1:1046107/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGc < 2:264616/150‑1 (MQ=255) aaCTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGaa > 2:121232/1‑89 (MQ=255) aaCTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGaa < 1:121232/89‑1 (MQ=255) cTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTc < 1:334666/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCATCGACCAGCTg < 1:1225637/93‑1 (MQ=255) cTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCATCGACCAGCTg > 2:1225637/1‑93 (MQ=255) gCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTc < 1:1637324/150‑1 (MQ=255) gCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACCGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCa < 1:1611336/150‑1 (MQ=255) gtacAGCTGCAGGTCGGCATGGGCCCGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGAt < 2:267040/147‑1 (MQ=255) gCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCAc > 1:814605/1‑94 (MQ=255) gCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCAc < 2:814605/94‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGc < 2:960414/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCAc < 2:1451898/86‑1 (MQ=255) aGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCAc > 1:1451898/1‑86 (MQ=255) ggCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGACCGCGCTCACTTCCCGCCCTGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCaa > 1:115607/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGcc < 2:284446/115‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGcc > 1:284446/1‑115 (MQ=255) ggCCAGGGTCGAAGCCCGTTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCAt < 1:1518243/95‑1 (MQ=255) ggCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCAt > 2:1518243/1‑95 (MQ=255) gCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCa < 2:995756/150‑1 (MQ=255) cAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACg > 2:646258/1‑150 (MQ=255) aGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGa < 2:272103/150‑1 (MQ=255) gAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATg > 1:230187/1‑150 (MQ=255) aGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACt > 2:319400/1‑88 (MQ=255) aGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACt < 1:319400/88‑1 (MQ=255) cccGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGa > 2:568772/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGAt > 1:881823/1‑150 (MQ=255) cTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCgttgt < 1:1415400/150‑1 (MQ=255) tGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCgttgtt > 1:168676/1‑150 (MQ=255) tGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCgttgtt > 1:472761/1‑150 (MQ=255) gATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCGTTGttt > 2:570799/1‑150 (MQ=255) aTCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCt > 2:193364/1‑115 (MQ=255) aTCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCt < 1:193364/115‑1 (MQ=255) cAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCGTTGTTTCTg < 2:472761/150‑1 (MQ=255) ggATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCAGCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATgg < 2:947990/132‑1 (MQ=255) ggATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATgg > 1:947990/1‑132 (MQ=255) tGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCGTTGTTTCTGGcccc > 1:1371030/1‑150 (MQ=255) gTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGc > 1:1456976/1‑130 (MQ=255) gTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGc < 2:1456976/130‑1 (MQ=255) gccggcGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCCCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCGTTGTTTCTGGCCCCCGGACAActg < 1:1180244/150‑1 (MQ=255) cggcGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCgg < 2:604897/91‑1 (MQ=255) cggcGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCgg > 1:604897/1‑91 (MQ=255) gcGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCTATGCGTTGTTTCTGGCCCCCGGACAACTGCTgg < 1:1549639/150‑1 (MQ=255) | TCGATGATGCCAACGCGCACGTCAGTGCCCATGTTTGATCACCTCCTGCGCCAGTACCTGCAACTGGCCGTCATGCAGTTGCAGCTGCAGGTCGGCATCGGCCAGGGTCGAAGCCCGGTGGCTGATCAGGATGCGCGTGCGGCCGGCGAACAGCTGGTCGATGGCCGCGATCACTTCACGCTCGGTGGCCTCATCCACTGCCGAAGTGGCCTCGTCCAGCACCAGGATCGCCGGGGCCTGCAACACTGCACGAGCAATGGCGATGCGTTGTTTCTGGCCCCCGGACAACTGCTGG > NC_002947/3931790‑3932084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |